吕冰 作品数:103 被引量:526 H指数:13 供职机构: 北京市疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 国家自然科学基金 浙江省医药卫生科学研究基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 石油与天然气工程 更多>>
母亲对学前儿童膳食营养状况的影响--中国八省实例研究 吕冰关键词:儿童生长发育 临床诊断细菌性痢疾的病原学符合率及特征分析 被引量:3 2018年 目的分析临床诊断细菌性痢疾患者的病原学符合率,探究影响被正确诊断为确诊病例的流行病学及临床特征。方法2015年1月至2017年12月,在北京市每个区选择1~2家肠道门诊,分月采集急性腹泻患者便标本,筛选符合临床诊断细菌性痢疾标准的病例纳入研究,单变量Logistic回归分析确定影响正确诊断为细菌性痢疾确诊病例的流行病学特征和临床症状。结果 903例临床诊断细菌性痢疾病例纳入此次研究,共培养出志贺菌23例,实验室病原学确诊病例与临床诊断病例符合率为2.55%。控制月份和地区因素,不同年份病原学符合率差异有统计学意义(χ~2=15.576,P<0.001)。出现里急后重症状(OR=2.798,95%CI:1.127-6.943)和发热(OR=4.172,95%CI:1.793-9.705)的患者更易被正确的诊断为确诊病例。结论临床诊断细菌性痢疾患者的病原学符合率较低,建议结合患者是否出现里急后重及发热等临床症状综合诊断。 田祎 贾蕾 钱海坤 吕冰 曲梅 张新 黄瑛 王全意关键词:细菌性痢疾 病原学 符合率 北京市一起由宋内志贺菌引起的细菌性痢疾暴发病原学分析 被引量:5 2022年 目的对北京市一起由宋内志贺菌引起的暴发疫情进行流行病学调查以及病原学分析,为此类疫情处理提供参考。方法2019年9月5—20日,采集病例及厨师粪便/肛拭子样本,以及水样、外环境等标本进行病原分离鉴定,并将分离到的病原菌进行药物敏感性试验、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型、全基因组测序,利用全基因组数据分析病原菌的耐药、毒力相关基因,并进行多位点序列分型(MLST),构建全基因组单核苷酸多态性(wgSNP)分型树状图。结果共分离到16株宋内志贺菌和1株肠产毒性大肠埃希菌(ETEC),志贺菌均对氨苄西林、四环素、复方新诺明、头孢唑啉、头孢噻肟、庆大霉素、萘啶酸、阿奇霉素、多西环素耐药,且均为产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)菌株。均为ST152型,是国内常见型别。其中1株宋内志贺菌全基因组中存在insA插入序列,而在其他志贺菌全基因组中未发现,与其同时分离到的ETEC全基因组中发现有该插入序列。结论本次疫情是由多耐药宋内志贺菌引起。在病原溯源研究中,全基因组数据分析是PFGE分型的必要补充。 吕冰 田祎 杨艳娜 甄博珺 贾蕾 林长缨 张新 黄瑛 曲梅关键词:宋内志贺菌 全基因组 脉冲场凝胶电泳 中国结核分枝杆菌/艾滋病病毒双重感染率分析 被引量:20 2013年 目的了解国内文献报道的结核分枝杆菌(MTB)和艾滋病病毒(HIV)双重感染率。方法系统检索PubMed、中国期刊全文数据库(CNKI)、万方数据资源系统和维普中文科技期刊全文数据库中2000—2012年有关MTB/HIV双重感染率的研究文献,摘录有关信息,采用广义倒方差模型估计双重感染率,并对性别、样本来源和地区进行亚组分析,使用观察性研究质量评价准则STROBE声明评价文献质量,利用敏感性分析评价研究质量对结果的影响。结果共纳入39篇文献,总样本量为168286人,利用广义倒方差模型估计结核病患者中HIV双重感染率为0.86%(95%C1:0.80%~0.93%)。亚组分析显示,MTB/HIV双重感染率男性(1.53%)高于女性(0.54%),艾滋病病毒感染者和艾滋病患者(H/V/AIDS)高发地区(0.91%)高于低发地区(0.71%),差异均有统计学意义。HIV/AIDS中结核双重感染率为14.44%(95%CI:13.62%~15.30%)。亚组分析显示,MTB/HIV双重感染率医院来源(28.64%)高于社会人群(4.74%),西部(15.79%)高于中部(13.88%)及东部地区(6.47%),差异均有统计学意义。敏感性分析中在删除了符合条目数少的文献后,Meta分析的结果与原结果接近。结论中国MTB/HIV双重感染率较高。 刘姣 吕冰 颜艳关键词:结核分枝杆菌 艾滋病病毒 META分析 结核分枝杆菌分子分型技术研究进展 被引量:5 2010年 吕冰 高守一 万康林关键词:结核分枝杆菌感染 分子分型技术 分子流行病学 全基因组序列 H37RV 甘肃省临床分离结核分枝杆菌MLVA分型初步研究 被引量:10 2010年 目的随机选取2005-2007年间甘肃省肺科医院临床分离结核分枝杆菌菌株,通过多位点可变数目串联重复序列(Multiple locus variable numbers of tandemrepeats analysis,MLVA)分型,了解甘肃结核分枝杆菌流行菌株基因型情况。方法选择标化的15个VNTR位点,对临床分离菌株DNA进行检测,DNA指纹图谱使用Bio Numerics4.5软件进行统计分析,得出聚类分析结果。结果 228株结核分枝杆菌被分为4大基因群,7个大基因类型,分别包含13(5.7%)、3(1.3%)、7(3.1%)、1(0.4%)、171(75%)、31(13.6%)、2(0.9%)个株菌;在株水平基因分型上,93(40.8%)株为单菌株基因型;其余菌株基因型分别包含2-10株结核分枝杆菌,共构成132个基因簇。结论甘肃结核分枝杆菌菌株存在丰富的基因多态性,ML-VA方法具有较高的基因分型能力,可以满足结核分枝杆菌株水平DNA分型的需要。甘肃省结核分枝杆菌流行株主要为北京家族基因型菌株。 同重湘 赵秀芹 马建军 刘志广 曹文静 杨永红 吕冰 姜元 万康林关键词:结核分枝杆菌 基因分型 北京市2008-2017年细菌性痢疾病原学监测分析 被引量:11 2019年 目的分析2008-2017年北京市细菌性痢疾(菌痢)病原学监测资料,为菌痢防治提供参考。方法分析2008-2017年北京市两个菌痢国家级监测点数据,以标本检出志贺菌为菌痢诊断的金标准,描述志贺菌的阳性率、菌痢的诊断符合率及耐药情况,率的比较采用χ2检验,应用非条件logistic回归分析志贺菌阳性的相关因素。结果 2008-2017年,北京市菌痢报告发病率和腹泻患者的志贺菌阳性率均明显下降,菌痢的临床诊断符合率为7.80%(111/1 423)。北京市菌痢的病原以宋内志贺菌为主,占73.95%(159/215),其他均为福氏志贺菌。采用非条件logistic回归分析志贺菌阳性的相关因素,便常规阳性(与阴性相比,OR=1.863,95%CI:1.402~2.475)、7-10月发病(与其他月份比较,OR=7.271,95%CI:4.514~11.709)、体温≥38 ℃(与体温<38 ℃比较,OR=4.516,95%CI:3.369~6.053)和6~59岁(与其他年龄比较,OR=1.617,95%CI:1.085~2.410)的志贺菌阳性率更高。氨苄西林(97.57%,201/206)和萘啶酸(94.90%,186/196)的耐药率最高,环丙沙星(16.33%,32/196)、氧氟沙星(9.57%,11/115)及阿莫西林(15.05%,31/206)耐药率较低;福氏志贺菌的耐药情况较宋内志贺菌更为严重;耐药≥3种抗菌素的比例为30.00%(21/70)。结论北京市菌痢临床诊断符合率低,耐药情况较严重,临床医生做出诊断时应综合考虑腹泻患者的流行病学史、临床表现以及实验室检测结果。 贾蕾 吕冰 田祎 张新 刘重程 彭华 李洪军 甄博珺 王小莉 黄瑛 曲梅 王全意关键词:细菌性痢疾 诊断符合率 耐药 全基因组测序分析北京地区人源结肠弯曲菌基因组特征和耐药性 被引量:1 2023年 目的 了解北京地区人源结肠弯曲菌的耐药特征、毒力特征及多位点序列分型等遗传进化关系。方法 对2019-2021年北京市肠道门诊腹泻病例中分离到的36株结肠弯曲菌,采用琼脂稀释法进行抗生素敏感性检测;基于全基因组测序结果分析其耐药基因、毒力基因、多位点序列分型及全基因组单核苷酸多态性(whole genome single nucleotide polymorphisms, wgSNPs)遗传进化分析。结果 36株结肠弯曲菌对萘啶酸和四环素的耐药率为100.0%,对环丙沙星的耐药率为97.2%,对红霉素和阿奇霉素的耐药率为38.9%;36株菌均为多重耐药株,有10种耐药模式。基于全基因组测序结果,36株结肠弯曲菌分为21种ST型,优势克隆群为CC828;携带大环内脂类、喹诺酮类、氨基糖苷类、酰胺醇类、四环素类等多种类型耐药基因;携带6类38种毒力基因。wgSNPs遗传进化分析显示克隆群CC1150与优势克隆群CC828相距较远,处于独立的分枝,CC828克隆群内菌株聚集成3簇,呈现多样性分布。结论 北京市人源结肠弯曲菌分离株耐药严重,多重耐药谱广泛;耐药基因与耐药表型有一定的关联;克隆复合体以CC828为主,具有较高的遗传多样性。 张代涛 张新 黄瑛 吕冰 田祎 林长缨 王宇 曲梅关键词:全基因组测序 耐药性 2010-2019年北京市副溶血性弧菌临床分离株血清型和耐药性分析 被引量:10 2020年 目的了解副溶血性弧菌(vibrio parahaemolyticus,VP)感染在北京市的流行趋势、血清群分布和耐药情况,为预防和治疗副溶血性弧菌感染性腹泻提供理论依据。方法回顾性分析北京市2010-2019年肠道门诊腹泻患者中分离的副溶血性弧菌;采用玻片凝集法进行血清型检测;纸片扩散法(KB)或最小抑菌浓度(MIC)法进行抗生素的药敏试验。结果2010-2019年从46249份临床样本中共检出1853株副溶血性弧菌,检出率4.0%。20~39岁青壮年感染率最高,为6.1%。共分出9个O血清群,59种血清型。其中O3∶K6血清型共检出1254株(67.7%),是引起腹泻的最主要血清型。前2~10位血清型依次为O4∶KUT、O4∶K8、O1∶KUT、O2∶K3、O4∶K9、O3∶KUT、O10∶K60、O1∶K36和O4∶K6。随着年代的推移,会出现血清型的交替变迁及新血清型的不断涌现。菌株对氨苄西林和多粘菌素E的耐药率最高,分别为51.5%和47.8%;对头孢唑林和链霉素也存在一定程度耐药,耐药率为22.9%和10.5%;对头孢菌素、氯霉素及其他各类抗生素均有少量菌株耐药;对环丙沙星、左氧氟沙星和美洛培南无耐药。伴随着对抗生素敏感率的逐渐降低,耐药率总体呈现逐渐增高趋势,且有多重耐药菌株和ESBLs菌株。结论北京市腹泻人群副溶血性弧菌十年间血清型构成在不断演变,对常用抗菌药物耐药率呈逐年增长趋势,需要加强对血清型和耐药性的持续系统监测及重点人群的监督管理。 曲梅 田祎 黄瑛 刘白薇 张新 吕冰 贾蕾 王全意关键词:血清型 耐药 副溶血性弧菌 腹泻 中国部分地区159株结核分枝杆菌临床分离株MLVA-19分型分析 被引量:1 2009年 目的初步了解中国部分地区结核分枝杆菌临床分离菌株数目可变串联重复序列(variable number of tandem repeats,VNTRs)基因多态性特征。方法采用多位点VNTRs分析(multiple loci VNTRS analysis,MLVA)技术,随机选取159株中国部分地区结核分枝杆菌临床分离菌株,PCR和琼脂糖凝胶电泳技术,对结核分枝杆菌的19个VNTRs位点进行检测,用BioNumerics(Version 5.0)软件进行结果分析,数据结果与国际MLVA数据库(http://minisatellites.u-psud.fr)比对,初步分析结核分枝杆菌DNA多态性特征。结果159株菌株大致被分成4个主要的簇,其中73.8%的菌株为北京家族菌株,其次为H37Rv相似菌株及在数据库中没有比对结果的一簇,这一簇的MLVA特点是ETRD>3,MIRU10、MIRU27、MIRU39、MIRU40及Mtub21位点结果为22221,与其他簇的菌株结果有比较明显的区别。可能是中国特有的菌株。另外发现与BCG相似的一簇。结论本次研究中的中国结核分枝杆菌具有明显的VNTR基因多态性,主要流行菌株为北京家族菌株,可能存在中国特异的VNTR基因型。BCG临床分离株的发现,提示BCG疫苗相关病例可能成为值得关注的卫生问题。 吕冰 刘梅 李兆娜 刘志广 赵秀芹 万康林关键词:结核分枝杆菌 卡介苗