杨鋆
- 作品数:3 被引量:6H指数:2
- 供职机构:首都医科大学附属复兴医院更多>>
- 发文基金:北京市教委科技计划面上项目北京市教育委员会科技发展计划面上项目更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 结直肠癌肝转移特定基因miRNA芯片甄别被引量:3
- 2013年
- 目的:筛选结直肠癌(colorectal cancer,CRC)肝转移miRNA对应的特定基因。方法:收集10例CRC患者肿瘤组织标本,其中同时伴肝转移者5例,无远处器官转移5例。应用miRNA芯片方法对两组样本的miRNA表达差异情况进行研究,并通过实时定量RT-PCR对miRNA的芯片表达差异进行验证,再利用软件预测靶基因。结果:总RNA提取的质量分析显示,每份样品总RNA的A260/A280为2.11~2.15。电泳结果显示,每份样品的总RNA均有清晰的28S和18S条带,RNA完好无降解,质量符合miRNA芯片的质量要求。肝转移组较非转移组筛选出6种CRC表达失调的miRNA,其中上调的为miR-224、miR-1236和miR-622,下调的为miR-155、miR-342-5p和miR-363,miR-224的差异信号值最高(>500)。芯片实验显示,hsa-miR-224在肝转移组呈现显著性上调,P=0.038 2;而hsa-miR-155在肝转移组却呈现显著性下调,P=0.043 2。miR-224的表达倍数在肝转移CRC组织中较非转移组表达上调(Fold change=2.47),P=0.016 6。结论:可调控CRC肝转移的特定基因miR-224的筛选,可作为早期诊断治疗的新手段。
- 骆成玉杨鋆季晓昕于德明赵兴飞
- 关键词:微小RNA结直肠肿瘤肝转移
- 结直肠癌肝转移相关靶基因转录调控网络的构建及基因本体论功能富集分析被引量:2
- 2013年
- 目的研究结直肠癌肝脏转移微小RNA(miRNA)表达的差异及相关特性,并对结直肠癌肝脏转移miRNA对应的靶基因和生物信息学特征进行针对性分析。方法收集10例伴有或不伴有肝转移的结直肠癌患者肿瘤组织标本。应用miRNA芯片方法对两组样本的miRNA表达差异情况进行研究,利用软件预测靶基因。进一步构建和分析肝转移结直肠癌相关的miRNA—Target转录调控网络及基因本体论功能模块。结果芯片结果筛选出6种结直肠癌肝转移组较非转移组表达失调的miRNA(上调的miR一224、miR一1236和miR-622;下调的miR一155、miR一342—5p、miR一363)功能团,行使相应功能。结论miR一224作为调控网络。最显著上调的miR-224不但可以与其对应靶基因行使调控作用,而且可以与其他miRNA协同作用于其下游的靶基因的核心,可同时或异时性调控相关的重要基因功能团,进而完成对结直肠癌肝脏转移的转录后水平操控,在肝转移过程中起重要作用。
- 骆成玉杨鋆于德明季晓昕赵新飞
- 关键词:结直肠肿瘤微RNAS基因调控网络
- 结直肠癌肝脏转移相关微小RNA224的研究被引量:1
- 2013年
- 目的研究结直肠癌肝脏转移微小RNA(microRNA,miRNA)表达的差异以及相关特性。方法收集2009年4月至2010年11月期间首都医科大学附属复兴医院的10例伴或不伴肝脏转移的结直肠癌患者的肿瘤组织标本,应用miRNA芯片方法对2组样本的miRNA表达差异情况进行研究,并通过实时定量PCR对miRNA的芯片表达差异进行验证。结果芯片结果筛选出6种结直肠癌肝脏转移组较非转移组表达失调的miRNA(上调的miR-224、miR-1236和miR-622,下调的miR-155、miR-342-5p和miR-363),选取显著上调(即差异信号值大于500)的miR-224进行实时定量PCR验证,结果与芯片实验结果相一致。结论 miR-224可能通过调节其靶基因而在结直肠癌肝脏转移中起重要作用,miR-224可能成为未来结直肠癌生物标记或治疗方法的一个研究方向。
- 季晓昕杨鋆于德明骆成玉
- 关键词:结直肠癌肝脏转移基因芯片技术