隋立军
- 作品数:5 被引量:14H指数:2
- 供职机构:辽宁师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:辽宁省科学技术计划项目辽宁省海洋与渔业厅科研计划项目公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 紫贻贝EST-SNP的筛选及多态性检测被引量:9
- 2011年
- 利用EST数据库开发SNP是筛选SNP标记的重要途径。本研究利用EST数据库开发紫贻贝的SNP标记,利用QualitySNP软件对紫贻贝已有的19 709条EST序列中含有4条以上同源序列的重叠群进行分析,在含有4条以上同源序列的963个重叠群中,筛选得到候选SNP位点4 833个,SNP的平均频率为129.1 bp,其中C/T和A/G突变较多,分别占总数的28.8%和27.4%。根据候选SNP位点设计30组引物,通过等位基因特异性PCR结合溶解曲线分析,在30个野生个体中进行基因分型验证,6组引物(20%)没有扩增产物,10组引物(33%)没有多态性,14组(47%)引物具有二等位基因多态性,稀有等位基因的频率为0.083~0.446,观测杂合度和期望杂合度的范围分别为0.166 7~0.615 4和0.155 4~0.503 2。序列比对结果显示,14组引物中的12个SNP位点位于基因编码区,并且全部为同义突变。研究结果表明,EST数据库中存在大量的SNP位点,差异熔解曲线法是一种高效便捷的SNP分型方法,所筛选的SNP标记可用于紫贻贝遗传学分析。
- 李宏俊梁瑜邢坤苏浩高祥刚隋立军赫崇波
- 关键词:紫贻贝单核苷酸多态性表达序列标签熔解曲线
- 文蛤C1q基因的克隆与表达及其重组蛋白活性的研究被引量:5
- 2012年
- 利用构建的文蛤cDNA文库,克隆得到了文蛤C1q基因全长cDNA序列,该序列全长1213bp,5′UTR为316bp,3′UTR为372bp,开放阅读框长度为525bp,编码174个氨基酸。在文蛤C1q(MmC1q)蛋白中,C1q结构域与软体动物、两栖类动物和脊椎动物中的C1q结构域均具有较高的同源性。通过荧光实时定量PCR,MmC1q mRNA在所检测的各个组织中均有表达,在肝胰脏中表达量最高。在细菌感染试验中,文蛤受鳗弧菌感染后,C1q相对表达水平有明显的上升调节,注射2h,MmC1qmRNA表达量最高,为对照组的2.19倍。包含成熟肽的MmC1q cDNA片段被重组,并在大肠杆菌BL21(DE3)中表达,采用牛津杯法对MmC1q重组蛋白进行体外抑菌试验,但并未检测到明显的抑菌活性。
- 隋立军刘卫东李云峰高祥刚李宏俊赫崇波
- 关键词:荧光定量PCR重组蛋白
- 文蛤C1q基因的克隆与表达及重组蛋白活性的鉴定
- 李宏俊隋立军高祥刚赫崇波
- 关键词:文蛤荧光定量PCR重组蛋白抑菌活性
- 文蛤C1q基因的克隆与表达及其重组蛋白活性的研究
- 补体系统的经典途径是无脊椎动物免疫的第一道防线。Clq是经典补体途径的目标识别蛋白,对清除病原体和凋亡细胞至关重要。Clq能够通过它自身的异源三聚球状Clq结构域广泛地结合“自己”和“非己”的配体,引起经典途径。
...
- 隋立军
- 关键词:文蛤CDNA克隆免疫防御
- 文献传递
- 文蛤C1q基因的克隆与表达及重组蛋白活性的鉴定
- 补体C1q分子是补体系统经典途径的启动分子,是一个重要的固有免疫和获得性免疫之间的连接子。本研究利用已构建的文蛤全长cDNA文库,克隆得到了文蛤C1q基因(MmC1q)全长cDNA序列,该序列全长为1,213 bp,5’...
- 李宏俊隋立军高祥刚赫崇波
- 关键词:文蛤荧光定量PCR重组蛋白抑菌活性
- 文献传递