宁宇
- 作品数：19 被引量：136H指数：7
- 供职机构：中国林业科学研究院湿地研究所更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学天文地球自动化与计算机技术更多>>
- 基于RNA-seq的西藏嵩草转录组分析被引量：2
- 2017年
- 嵩草属植物是青藏高原及其周边地区高寒草甸的建群种,分蘖能力强、根系发达,耐寒,是优良的牧草资源。目前对该类植物转录组情况的研究相对不足。该文采用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术,对西藏嵩草(Kobresia tibetica)茎、叶、花及果实的混合样进行转录组分析。经拼接组装共获得63 837个Unigene,序列平均长度890.1bp,N50为1 342bp。将Unigene序列与5个主要的公共数据库(NR,Swiss-Prot,KEGG,GO,KOG)进行比对(Evalue<1e-5),共有40 705条Unigene获得了基因注释,占总Unigene的63.76%。通过KEGG pathways分析,共有10 043Unigene参与了274个代谢通路,获得了西藏嵩草分蘖和抗寒相关Unigene 179个。在15 044条Unigene中共搜索到5 310个SSR位点,其中二核苷酸和三核苷酸的重复类型占所有SSR位点的94.63%。这些数据为嵩草相关基因的发掘和SSR分子标记开发提供了重要依据。
- 宁宇董树斌武高洁王义飞马骅索朗夺尔基
- 关键词：KOBRESIA基因注释SSR
- 扁秆荆三棱不同组织混合样品的转录组分析被引量：2
- 2019年
- 扁秆荆三棱是一种常见的稻田杂草,旨在补充其转录组信息,为相关防治工作提供支持。基于高通量测序技术,在Illumina Solexa HiSeq 2000平台上对扁秆荆三棱的茎、叶、根茎和球茎的混合样品进行转录组分析。经拼接组装共获得了59 788个Unigene,序列的平均长度842 bp,N50为1 402 bp。将获得的Unigene与5个通用公共数据库(NR、 Swiss-Prot、 KEGG、 GO、 KOG)进行比对(Evalue<1e-5),35 221条Unigene获得了基因注释,占总Unigene的58.91%。在12 823个Unigene中共搜索到9 698个SSR位点,其中二核苷酸和三核苷酸的重复类型占所有SSR位点的95.93%。通过KEGG pathways分析,共有13 141个Unigene参与了291个代谢通路,获得了扁秆荆三棱淀粉合成功能相关Unigene 60个,根茎生长功能相关Unigene 14个。其中赤霉素相关基因、核糖体代谢通路等反映了地下根茎网络系统的扩张趋势以及活跃的能量需求,淀粉合成基因则说明其球茎中的营养储备开始于地下系统扩张的早期,这些发现为深入研究地下根茎网络调控机制,或杂草防治或湿地保护等实践工作提供了参考。
- 宁宇郑彦超武高洁武高洁张曼胤
- 关键词：高通量测序转录组基因注释SSR
- 自然保护地管理有效性评估方法综述被引量：13
- 2020年
- 自然保护地管理有效性评估已经成为提高生态系统保护和管理效果、减缓生物多样性丧失的关键过程。文中对自然保护地管理有效性评估的主要评估框架、评估指标和评价方法等进行了比较。其中,由于管理目标和国情的差异,不同管理有效性评估的评估框架和指标体系区别明显。管理有效性评价方法主要包括基于打分的评价法、基于证据的认证法。在多种管理目标的自然保护地体系下,提出我国应建立符合不同类型保护地管理目标的管理有效性评估框架和指标体系,并将管理有效性评价作为自然保护地过程管理、科学研究的重要内容,探索科学合理的评价方法。
- 郭子良祝伟雷茵茹宁宇宁宇
- 关键词：自然保护地管理有效性
- 若尔盖高原湿地生态系统研究综述被引量：3
- 2016年
- 从湿地分类、湿地生物、湿地生境以及湿地退化4个方面对近年来若尔盖的科研成果进行阐述和总结,最后对若尔盖湿地研究的发展进行展望。
- 马骅王义飞李肖夏宁宇赵娜娜武高洁索郎夺尔基
- 关键词：生态系统
- 土壤含盐量对扁杆藨草生长的影响被引量：5
- 2009年
- 通过研究莫莫格湿地扁杆藨草生长状态与土壤盐分含量的变化规律,得出扁杆藨草生长状态的临界值。研究发现,当无外界干扰或者外界干扰比较小时,扁杆藨草生长临界值为:株高24.4cm,地上生物量4.745g,土壤含盐量1.100%;当存在一定干扰时,其生长临界值为:株高23.2cm,地上生物量4.179g,土壤含盐量0.977%。
- 惠淑荣李响张志翔宁宇
- 关键词：含盐量
- 莫莫格自然保护区白鹤秋季迁徙停歇期觅食生境选择被引量：10
- 2013年
- 2008年秋季（10月8日-20日）及2009年秋季（9月20日-10月16日），通过样方法对觅食生境11个生态因子进行调查，利用卡方检验、资源选择指数和资源选择函数在莫莫格保护区对秋季迁徙停歇期白鹤觅食生境选择进行研究。结果表明，白鹤对距人为干扰源距离、植被密度、盖度、高度、植物性食物密度以及水深均具有选择性，但对宏观尺度干扰因子的选择性较低。其偏好觅食生境的特点为：距一级路〉5000m，〉二级路1500m以上，〉三级路1000m以上，〉居民点1000m以上，农田〉1000m；植被密度20～50株／m2，盖度〈10％，高度〈20cm，扁杆蔗草密度1～50株／m2，蔗草密度1～10株／m2，水深40～60cm。白鹤秋季觅食生境资源选择函数为Logistic（P）=0．663＋0．565x与一级道路距离＋0．042x与二级道路距离＋0．519x与三级道路距离＋0．353x与居民点距离＋0．169x与农田距离-0．455x植被密度-0．618x植被盖度-0．548x植被高度-0．158x扁杆蔗草密度-0．404x蔗草密度＋0．920x水深，T（x）=e^Logistic（p）／[1＋e^Logistic（p）]，模型正确预测率为82．9％。
- 孔维尧郑振河吴景才宁宇王永韩晓东
- 关键词：白鹤觅食生境选择资源选择函数
- 扁秆荆三棱球茎萌苗种群的大小级及生长速率研究
- 2015年
- 产生不同大小的后代通常被视为对环境风险的一种两面下注策略,而研究也发现克隆植物远端构件可能具有生长优势。为了研究不同球茎类型和水分条件是否对球茎萌苗形成的分株种群的大小级产生影响,以及远端分株在生长速率上是否也存在优势,本文以扁秆荆三棱为对象开展了研究。设计了基于球茎类型（原生、次生和新生）和水分条件（湿润无积水、1~2 cm薄积水、10 cm水深）的区组实验,通过监测其分株高度和数目变化来进行比较。结果显示：1）球茎类型和水分条件对扁秆荆三棱分株种群的大小有显著影响,但对克隆之间大小的变异没有显著影响;2）随着水深的增加,分株数和高度都呈增加趋势,新生球茎萌苗形成的分株高度较低,但分株数在球茎类型间无显著差异;3）分株生长速率只和克隆生长阶段有关,随着分株数增加,克隆和分株的生长速率都呈增大趋势,但是远端分株的生长速率并没有显著优势。因此,克隆植物大小级独立于环境条件的稳定性可以视作对资源的有效利用以及对环境风险进行缓冲的策略,而克隆规模对生长速率的促进可能是由于生理整合作用而导致的。远端分株生长速率无明显优势则说明远端分株可能更偏向于储藏和向克隆外探索。
- 宁宇董树斌张志翔崔丽娟赵良成
- 关键词：克隆植物球茎水分条件生长速率
- 克隆植物扁秆藨草种子库特征及其适应意义被引量：2
- 2014年
- 克隆植物在湿地中普遍存在，其在有性和克隆两种繁殖方式之间的权衡是植物生态学中的热点议题，并具有重要的理论意义。以扁秆蔗草（Scirpus planiculmis）为研究对象，在吉林省莫莫格湿地，对不同环境条件下土壤中的扁秆蔗草种子数量及其分布规律进行了研究，并对影响扁秆蔗草种子数量的环境因素进行了分析。结果表明，①在垂直方向上，扁秆蔗草种子主要集中分布在土壤表层（0～5cm深度）和中层（5-10cm深度）内，在下层土壤（深度〉10cm）中明显减少；表层土壤中的扁秆蔗草种子容易受到干扰而发生变动；这种垂直分布规律不随环境条件的改变而发生变化；②在不同的环境条件下，扁秆蔗草种子的数量存在显著差异；土壤含水率、pH和群落辛普森指数与扁秆蔗草种子数量显著相关，植被中扁秆蔗草的多度则与种子数量不相关。分析发现，因环境因素引发的扁秆蔗草繁殖方式的权衡是存在的，并可以在小的局域范围内实现；扁秆蔗草被重新定义为兼性盐碱植物，其适宜生长条件为弱碱性，在强碱性条件下则会通过大量产生种子而实现对当前生境的逃离；两种繁殖方式的意义不同，有性繁殖主要服务于宏观尺度上种群的扩散与维系，而克隆繁殖的则实现了小尺度内克隆对资源的有效利用和竞争优势的保持。
- 宁宇张志翔赵良成邹畅林杨佳妮
- 关键词：克隆植物种子繁殖对策
- 高通量测序技术在野生动物食性分析中的应用被引量：23
- 2018年
- 食性研究是动物生态学颇受关注的一个重要内容,而食性分析方法由于受到技术和适用范围的限制,也在不断改进和更新。随着高通量测序技术的发展,该技术逐渐扩展到野生动物的食性分析,使食性分析的效率得到极大提升,并拓宽了食性分析的应用范围。尽管高通量测序应用于食性分析在数据量、灵敏度和分辨率方面的优势较为明显,但由于涉及到的步骤较多,受到的影响因素较为复杂,目前高通量测序应用于食性分析还属于研究比较薄弱的领域。概述了高通量测序技术应用于食性分析的基本流程,总结了该技术在食物组成分析、种内和种间食性关系、食物与栖息地、行为关系方面的研究动态,分析了PCR、污染和定量分析对该技术应用性的影响,提出了相应的解决对策和建议,并对其应用前景进行了展望。
- 刘刚宁宇宁宇龚明昊
- 关键词：高通量测序粪便DNA食性分析种间关系觅食行为
- 秋茄幼苗光合特性对寒害的响应被引量：10
- 2018年
- [目的]研究低温胁迫对秋茄幼苗光合作用和叶绿素荧光参数的影响及秋茄幼苗对低温胁迫的防御机制,以期为抗寒性红树植物种的选育、引种提供参考。[方法]以秋茄幼苗为材料,分别在5℃与12℃低温下进行胁迫试验。应用Li-6400XT便携式光合作用测定仪和便携式脉冲调制叶绿素荧光仪(PAM-2500)分别测定光合参数与叶绿素荧光参数的变化,应用EXCEL和SPSS13. 0软件进行数据整理、作图及统计分析。[结果]表明:(1)低温胁迫对秋茄幼苗的光合速率(Pn)、胞间CO2浓度(Ci)、气孔导度(Gs)及水分利用率(WUE)影响显著(P <0. 05);(2)低温胁迫下,Pn、Gs、Ci均显著降低,持续5 d低温,Pn、Gs随低温时间的延长持续下降,Ci则呈现上升趋势。5℃低温胁迫第1天,WUE明显高于对照(CK),第2天之后开始下降且低于对照(CK); 12℃低温胁迫下,WUE略高于CK且低温期内持续高于CK。(3) 5℃低温胁迫下,可变荧光(Fv)与最大光能转换速率(Fv/Fm)低于CK,随低温时间的延长呈现下降趋势,在低温第5天,显著低于CK(P <0. 05); 12℃低温胁迫下,Fv和Fv/Fm变化不明显。[结论]秋茄幼苗可在12℃低温胁迫下存活,但秋茄幼苗的形态生长和生物产量减少,而5℃低温胁迫持续2 d是秋茄幼苗的生存阈值;秋茄幼苗叶片在未使光系统Ⅱ(PSⅡ)潜在活性中心受损的低温胁迫下,Pn下降主要受气孔因子限制,在光合作用过程中,通过提高叶片水分利用率,以减少光合速率下降,提高抗寒能力。
- 郭菊兰朱耀军文菀玉武高洁宁宇马骅王义飞
- 关键词：秋茄幼苗低温胁迫光合特征
