郭义东 作品数:19 被引量:89 H指数:4 供职机构: 成都大学 更多>> 发文基金: 国家科技基础条件平台建设计划 中央高校基本科研业务费专项资金 微生物药物技术创新与新药创制产学研联盟 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 化学工程 环境科学与工程 更多>>
小双孢菌的选择性分离、鉴定及抗菌活性研究 目的对不同地区根际土壤进行小双孢菌的选择性分离、鉴定及抗菌活性研究。方法:采用干热120℃,60min及1%氯胺-T溶液处理,在添加复合维生素的GA和HV培养基上选择性分离小双孢菌;通过16S rRNA序列比对与构建系统... 刘超兰 王希玮 郭义东 冯兴 褚以文关键词:抗菌活性 PKS NRPS 文献传递 弯孢马利亚霉SIIA-F12361产生的新代谢产物研究 2011年 目的对海洋生境来源菌株SIIA-F12361进行分类学鉴定以及次级代谢产物的化学研究。方法采用形态学与18S rDNA序列分析对菌株进行分类学鉴定。通过硅胶柱层析、LH-20分子筛层析和反相制备HPLC诸方法,对新化合物进行分离纯化,并根据高分辨质谱、紫外、红外光谱和核磁共振数据对化合物SIIA-C12361进行结构鉴定。结果鉴定菌株SIIA-F12361为弯孢马利亚霉,其产生的新次级代谢产物属于倍半萜烯内酯类化合物。结论弯孢马利亚霉SIIA-F12361产生一新倍半萜烯内酯化合物。 王辂 郭义东 褚以文关键词:倍半萜烯内酯 分离纯化 分光光度法测定藏药翼首草中总皂苷的含量 被引量:24 2002年 目的 测定不同产地及不同药用部位藏药翼首草中总皂苷的含量。方法 样品显色后通过分光光度法测定总皂苷的含量 ;样品预处理以无水乙醇 30ml、浓盐酸 3ml回流提取 2h。结果 显色后的样品比较稳定 ,测定方法简便、灵敏、准确。结论 总皂苷以西藏拉萨的翼首草为高 ;不同药用部位中根比叶高出约 10 %~ 2 0 %。 何正有 张艺 张旭 郭义东 李文军关键词:藏药 翼首草 分光光度法 总皂苷 熊果酸 湖泊放线菌SIIA-A16124的分类鉴定及基因组挖掘 被引量:1 2018年 目的对湖泊放线菌SIIA-A16124进行分类鉴定和基因组挖掘。方法采用多相分类法对菌株的形态学、生理生化、细胞壁化学组分、16S r RNA基因序列进行测定和分类鉴定,采用基因组挖掘分析生物合成基因簇,经发酵培养、抗菌活性检测及活性产物质谱分析,推测其活性产物的化合物结构类别。结果菌株SIIA-A16124的16S r RNA基因与菌株Actinokineospora inagensis NRRL B-24050T同源性最高为99%;菌株SIIA-A16124在ISP3培养基上中等产孢和水解淀粉的特性与模式菌株存在明显差异;鉴定菌株SIIA-A16124为动孢菌Actinokineospora sp.,具有羊毛硫肽生物合成基因簇,其活性次级代谢产物属于羊毛硫肽类抗生素。结论首次发现动孢菌属放线菌具有生物合成羊毛硫肽类抗生素的能力。 王希玮 刘超兰 郭义东 褚以文沱江流域水体抗生素残留对微生物多样性的影响及生态风险评估 被引量:3 2023年 为调查评估沱江流域水体中抗生素残留水平和生态风险,并探究抗生素对微生物群落结构和多样性的影响。以沱江流域6个国级/省级水环境质量监测点为采样点,分析水体抗生素浓度,评估环境风险,并研究残留抗生素与微生物群落结构之间的相关性。结果显示,沱江流域水体中抗生素检出浓度在0.71~177.98 ng/L,这可能与城市生活废水与养殖企业废水的排放有关,中下游区域抗生素的检出浓度远高于上游区域。6个监测点位中有4个处于高风险等级。高通量测序结果显示,Shannon指数、Simpson指数和Chao1等微生物多样性指数在中游最高,下游最低;变形菌门、拟杆菌门和放线菌门是水体中优势细菌种群,在SHM监测点中种群丰度占比高达92.72%。水体中部分抗生素种类与水体微生物种群分布相关性显著,微生物群落结构受残留抗生素影响。 向省维 巫明毫 张力 刘海鲨 陈雪珂 刘玲 郭义东 林家富 宋涛 郑德志 沙菁洲关键词:抗生素残留 微生物群落 多样性 PBL教学法在药物制剂设备实验教学中的应用探讨 2023年 实验教学在药学教学体系中具有重要作用,针对目前药物制剂设备实验教学现状及存在的问题,探索项目式学习法(problem-based learning,PBL)在该实验课程教学中的应用。以药学学生为主体,通过探究创新实验教学方法和技术,促进实验课堂从“灌输式”向“研讨式”转变,切实提升学生的动手能力、创新精神和科学素养,逐步形成具有药学学科特点、符合城市大学特色的药物制剂设备实验教学模式,为提升实验教学成效、服务学科建设和创新人才培养提供参考。 黎江华 郭义东 刘超兰 许丽佳 倪彩霞关键词:项目式学习 实验教学 教学方法 植物内生真菌Hansfordia sp.次生代谢产物研究 <正>近几十年来,植物内生真菌被认为是药物先导化合物的源泉,有大量真菌来源的天然产物被研究,同时植物内生真菌的次级代谢产物中大多数具有生物活性。特别是Hansfordia属的植物内生真菌研究成为关注焦点。从Hansfor... 林家富 于添池 李旭航 雷辉 刘超兰 郭义东 褚以文关键词:植物内生真菌 次生代谢产物 药物活性 文献传递 CDK抑制剂的研究进展 被引量:2 2015年 周期蛋白依赖性激酶是一类丝/苏氨酸激酶,是一种细胞内重要的信号转导分子。目前以细胞周期蛋白依赖性激酶为靶点的药物可以阻断细胞的周期,控制细胞的增殖,从而达到抗肿瘤的目的。文章简单的对几种与肿瘤相关的CDK抑制剂进行综述,对新的CDK抑制剂研发提供背景分析。 何兴 龚浩 李玲 郭义东关键词:CDK GABA产生菌分离鉴定及静止细胞转化条件优化 被引量:1 2014年 采用乳酸菌分离纯化方法,从传统四川泡菜中分离筛选得到3株γ-氨基丁酸(GABA)产生菌,其中转化能力最强的菌株L13-1经鉴定为短乳杆菌(Lactobacillus brevis)。L13-1菌株经液体培养后,离心获得静止细胞,并将此静止细胞均匀分散于含有转化底物谷氨酸钠(MSG)的转化缓冲液中,转化生产GABA。采用响应面法(RSM)优化转化条件。经优化,GABA产量达到95.1mM,较优化前提高了136%。本研究表明,利用转化能力强的乳酸菌株静止细胞转化生产GABA具有良好的应用前景。 雷祖超 田杰伟 王磊 邱鹏 田永强 覃湫棉 汤城岸 郭义东关键词:乳酸菌 生物转化 2株小双孢菌新种的全基因组测序分析与抗菌活性测定 2021年 【背景】抗生素的滥用导致了耐药病原菌的不断增加和扩散,成为威胁人们健康的一个重要因素,因此挖掘新型抗生素显得尤其重要。新的物种很有可能会产生新的生物活性物质,特别是那些常规分离方法很少分离到的稀有放线菌。【目的】对2株小双孢菌潜在新种进行全基因组测序分析与抗菌活性测定,从多层次分子水平鉴定其新种分类地位,并预测次级代谢基因簇,为发现产生新颖活性物质的药用放线菌资源奠定基础。【方法】通过16S rRNA基因序列分析初步确定菌株H10836和H11081的种属分类;采用Illumina平台对2个菌株进行全基因组测序和注释,基于此构建全基因组系统发育树、计算ANI (Average Nucleotide Identity)和dDDH (Digital DNA-DNA Hybridization)值,最终确定菌株的新种分类地位;基于全基因组注释结果进行COG (Clusters of Orthologous Genes)聚类、KEGG (Koyto Encyclopedia of Genes and Genomes)代谢通路和antiSMASH次级代谢基因簇预测分析;采用琼脂打孔法进行抗菌活性测定。【结果】菌株H10836和H11081与小双孢菌属8个种两两之间的ANI值范围分别为85.3%-92.1%和85.2%-92.1%,dDDH值范围分别为33.0%-44.5%和31.3%-44.5%。ANI和dDDH值均低于物种判断的临界值,而且2株菌在全基因组系统发育树上与小双孢菌属聚成一簇,但独立成一亚支,从分子水平上综合确定菌株H10836和H11081是小双孢菌属的2个潜在新种。antiSMASH分析发现该2株菌基因组中有多种次级代谢产物合成基因簇,而且与已知抗生素合成基因簇相似度较低。抗菌活性测定显示该2株菌代谢产物均有抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌活性。【结论】菌株H10836和H11081是具有抗菌活性的新菌种,因此值得挖掘其新颖活性天然产物,试验结果将为菌株的进一步研究和应用提供参考。 刘超兰 黎江华 郭义东关键词:全基因组测序