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郭书林: 作品数：27 被引量：114H指数：6; 供职机构：厦门出入境检验检疫局更多>>; 发文基金：国家质检总局科技计划项目国家质检公益性行业科研专项国家科技支撑计划更多>>; 相关领域：农业科学医药卫生轻工技术与工程生物学更多>>

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奥尔森派琴虫和北海派琴虫ITS基因测序及同源性分析: 2014年; 通过设计能扩增奥尔森派琴虫和北海派琴虫ITS序列的特异性引物,对我国东南沿海8个地区养殖牡蛎中常见的两种派琴虫相应基因进行扩增、克隆和测序,并进行同源性分析。国内不同地区奥尔森派琴虫ITS序列的同源性超过99.3%,与国外分离株的同源性也在98.8%以上;种间同源性分析发现,奥尔森派琴虫与海水派琴虫和P.honshuensis的同源性较高,分别为94.2%和95.0%,与P.qugwadi的同源性最低,仅62.9%。深圳和三亚分离的北海派琴虫ITS序列有18个碱基存在差异,其中ITS-1有3个碱基差异,ITS-2有15个碱基差异,而5.8S高度保守,没有碱基差异;北海派琴虫与其他种类之间的差异主要表现在ITS-1和ITS-2区域;同源性比较发现,北海派琴虫的同源性在100%-97.9%之间,其中深圳北海派琴虫的同源性较低,为97.9%。种间同源性分析表明,北海派琴虫与奥尔森派琴虫的同源性较高,为89.4%,其次为海水派琴虫和P.honshuensis,与P.qugwadi同源性最低,仅71.9%。; 郭书林陈垚陈信忠龚艳清杨俊萍; 关键词：ITS基因同源性分析

3种牡蛎原虫的流行情况调查及多重PCR检测方法被引量：3: 2012年; 应用聚合酶链式反应(PCR)方法对福建、广东和海南等地沿海的养殖牡蛎进行包拉米虫、派琴虫和单孢子虫检测.结果表明,这些地区的牡蛎均不同程度地感染这些原虫,经鉴定病原为牡蛎包拉米虫、奥尔森派琴虫和尼氏单孢子虫.根据基因库中奥尔森派琴虫和尼氏单孢子虫的基因序列设计多对特异性引物,检测包拉米虫的引物采用世界动物卫生组织推荐引物,通过对多重PCR反应条件的优化,建立可同时检测这3种原虫的多重PCR方法.运用该方法对样品中的牡蛎包拉米虫、奥尔森派琴虫和尼氏单孢子虫进行扩增,结果得到与试验设计相符的303、480和749 bp 3条特异性扩增条带,对其他贝类病原核酸的扩增均为阴性.多重PCR方法最低能检测到10 pg牡蛎包拉米虫、奥尔森派琴虫和尼氏单孢子虫DNA,表明该方法适用于这3种原虫的快速检测和鉴别诊断.; 陈垚陈信忠郭书林

基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱在李斯特菌检测和鉴定中的应用被引量：17: 2012年; 为建立食品中各种李斯特菌的快速检测和鉴定方法,应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)对单增李斯特菌、绵羊李斯特菌、英诺克李斯特菌、威尔斯李斯特菌和格氏李斯特菌5种李斯特菌进行检测,并与传统的生化鉴定方法(VITEK 2)和聚合酶链式反应(PCR)方法检测结果进行比较;用不同培养基和不同培养时间培养的单增李斯特菌对该方法进行检测,还对60份人工感染5种李斯特菌的食品样品分别进行MALDI-TOF-MS、PCR以及传统生化方法的检测和鉴定。结果表明:MALDI-TOF-MS能够快速、可靠地区分上述5种李斯特菌,而且具有很好的稳定性和重复性,在检测时间、重复性和准确性方面的总体表现优于传统生化鉴定方法。MALDI-TOF-MS技术适用于对李斯特菌等食源性病原菌进行高通量、低成本的快速鉴定。; 龚艳清陈信忠杨俊萍郭书林马群飞石椿丽; 关键词：基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱李斯特菌

MALDI-TOF-MS在病原微生物鉴定中的研究进展被引量：29: 2012年; 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)是鉴定多种致病性细菌的快速、可靠的方法,具有较好的稳定性和可重复性,在快速和准确性方面的总体表现明显好于传统的细菌生化鉴定方法。适合于一些致病菌的快速、高通量的检测和鉴定。综述MALDI-TOF-MS技术在普通病原菌、多血清型病原菌、非发酵性细菌,以及植物病原菌等病原微生物鉴定方面的最新研究进展。; 陈信忠龚艳清郭书林; 关键词：微生物

克伦特罗的CLIA分析试剂盒的研制: 2013年; 通过制备克伦特罗（Clenbuterol，CL）人工抗原获得高活性抗体，用辣根过氧化物酶（HRP）标记CL抗原，以鲁米诺（luminol）为发光底物，建立直接竞争法检测分析盐酸克伦特罗，并对包被液、包被条件、封闭蛋白、孵育时间、酶用量等参数进行优化，成功研制出化学发光法检测CL试剂盒。该方法的线性检测范围0.1~8.1 ng·mL-1，线性相关系数r=0.996，IC50值为0.607 ng·mL-1；理论检测限小于0.1 ng·mL-1；批内变异系数6.76%~8.31%；批间变异系数7.4%；回收率（90±15）%，与莱克多巴胺等其他β-激动剂不发生交叉反应。; 沈浩龙张长弓陈巧钦江良振庄晓勇黄江山郭书林黄印尧; 关键词：盐酸克伦特罗 CLIA 试剂盒

七彩神仙鱼和神仙鱼的DNA条形码研究被引量：1: 2016年; 应用通用引物测定了观赏鱼市场上具有较高价值的7个品系七彩神仙鱼和3个品系神仙鱼的16S r RNA基因和CO I基因部分序列,并应用DNA序列分析软件,对这些基因进行了同源性比较和系统发育分析。通过Gen Bank中的核酸BLAST和BOLD SYSTEMS数据库对这些基因序列进行比对,结果表明16S r RNA基因和CO I基因可以在物种水平对神仙鱼进行准确鉴定,但对七彩神仙鱼只能进行有限度的鉴别。由于不同品系的七彩神仙鱼或神仙鱼,尽管其体色和斑纹具有明显差异,但16S r RNA基因和CO I基因序列高度相似。因此,对这些观赏鱼依靠16S r RNA基因或CO I基因都无法准确鉴定,需要研究进化速度更快的DNA基因条码。; 陈信忠袁芳许奕宸郭书林龚艳清杨俊萍; 关键词：七彩神仙鱼神仙鱼物种鉴定 RNA CO

臭氧对斜带石斑鱼胚胎发育和初孵仔鱼的毒性效应被引量：3: 2014年; 为了评价臭氧消毒技术及其对石斑鱼(Epinephelus)潜在的毒性,首先评价了两种质量浓度(0.05 mg/L和0.30mg/L)臭氧对亚硝酸盐和弧菌的水处理效果,并以斜带石斑鱼(E.coioide)受精卵为实验材料,探讨臭氧对胚胎发育和初孵仔鱼的毒性作用。结果显示,臭氧的水处理效果良好,0.30 mg/L的臭氧在3 h内对水中亚硝酸盐的去除率可达72.29%;0.05 mg/L的臭氧处理20 min后也能完全杀灭弧菌。但高浓度臭氧(0.30 mg/L)对胚胎发育具有一定的毒性,会造成胚胎油球数目增多、萎缩、解体和死亡,而低浓度组(0.05 mg/L)臭氧处理后22 h胚胎孵化率高达(87.14±7.20)%,与对照组无显著差异。与胚胎相比,初孵仔鱼对臭氧更加敏感,0.05 mg/L的臭氧处理24 h也会导致初孵仔鱼的全部死亡。本研究结果旨在为石斑鱼育苗及养殖过程中正确使用臭氧消毒技术提供重要的数据参考和理论依据。; 郑锦滨钟声平张钰霆郭书林陈信忠毛勇苏永全王军; 关键词：斜带石斑鱼胚胎发育臭氧弧菌

16S rRNA和COI基因条形码在12种观赏鱼种类鉴定中的应用被引量：6: 2016年; 应用通用引物测定观赏鱼市场上价值较高的红尾金龙鱼、黄尾龙鱼、青龙鱼、珍珠龙鱼、银龙鱼、神仙鱼、非洲珠宝鱼、接吻鱼、珍珠毛足鲈、蓝钻石孔雀、孔雀鱼、锦鲤等12种观赏鱼的16SrRNA基因和COI基因部分序列。应用DNA序列分析软件,对这些基因进行同源性比较和系统发育分析。通过GenBank中的核酸BLAST和BOLD SYSTEMS数据库对这些基因序列进行比对,结果表明16SrRNA基因和COI基因可以在物种水平作为基因条码对亚洲龙鱼、珍珠龙鱼、银龙鱼和神仙鱼等观赏鱼进行准确的鉴别,而且应用COI基因构建的系统发育树比16SrRNA基因更加接近现有的鱼类分类体系。但对形态十分相似的慈鲷等观赏鱼,以及红尾金龙鱼、黄尾龙鱼、青龙鱼等同一个物种不同品系的观赏鱼依靠16SrRNA基因或COI基因都无法准确鉴定,需要研究进化速度更快的DNA基因条码。; 陈信忠郭书林龚艳清袁芳许奕宸杨俊萍; 关键词：观赏鱼物种鉴定 RRNA COI

基质辅助激光解析电离飞行时间质谱在动物病原菌检测中的应用被引量：7: 2012年; 应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术,对厦门口岸进口的1000多份动物及其产品的样品进行致病菌的检测和鉴定,共检出20多种致病菌,并对这些菌株同时用传统生化鉴定方法进行确认。结果表明MALDI-TOF-MS对未知细菌进行鉴定,较传统方法更加快速、准确,而且可以进行高通量检测,可以广泛应用于口岸动物检疫以及微生物检验实验室的日常检验。此外,将国内分离鉴定的各种参考菌株建立的常见致病菌MALDI-TOF-MS数据库与布鲁克公司的MALDI Biotyper数据库进行病原菌鉴定的比较,结果表明,实验室自建的MALDI-TOF-MS数据库可以取得更加准确地结果。; 龚艳清郭书林陈信忠杨俊萍马群飞叶妍妍; 关键词：基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱

一些国家对观赏鱼的进口检疫法规及要求: 2014年; 本文分析了欧盟、美国、日本等主要观赏鱼进口国的检疫法规及检疫要求,并对我国目前的观赏鱼检疫体系以及存在的问题进行了探讨,此文可为促进观赏鱼出口提供指导,也可为我国制定进口观赏鱼检疫法规和检疫要求提供了参考。; 陈信忠郭书林龚艳清张红梅段向英; 关键词：观赏鱼检疫法规检疫要求

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