目的:采用SRAP(sequence related amplified polymorphism)分子标记技术对不同产地蒙古黄芪进行遗传关系研究,为蒙古黄芪的种质资源评价提供一定的依据。方法:对来源于12个产地的蒙古黄芪的样品进行了SRAP多态性研究。结果:从80个引物组合中筛选出扩增产物条带信号强,重现性好,特征性好的16个引物组合,扩增得到141条条带,聚类分析结果显示,12份材料可以分为2个大类。结论:蒙古黄芪居群间遗传分化明显,SRAP技术可以有效用于蒙古黄芪的亲缘关系分析。
目的:获得丹参牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶基因(GGPS),并进行生物信息学分析和初步的表达特性研究。方法:根据GGPS蛋白序列保守区域设计简并引物,利用同源扩增和cDNA末端快速扩增技术从丹参根中获得目的基因;利用BLAST进行序列比对,ORF F inder寻找开放阅读框,Prosite分析蛋白质的基本结构域,Target P 1.1分析信号肽序列,MEGA4.0比对已有GGPS蛋白序列,并构建进化树;用半定量RT-PCR检测其在丹参子叶期根、叶和花期根、茎、叶、花蕾、花中的表达情况;设计特异引物,从丹参基因组DNA中扩增,获得编码完整的GGPS基因,初步分析该基因结构。结果:得到1条长1298 bp的GGPS cDNA序列,其ORF框长1 095 bp,编码1段含有52个氨基酸质体定位信号肽的364个氨基酸序列,具有多聚异戊二烯基合成酶的特异序列,与已报道的GGPS基因有60%以上的同源性;RT-PCR半定量分析表明该基因在所分析的各组织中均有表达,尤以花期叶片中的表达最强;基因结构分析表明该基因有1个397 bp的内含子。结论:首次得到丹参牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶基因,为其功能研究提供了基础。
