徐红红
- 作品数：9 被引量：40H指数：3
- 供职机构：齐齐哈尔大学生命科学与农林学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金黑龙江省自然科学基金黑龙江省教育厅科学技术研究项目更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 大豆KCS基因的克隆及结构预测被引量：2
- 2013年
- 以大豆叶片总RNA为模板,利用RT-PCR方法,克隆获得大豆KCS基因序列。采用生物信息学方法对其进行预测分析,结果表明:大豆KCS基因的CDS序列长度为1533bp,编码510个氨基酸;大豆KCS基因编码的蛋白质理论分子量为57.1kD,等电点为9.03;该基因编码的蛋白具有两个完全跨膜结构;没有信号肽;其蛋白质二级结构中α螺旋占47.65%,无规则卷曲占35.88%,β折叠占16.47%;在进化关系上,与油茶、菟葵、苜蓿的亲缘关系相对较近,该研究结果可为大豆KCS基因结构和功能的进一步研究提供理论参考。
- 赵艳翟莹邱增成徐红红国春晖
- 关键词：大豆基因克隆
- 东亚砂藓类萌发素蛋白基因RjGLP的克隆及表达分析被引量：1
- 2015年
- 以东亚砂藓转录组测序获得的类萌发素蛋白基因序列为基础,采用PCR技术克隆得到该基因的cDNA全长序列,命名为RjbZIP。该序列全长为726 bp,包含669 bp的开放阅读框,编码222个氨基酸的蛋白质。生物信息学分析显示,该蛋白的相对分子质量为23 397.9,等电点(pI)为6.82,不稳定系数为14.41,为稳定蛋白。序列预测分析表明,该蛋白疏水性强,具有信号肽序列,是一种胞外基质分泌蛋白。多序列比对分析结果显示,该基因编码的蛋白具有GLPs家族的典型特征。实时荧光定量PCR研究表明,在干旱胁迫处理过程中,东亚砂藓RjGLP基因的表达量高于正常生长的材料(CK),被诱导表达,推测该基因可能参与对干旱胁迫的应答。
- 张梅娟沙伟刘博徐红红
- 关键词：东亚砂藓基因克隆
- 东亚砂藓甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因的克隆及表达分析被引量：2
- 2014年
- [目的]克隆东亚砂藓甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因RjGAPDH,并对其进行生物信息学和表达分析。[方法]通过分析东亚砂藓转录组测序数据,利用RT-PCR技术克隆该基因的全长序列,并通过荧光定量PCR分析RjGAPDH基因在不同干旱胁迫时间的表达情况。[结果]该基因全长为1 208 bp,开放阅读框1 053 bp,编码350个氨基酸,预测蛋白分子量为38.66 kD,等电点pI为6.02,不稳定系数为23.97,为稳定蛋白;该基因编码的蛋白无跨膜区和信号肽序列,定位于细胞质。在快速干旱胁迫处理过程中,东亚砂藓RjGAPDH基因的表达量高于正常生长的材料(CK),能被诱导表达。[结论]RjGAPDH基因可能参与东亚砂藓对干旱的胁迫反应,为后续进一步研究其功能特征奠定基础。
- 张梅娟沙伟刘博徐红红
- 关键词：东亚砂藓基因克隆
- 东亚砂藓质膜蛋白的提取被引量：1
- 2014年
- 质膜蛋白的提取一直是蛋白质组学的难点之一,传统的质膜蛋白提取方法操作复杂,且不易出结果,本实验通过对传统的蔗糖密度梯度法进行改良,成功提取了东亚砂藓质膜蛋白,该方法操作简便、快速高效,将为后续的东亚砂藓质膜蛋白的表达及蛋白质组学等研究奠定基础。
- 徐红红沙伟张梅娟
- 关键词：东亚砂藓
- 水藓科植物ISSR-PCR反应体系的优化被引量：4
- 2013年
- 目的:对水藓科植物ISSR-PCR反应体系进行优化,为水藓科的遗传多样性研究奠定基础。方法:提取水藓的基因组DNA,利用正交设计法对水藓ISSR-PCR反应体系进行5因素4水平的优化,并通过计算极差分析各因素对PCR扩增的影响程度。结果:水藓科ISSR-PCR最佳的反应体系(20μL)为:2.0μL PCR Buffer溶液、1.52mmol.L-1Mg2+、1.28μmol.L-1引物、1.20mmol.L-1dNTPs、70.0 ng模板、0.50 UTaq酶。5个因素对该反应体系的影响顺序为:Mg2+﹥Taq酶﹥dNTPs﹥模板DNA=引物。在此反应体系下,可以得到重复性好、稳定且多态性高的条带。结论:该实验通过对水藓科基因组DNA的提取及体系优化,获得了水藓科植物最佳反应体系,为后续应用ISSR技术鉴定水藓科种质资源及其遗传多样性研究奠定了基础。
- 买买提明.苏来曼徐红红古再丽努尔.阿布都艾尼张梅娟沙伟
- 关键词：正交设计
- 砂藓RcPIP2基因的克隆及生物信息学分析被引量：2
- 2019年
- 水通道蛋白是一类较小的跨膜蛋白质,在植物抵御非生物胁迫过程中具有非常重要的作用。为了研究砂藓水通道蛋白基因的生物学功能,利用干旱处理转录组测序获得的序列信息,克隆获得1个水通道蛋白家族中质膜内在蛋白基因序列,命名为RcPIP2。生物信息学结果显示,RcPIP2基因全长序列为1 267 bp,包含807 bp的开放阅读框,编码含有268个氨基酸残基的蛋白质。该蛋白质分子质量预测为28.3 ku,理论等电点为6.64,为疏水性较强的稳定性蛋白;无信号肽,为非分泌型蛋白;含有6个跨膜结构域。保守结构域分析发现,RcPIP2具有膜内在蛋白(MIP)家族信号序列、高等植物高度保守序列HINPAVTFG和2个天门冬酰胺-脯氨酸-丙氨酸(NPA)基序。二级结构包括α螺旋(37.31%)、β折叠(20.9%)、无规则卷曲(38.43%)。三级结构预测发现,RcPIP2蛋白质的立体结构为典型的四聚体形式,由4个圆筒状亚基和中间的孔道构成。系统进化树分析表明,RcPIP2与小立碗藓中的PIP2蛋白质亲缘关系较近,聚为一类。由此推测,RcPIP2基因为水通道蛋白家族成员。
- 张梅娟徐红红马天意钱朋智沙伟
- 关键词：水通道蛋白克隆生物信息学分析
- 东亚砂藓bZIP转录因子RjbZIP基因的克隆及表达分析被引量：6
- 2015年
- 为研究b ZIP转录因子在苔藓植物中的生物学功能,以东亚砂藓转录组测序获得的一个与b ZIP转录因子同源性较高的基因片段为基础,采用RT-PCR技术克隆得到该基因的c DNA全长序列,命名为Rjb ZIP。该基因c DNA全长为1 477 bp,包含1个1 422 bp的开放阅读框,编码473个氨基酸,预测蛋白分子量为5.114 k Da,等电点为6.97。Rjb ZIP蛋白属于不稳定蛋白,无跨膜区和信号肽结构,亚细胞定位于细胞核。该蛋白含有典型的b ZIP结构域,该结构域包含一个亮氨酸拉链区,一个碱性结构域和一个谷氨酰胺丰富区。实时荧光定量PCR分析显示,在快速脱水、缓慢脱水和脱水后复水处理过程中,东亚砂藓Rjb ZIP基因均能被诱导表达,且对脱水后复水的反应更为迅速,推测该基因参与东亚砂藓抵抗逆境胁迫的应答,为后续进一步研究其功能特征奠定了基础。
- 沙伟张梅娟刘博徐红红
- 关键词：东亚砂藓BZIP转录因子基因基因克隆
- 水藓科植物遗传多样性研究被引量：3
- 2013年
- 利用ISSR分子标记方法对不同地区的13份水藓科植物进行遗传多样性分析,结果表明,稳定且重复性高的7条引物共扩增出526条清晰的条带,其中518条具有多态性,平均多态性位点比率为98.47%.运用PopGen-32软件分析发现,等位基因数Na=1.736 3,有效等位基因数Ne=1.306 2,Nei基因的多样性与Shannon信息的指数分别为0.201 5和0.321 1,说明水藓科植物的遗传多样性比较丰富.13份水藓科植物的遗传分化系数Gst、遗传距离D与遗传一致度I分别为0.025 3、0.007 1和0.054 7,对其进行计算得知,不同属种间存有基因交流,但与种间变异相比,种群内部的遗传变异较大.通过NTSYS2.1软件对13份样本的亲缘关系进行聚类,可将其分为3类,且样本的遗传距离与地理位置有一定的相关性.
- 买买提明.苏来曼徐红红玛尔孜亚.阿不力米提张梅娟沙伟
- 关键词：ISSR聚类分析
- 连作西瓜光合特性及抗病性对小麦伴生的响应被引量：21
- 2014年
- 连作障碍是限制设施西瓜栽培的重要因素,利用植物间化感作用的伴生栽培模式是解决连作障碍的有效手段。为探讨小麦品种‘D125’伴生对连作西瓜生长的效应,采用连作西瓜土壤进行盆栽试验,设置西瓜单作和小麦伴生西瓜2个处理,研究连作西瓜光合特性及抗病性对小麦伴生的响应。结果表明,西瓜定植40 d时,伴生小麦与单作相比,西瓜叶片光合速率、气孔导度和胞间CO2浓度分别提高32.2%、28.5%、7.8%,叶片叶绿素总量、叶绿素a含量和叶绿素a/b分别增加7.5%、8.4%和3.2%,且差异显著;西瓜定植60 d时,伴生小麦与单作相比,西瓜叶片净光合速率、气孔导度和胞间CO2浓度分别提高52.9%、116.7%、33.8%,叶片叶绿素总量、叶绿素a含量和叶绿素a/b分别提高5.8%、7.1%、4.9%,均达到差异显著水平。但两个处理间的初始荧光、可变荧光、PSⅡ最大光化学效率、PSⅡ实际光化学效率及光化学猝灭系数无显著差异;西瓜白粉病病情指数降低6.3%。西瓜定植40 d后,伴生小麦与单作相比,西瓜叶片MDA含量和PAL活性分别降低44.43%和8.68%,SOD和PPO活性升高17.3%和84.5%;西瓜定植60 d,叶片PAL活性显著高于单作,MDA含量、SOD和PPO活性无显著差异。可见连作西瓜对伴生小麦产生了积极的响应,伴生小麦具有提高连作西瓜净光合速率,减缓西瓜叶片衰老,延长光合功能期的作用,提升了连作西瓜的抗病性。
- 徐伟慧吴凤芝王志刚孙国雁徐红红
- 关键词：连作障碍西瓜光合特性抗病性
