张新丽
- 作品数：4 被引量：23H指数：3
- 供职机构：中南大学湘雅医学院医学检验系更多>>
- 发文基金：湖南省科技计划项目中央高校基本科研业务费专项资金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 长链非编码RNA LINC00152在结肠癌组织中的表达及临床意义被引量：9
- 2015年
- 目的探讨长链非编码RNA LINC00152在结肠癌组织中的原位表达情况及其临床意义。方法用微阵列显著性分析（significance analysis of microarrays,SAM）软件分析下载于NCBI GEO数据库的基因芯片GSE33113数据,筛选结肠癌中差异表达的lncRNA;原位杂交法检测LINC00152在115例结肠癌及其癌旁组织中的表达状况;分析LINC00152阳性率与结肠癌临床病理参数的关系,并用受试者工作曲线（receiver operating characteristics,ROC）评估其作为肿瘤转移、预后预测分子标志物的潜在应用价值。结果 SAM软件分析基因芯片数据发现,结肠癌组织中共有65个lncRNA差异表达（P均〈0.01）,其中上调lncRNA（倍数变化〉2）6个,下调lncRNA（倍数变化〈0.5）59个;原位杂交结果显示,LINC00152在结肠癌和癌旁组织中的阳性率分别为63.48%（73/115）和9.57%（11/115）,两者差异有统计学意义（χ^2=72.091,P〈0.05）。临床Ⅰ期、Ⅱ期结肠癌组织中LINC00152的阳性率（27.78%和45.28%）明显低于Ⅲ~Ⅳ期（77.27%）,差异有统计学意义（χ^2分别为10.234和13.411,P〈0.05）,发生淋巴结转移的结肠癌组织中LINC00152的阳性率（81.13%）明显高于非淋巴结转移者（48.39%）,差异有统计学意义（χ^2=13.215,P〈0.05）。LINC00152对结肠癌患者淋巴结转移诊断的ROC曲线下面积（AUCROC）为0.771（95%CI：0.588~0.834,P〈0.01）,当cut off值为3.1时,其敏感性为72.1%、特异性为65.4%、约登指数为0.375。结论LINC00152在结肠癌组织中表达增高,且与临床分期和淋巴结转移有关,可能作为结肠癌转移评估的分子标志物。
- 张新丽朱燕李淑娜范松青袁培高雪丹王婵娟张丰羽张文玲
- 关键词：结肠癌长链非编码RNA原位杂交
- 长链非编码RNA在肺癌中的功能及机制研究被引量：4
- 2013年
- 长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类转录本长度超过200个核苷酸的非编码RNA1,因缺乏完整的开放阅读框而不能编码任何蛋白质。在人类基因组中,lncRNA在表观遗传学调控、转录调控与转录后调控等方面发挥着重要作用,已成为继microRNA之后的又一研究热点。lncRNA在肿瘤中的异常表达常发挥不同的生物学作用,表现为癌基因或抑癌基因的特点,可促进或抑制肿瘤的生长。肺癌是一种常见的恶性肿瘤,5年生存率只有17%。本研究通过文献发现lncRNA MALAT1、H19、lincRNA p21、UCA1、BC200与肺癌的发生发展有密切关系,可促进肺癌生长、侵袭转移、细胞凋亡和诱导药物抵抗等。因此本文就上述五种lncRNA在肺癌中的功能及机制进行综述,旨在为肺癌的临床诊断、治疗及预后提供帮助。
- 赵艳华张新丽张文玲
- 关键词：长链非编码RNA肺癌基因表达基因调控
- 长链非编码RNAAFAP1-AS1在消化系统肿瘤中的表达及意义被引量：9
- 2014年
- 目的:探讨长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)肌动蛋白纤维相关蛋白1-反义RNA1(actin filament-associated protein 1-antisense RNA1,AFAP1-AS1)在食管癌、胃癌、肝癌和结直肠癌4种常见消化系统肿瘤组织中的表达情况及其临床意义。方法:采用组织微阵列切片初步筛查82例肿瘤组织(包括食管癌11例、胃癌11例、肝癌26例和结直肠癌34例)及对应癌旁组织中AFAP1-AS1的表达情况。对表达差异明显的肿瘤组织类型(肝癌),再扩大样本量(70例石蜡切片和30例新鲜组织),通过原位杂交和实时荧光定量PCR法进一步检测验证,并分析AFAP1-AS1表达与肝癌主要临床病理特征的相关性,评估其在肿瘤淋巴结转移中的作用。结果:AFAP1-AS1在食管癌中的表达水平高于癌旁组织(P<0.05),在肝癌组织中的表达水平低于癌旁组织(P<0.05),在胃癌和结直肠癌中其表达与癌旁组织中的表达水平没有明显差异(P>0.05)。扩大肝癌组织样本量后,仍然发现肝癌组织中的AFAP1-AS1水平明显下调,并且与临床分期和淋巴结转移有关(P<0.05)。AFAP1-AS1作为肝癌淋巴结转移的分子标志物的灵敏度、特异度、符合度、阳性预测率和阴性预测率分别为91.23%、28.21%、65.62%、68.75%和65.00%。结论:lncRNA AFAP1-AS1可能与肝癌、食管癌的发生和发展有关,并且在肝癌和食管癌中起到不同的生物学作用;AFAP1-AS1可能成为新的肝癌分子标志物,应用于肝癌临床诊断。
- 赵艳华冷书生范松青张新丽高戈苏志乐张文玲
- 关键词：消化系统肿瘤长链非编码RNA
- 生物信息学方法筛选结肠癌相关长链非编码RNA被引量：1
- 2015年
- 目的筛选结肠癌中差异表达长链非编码RNA(lncRNA)并探讨其表达情况。方法从NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台Gene Expression Omnibus(GEO)下载结肠癌基因芯片数据GSE41328,包含10对结肠癌组织及正常组织,用微阵列显著性分析(SAM)软件输出差异表达基因,信息学网站对基因重注释得到lncRNA名称,然后用Gene Cluster和Tree View软件分析差异表达lncRNA数据,进一步验证其表达情况。结果分析GSE41328发现,与正常组织相比,结肠癌共有66个lncRNA差异表达,其中22个高表达,44个低表达,结肠癌与正常组织表达值倍数均大于2或小于0.5,差异有统计学意义。结论运用生物信息学方法筛选结肠癌相关lncRNA,可为寻找新的肿瘤标志物提供新的途径,但其结果需要进一步实验验证。
- 张新丽赵艳华李淑娜张文玲
- 关键词：长链非编码RNA结肠癌基因芯片
