孙小娟
- 作品数：6 被引量：38H指数：2
- 供职机构：深圳市第二人民医院更多>>
- 发文基金：国家教育部博士点基金国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 生物样本库的建设与发展
- 蔡志明孙小娟
- 温度和光周期对水稻抽穗期调控的交互作用被引量：31
- 2012年
- 光周期和温度是植物开花的2个关键的调控因素,植物成花转变决定于植物对光周期和温度变化的精确测量.作为短日照植物,水稻在长日低温条件下抽穗期推迟,为了阐明温度和光周期对水稻开花时间的调控效应,本文利用1个光周期不敏感的突变体及其野生型,系统地分析了不同温度和光周期处理条件下,调控水稻开花时间几个关键基因（Hd3a,RFT1,Ehd1,Ghd7,RID1/Ehd2/OsId1,Se5）的表达调控模式,结果表明Ehd1-Hd3a/RFT1通路在光周期和温度调控水稻开花途径中保守.Ehd1,Hd3a和RFT1的表达在低温（23℃）条件下急剧下降,表明Ehd1,Hd3a和RFT1表达阻抑是低温条件下水稻开花推迟的主要原因.另外,在长日照条件下,低温（23℃）处理促进了水稻开花抑制子Ghd7的表达,表明低温条件和长日照条件对Ghd7的表达具有协同作用.此外,本文还分析了Hd1与光周期开花调控途径中几个关键基因的调控关系,发现Hd1在长日照条件下负向调控Ehd1的表达而正向调控Ghd7的表达,表明在长日照条件下,Hd1-Ghd7-Ehd1-RFT1通路也是水稻抽穗期调控的一条重要途径.
- 崔志文夏烨孙小娟蔡志明
- 关键词：水稻光周期温度
- 膀胱癌细胞染色质重塑异常与基因组不稳定性研究进展被引量：3
- 2013年
- 膀胱癌是泌尿系统最常见的恶性肿瘤之一。在我国，其发病率和死亡率均居泌尿系统肿瘤首位。近十多年来，我国膀胱癌的发病呈现出逐年上升和年轻化的趋势。许多患者就诊时已属中晚期，术后复发率高，对放疗及化疗敏感性差，生存期短，导致治疗效果不佳的主要原因是膀胱癌的发病机制尚未完全明确。
- 张巧霞孙小娟蔡志明
- 关键词：膀胱癌细胞基因组不稳定性染色质重塑泌尿系统肿瘤术后复发率化疗敏感性
- α-硫辛酸作用肺癌细胞的转录组分析被引量：1
- 2018年
- 为了获得α-LA作用肺癌细胞后的转录组数据库和差异表达基因，我们将A549细胞处理组和对照组作为测试样品，采用Illumina HiSeqTM2000测序技术进行转录组测序，并进行系统的生物信息学分析。对照组和处理组两两比较共获得6748个差异表达基因。GO（gene ontology）分类分析表明，差异表达基因属于细胞组分、分子功能和生物学过程的46个类别。KEGG Pathway显著性富集分析提示差异表达基因共涉及15条途径，包括肿瘤相关通路、内质网蛋白加工、细胞周期、核糖体、剪接体等相关途径。对α-LA作用肺癌细胞的转录组进行拼接、组装和功能注释，得到大量转录本信息，为探究α-LA作用肺癌细胞后基因差异表达及相关分子机制提供了宝贵的基因组数据库资源。
- 文娅张满桥陆菁潇刘文孙小娟
- 关键词：Α-硫辛酸肺癌细胞转录组差异基因表达
- NCOR1与泌尿系统肿瘤的最新研究进展被引量：2
- 2012年
- 泌尿系统肿瘤是人类常见的恶性肿瘤。核受体共抑制(NCOR1)基因是近些年在肿瘤研究中发现的一个新的致癌基因。NCOR1基因与多种人类恶性肿瘤相关,它在调节各种核受体以及染色体重塑方面发挥重要作用,其与膀胱癌及前列腺癌的发生、发展、预后及治疗的敏感性密切相关。在此主要以膀胱癌和前列腺癌为切入点探讨NCOR1基因的功能及其与泌尿生殖肿瘤发生的关系。
- 夏烨孙小娟蔡志明
- 关键词：膀胱肿瘤前列腺肿瘤
- α-硫辛酸作用肝癌细胞的转录组分析及验证被引量：1
- 2020年
- 为了获取和发掘α-硫辛酸作用于肝癌细胞后的转录组数据库和Bcl-2家族蛋白差异表达基因,本研究采用高通量测序技术Illumina HiSeqTM2000对BEL-7402细胞的α-硫辛酸处理组和对照组进行转录组测序,再进行系统的生物信息学分析并筛选出Bcl-2家族蛋白相关的差异表达基因。然后通过PCR及Western blotting技术检测部分基因的表达,来验证测序结果的准确性和可靠性。最后再用流式细胞仪检测α-硫辛酸对肝癌细胞系HepG2、BEL-7402凋亡率的影响。本次测序分析共获得4671个差异表达基因,包括2223个表达上调,2448个表达下调。可归类到48个GO(Gene ontology)分类中,KEGG Pathway显著性富集共涉及6条途径,对差异性表达基因进一步筛选得到8个Bcl-2家族蛋白相关基因。PCR及Western blotting分析表明,在肝癌细胞HepG2、BEL-7402细胞中,α-硫辛酸处理组的Bax、Bak促凋亡基因m RNA及蛋白质水平表达均上调,与测序分析结果一致。流式细胞仪分析表明,α-硫辛酸可促进肝癌细胞系BEL-7402、HepG2凋亡,凋亡率分别为24.70%和25.40%,p值均小于0.05,差异具有统计学意义。本研究通过对α-硫辛酸作用于肝癌细胞后的转录组进行测序分析,得到了大量转录本信息,测序结果高效、准确,可为研究α-硫辛酸诱导肝癌细胞凋亡的分子机制提供重要线索。
- 张满桥文娅陆菁潇刘文孙小娟
- 关键词：Α-硫辛酸肝癌细胞差异表达基因BCL-2家族蛋白
