王宏利
- 作品数：9 被引量：0H指数：0
- 供职机构：北京大学物理学院更多>>
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- 相关领域：理学生物学医药卫生更多>>
- 具有热鲁棒性的适应性基因调控网络
- 2019年
- 通过对三节点基因调控网络的枚举、参数空间的随机采样以及动力学模拟,找到具有热鲁棒性(即温度补偿)的适应性基因转录调控网络,对其进行结构分析表明,存在3种最基本的结构可以实现具有热鲁棒性的适应性动力学功能,复杂的适应性网络都以此3种网络为核心骨架。为了考察三节点适应性网络的适应性对网络动力学中各参数改变的敏感度,计算了各参数相应的控制系数。对控制系数的聚类分析表明,三节点功能网络实现热鲁棒的机制为温度隔离,即尽管网络中所有的速率参数都依赖于温度,但仅输出节点的生成和降解速率明显偏离0且具有相反的符号,大多数热鲁棒适应性都通过输出节点的拮抗平衡调节来实现。
- 刘明王宏利
- 关键词：适应性温度补偿
- 负载对自激振子动力学性质的影响
- 2023年
- 以简单生化振子模型为对象,运用数值计算和理论分析,研究负载对自激振子的影响。对振子动力学性质的分析结果表明,振子经由绝缘模块以间接耦合的方式驱动负载的方案有利于维持振子动力学性质的稳定。负载与其上游模块的结合亲和力以及绝缘模块物质总量是影响负载相对振幅的两个关键因素。绝缘模块的引入能够打破负载振荡与回溯性在直接耦合方式下的权衡。对自由能耗散的计算结果表明,振荡自由能耗散增加不一定意味着回溯性减小或负载振荡的增强。
- 鞠筱林王宏利
- 生化反应动力学校对过程中的内部噪声
- 2015年
- 从随机过程的角度,对生物校对动力学过程进行了理论和数值分析。通过建立主方程,对2步和3步中间过程的动力学校对随机动力学性质进行描述,运用线性噪音近似的方法求得平衡态噪音的解析解,并通过数值模拟的方法讨论噪音与参数间的关系。结果表明,噪音随中间反应的进行而扩散和放大,同时反应速率参数对噪音强度的大小也有显著影响。
- 王超王宏利
- 关键词：随机动力学数值模拟
- 生物可振荡网络的设计性原理
- 是自然界中最为常见的现象之一,在生物系统中也有非常多的实例.早期研究主要是用非线性分析的方法研究生物节律以及化学振荡;近年来由于生物研究手段的进步,在合成振荡环路、神经网络、细胞周期、体节形成等方面研究较为深入1,2,3...
- 曹远胜王宏利欧阳颀汤超
- 关键词：设计原理
- 生物系统中的信息处理国际研讨会
- 2010年
- 2009年7月19—21日，由北京大学理论生物学研究中心举办的“生物系统中的信息处理”国际研讨会（International Workshopon Information Processingin Biology）在北京大学燕园未名湖畔博雅国际会议中心召开。
- 王宏利
- 关键词：信息处理生物系统理论生物学
- 双稳系统中布洛赫波峰湍流的统计性质(英文)
- 2014年
- 双稳系统中的布洛赫波峰的横向失稳可以引起波峰湍流,其不规则运动体现为斑图中的漩涡自发而不规则地产生和湮灭.本文以受驱动系统的复Ginzburg-Landau方程为模型,研究了布洛赫波峰湍流的统计性质.计算了漩涡产生速率和湮灭速率,以漩涡数量时间序列为基础,给出了漩涡动力学变化遵循的主方程.对湍流中漩涡对关联函数的计算表明,漩涡产生/湮灭速率中各幂次项来源于漩涡产生/湮灭事件与周围不同数量的漩涡的短程相互作用.
- 王宏利谯春
- 三维反应扩散系统中的螺旋波和失稳控制
- 2014年
- 三维螺旋波(卷轴波)的运动和失稳的研究在心颤等高发心脏病中扮演重要角色,对三维螺旋波的运动和失稳过程以及控制的研究对于心颤等心脏病的防治具有指导意义.本文主要对我们过去几年在梯度系统中螺旋波的研究结果做一个总结.我们以反应扩散系统为研究对象,对于具有参数梯度的螺旋波的失稳过程和控制进行了探讨.在实验和数值模拟研究中,我们发现在三维梯度系统中,梯度大小的改变可以促使三维螺旋波发展产生线缺陷或者引起二维螺旋波运动的相位差的积累而产生漫游,两者都可使螺旋波的运动失去稳定性.对于螺旋波失稳的控制,我们研究了外力周期驱动和噪声对螺旋波失稳的影响,对控制的机制进行了分析.
- 王宏利欧阳颀
- 关键词：螺旋波失稳
- 振荡周期不受温度影响的生物调控网络的数值研究
- 2016年
- 生物学中普遍存在的生物钟的基本特性之一是其振荡周期不随环境温度变化而变化,即具有温度补偿特性,其机制是近年来研究的热点.本文对具有振荡周期不随温度变化的基因调控网络做了数值分析.温度补偿振荡是一种系统水平的性质,跟网络的拓扑结构具有密切联系.对多节点的仅有抑制性调控关系的随机网络的计算表明,温度补偿的振荡行为可以仅仅通过采用适当的拓扑结构实现,而不需要细调的动力学参数.对所有3个节点网络的穷举发现,温度补偿振荡网络结构上是两种性质互补的振荡网络模体的组合,即延迟的负反馈网络)、抑制子振子和激活抑制振子、底物耗尽振子的组合.对网络振荡周期随参数的敏感性分析表明,温度补偿振荡可以通过熔断机制来实现,振荡周期仅敏感依赖于极少数的反应速率常数,而这些常数的活化能很小因为阻断了温度对振荡周期的影响.
- 王宏利吴丽莉
- 关键词：鲁棒性振荡生物网络
- 化学反应扩散系统中的斑图形成
- 欧阳颀王宏利周路群
- 该课题发现系统全局失稳所导致的定态斑图，以及发现化学法拉第斑图等；首次在实验中发现了图灵分岔与二维图灵斑图，从实验上证明反应扩散系统中非线性作用引起的对称性破缺确实可以导致图灵斑图；发现了空间延展体系中BZ反应在周期光照...
- 关键词：
- 关键词：螺旋波
