杨宏亮
- 作品数：31 被引量：32H指数：3
- 供职机构：上海交通大学医学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划上海市教育委员会重点学科基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- LA0301为一新的定位于钩端螺旋体外膜的蛋白被引量：1
- 2008年
- 目的研究LA0301在钩端螺旋体中的膜定位。方法运用Triton X-114抽提分离钩端螺旋体膜蛋白,以LA0301抗体为一抗进行Western blot。结果Western blot表明,LA0301位于有机相。结论LA0301为定位钩端螺旋体外膜的蛋白,这为开发研究LA0301为钩端螺旋体疫苗候选基因打下了基础。
- 赖卫强赵蔚陈春燕杨宏亮林玮肖家祁郭晓奎秦金红
- 关键词：钩端螺旋体
- 问号钩体Ⅱ型分泌系统相关基因特征分析
- 2004年
- 目的 分析问号钩体Ⅱ型分泌系统相关基因特征。方法 根据问号钩体黄疸出血群赖型赖株全基因组数据库 ,应用BLAST ,Tmpred ,Pfam等软件分析问号钩体Ⅱ型分泌系统的基因组成和编码蛋白的结构特征 ,并比较问号钩体与铜绿假单胞菌和大肠埃希菌K12Ⅱ型分泌系统组成蛋白的同源性。结果 问号钩体中与Ⅱ型分泌系统相关的蛋白有 11个 ,其中 6个为一般分泌途径蛋白 ,5个为Sec分泌途径蛋白 ,问号钩体中可能存在Ⅱ型分泌系统 ,但一些辅助蛋白未发现 ,需要进一步研究。结论 初步预测了问号钩体中Ⅱ型分泌系统的作用模式 。
- 顾艳杨宏亮李文俊姜叙诚郭晓奎
- 关键词：钩端螺旋体基因致病机制
- 钩端螺旋体在豚鼠组织中的动态分布和钩体病的病理改变被引量：1
- 2005年
- 杨宏亮姜叙诚朱平李文俊傅爱芬赵伶兹郭晓奎赵国屏
- 关键词：问号钩端螺旋体病理改变钩体病鼠组织透射电镜观察
- 问号钩端螺旋体胶原酶结构和功能分析被引量：6
- 2004年
- 目的：研究问号钩端螺旋体(简称问号钩体)致病机理，预测问号钩体胶原酶结构和功能，为进一步实验验证提供线索。方法：利用各种公共核酸及蛋白数据库资源，运用多种生物学软件对钩体胶原酶基因及其编码产物的结构和功能深入分析。结果：对问号钩体胶原酶进行了结构域归类；对其基因、蛋白的一般特性，蛋白一级结构，二级结构和超二级结构等作了对比性分析；对其序列中的部分片段：进行三维结构模拟；并绘制了其分子进化树，分析其垂直进化关系。结论：问号钩体胶原酶和其它多：种致病性微生物胶原酶具有不同层次、程度不等的相似性。它属于锌蛋白酶超家族和M9-蛋白酶家族。它可能在钩体浸润宿主并造成宿主多脏器出血等方面起重要作用。
- 李文俊余慧峰杨宏亮姜叙诚郭晓奎
- 关键词：问号钩端螺旋体胶原酶生物信息学核酸序列
- 问号钩体鞭毛蛋白相关基因分析被引量：2
- 2004年
- 目的 分析问号钩体黄疸出血群赖型赖株鞭毛蛋白相关基因 ,为进一步实验研究提供信息和线索。方法 使用在线数据库和分析软件NCBI/Blast ,ProDom/Blast等对问号钩体全基因组ORF基因进行诠释 ,对编码蛋白进行在线分析 ,并将问号钩体的鞭毛蛋白基因与E .coliK - 12、伯氏疏螺旋体 (BBU)和苍白密螺旋体 (TPA)的鞭毛蛋白基因进行了比较。结果 确定了问号钩体黄疸出血群赖型赖株染色体上约 5 5个与鞭毛相关蛋白的基因 ,同其他 3个细菌的鞭毛相关基因进行比较分析 ,推测出了钩体鞭毛结构模型图及其装配过程。结论 通过比较 ,不同螺旋体的内生鞭毛形成机制存在差别 ,但是FlgF蛋白缺失可能是其一个共同机制 ;尽管为内生鞭毛 ,问号钩体鞭毛在结构组成和鞭毛装配过程上却与E .coli相似 ;问号钩体的钩形成调控和鞭毛丝结构与E .coli不同 ;在鞭毛形成过程中的转录调控机制也存在差异。
- 张芳李文俊杨宏亮何平郭晓奎姜叙诚
- 关键词：鞭毛生物信息学
- 钩端螺旋体LA_1100蛋白膜定位研究
- 2012年
- 目的研究LA_1100蛋白在钩端螺旋体中的膜定位并分析其在中国流行血清群中的保守性。方法利用生物信息学软件对LA_1100的二级及三级结构进行分析,以Triton X-114抽提分离钩体细胞的各个组分,Westernblot及FACS方法验证LA_1100在钩端螺旋体中的膜定位。Western Blot和PCR在蛋白水平及核酸水平检测了其在13个中国流行血清群代表株中的保守性。结果 LA_1100的二级结构显示具有α-螺旋及β-折叠结构,进一步分析表明,此蛋白具有跨膜区。LA_1100单体结构具有典型的TolC结构域,三级结构模拟显示三聚体可形成孔状结构。膜定位显示,该蛋白定位于外膜。该基因的保守性分析结果表明,在中国13个流行代表株中有12株均检出该基因或该蛋白的特征性条带。结论 LA_1100为具有TolC结构域可以形成孔状结构的钩端螺旋体外膜蛋白,在中国流行株钩端螺旋体中保守。由于TolC蛋白与病原菌分泌致病因子密切相关,推测此蛋白可能与钩体感染宿主时粘附及致病相关,进一步对此蛋白进行研究有利于揭示钩体的致病机制。
- 赵蔚陈春燕杨宏亮胡宝瑜郭晓奎秦金红
- 关键词：钩端螺旋体外膜蛋白
- 问号钩体粘附侵袭相关基因特征分析被引量：2
- 2004年
- 使用NCBI ,Swissprot/TrEMBL ,ProDom ,Pfam ,Tmpred ,SignalP ,ClustW等网络资源和软件 ,根据问号钩体黄疸出血型赖株粘附侵袭相关基因诠释结果 ,对mce ,invA ,mviN和atsE四个粘附侵袭相关基因编码蛋白的结构域、跨膜区域和信号肽等进行了详细分析 ,并使用Bioedit,Mega2软件进行氨基酸多重序列比较并绘制系统发生树。结果显示 ,mce和mviN为穿膜蛋白 ,invA和atsE为菌体内蛋白质 ;许多对哺乳动物和对植物致病的微生物具有mce ,invA ,mviN和atsE四个粘附侵袭相关基因 ,其表达的蛋白质在感染宿主过程中起重要作用 ,钩体的粘附侵袭相关蛋白与它们在一级结构上有较高相似性。据生物信息学结果推测 ,问号钩体黄疸出血型赖株粘附侵袭相关基因和钩体致病性间有密切关系 。
- 杨宏亮李文俊姜叙诚郭晓奎
- 关键词：钩端螺旋体粘附生物信息学
- 问号钩体趋化相关基因特征分析被引量：1
- 2005年
- 目的预测问号钩体黄疸出血群赖型赖株的趋化信号传导途径,并深入分析趋化相关基因。方法使用ProtParamtool,NCBI/Blastp进行蛋白参数分析和结构域分析,使用Clustalw软件进行多序列对比,与大肠埃希菌K-12趋化相关基因进行比较。结果问号钩体趋化相关基因共30个,分为MCPs和che两组基因,功能与大肠埃希菌趋化相关基因相似,并预测出问号钩体趋化信号传导途径。结论问号钩体趋化相关基因较大肠埃希菌、苍白密螺旋体和伯氏疏螺旋体多,提示其趋化传导途径更为复杂,适应宿主的能力也更强,可能是钩体的重要毒力因子之一。
- 霍丽杨宏亮李文俊李振红郭晓奎姜叙诚
- 关键词：钩端螺旋体趋化性信号传导途径生物信息学
- 钩端螺旋体外膜蛋白研究进展被引量：2
- 2003年
- 钩端螺旋体外膜蛋白在钩端螺旋体病的致病和免疫应答过程中起着十分重要的作用,也是未来新一代疫苗开发的主要候选者。本文主要对钩端螺旋体外膜蛋白的基因结构、在感染动物中的表达状态、致病机制、在免疫保护中的特性以及在血清诊断中的应用等进行综述。
- 杨宏亮姜叙诚郭晓奎
- 关键词：钩端螺旋体外膜蛋白致病机制疫苗钩端螺旋体病
- SARS的病理学研究现状被引量：1
- 2003年
- 李文俊杨宏亮张占卿姜叙诚
- 关键词：SARS病理学严重急性呼吸综合征病因学冠状病毒
