- 基于模板DNA的PCR扩增难易预测
- 随着人类基因组计划和人类基因组测序任务的相继完成或全面实施,生物序列和结构数据急剧增加,人类进入了后基因组时代。这就意味着人类基因组的研究将全面进入信息提取和数据分析的阶段。在对生物序列进行信息提取和分析的过程中,经常需...
- 范秀静
- 关键词:生物信息学DNA序列
- 文献传递
- 基于BWT的DNA序列数值刻画及其应用
- 2011年
- 生物序列的数值刻画在对生物学数据进行分析方面有着重要的作用。通过对DNA序列的BWT序列进行分块处理,给出了DNA序列的一种7维向量表示,利用correlation函数计算序列之间的相似性,并把这种方法应用到15个物种的β球蛋白基因及12个汉坦病毒的相似性分析中。
- 吴琼范秀静李春
- 关键词:DNA序列
- 一种基于模板DNA的PCR扩增难易预测方法
- 2012年
- 借助赋予四种碱基A,G,C,T四个三维空间中的点(0,0,1),(0,1,0),(-1,-1,0),(1,0,0),将一条DNA序列转化为一个二十四维向量。在此基础上利用Fisher线性判别法对人类基因组中189条基因片段进行PCR扩增难易预测,识别率达到了90%。
- 范秀静李楠李春