薛建新
- 作品数：21 被引量：35H指数：3
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- 相关领域：自动化与计算机技术文化科学生物学更多>>
- 蛋白质与RNA相互作用的预测和研究
- 2017年
- 确定蛋白质与RNA是否发生作用非常重要,因为它广泛存在于生物学过程中,在生物体细胞活动中起到至关重要的作用。特别是近几年随着蛋白质结构数据的增多,如果仍用传统的物理化学方法去测定会非常困难,找到能自动预测蛋白质与RNA的相互作用的方法迫在眉睫。首先采用Pse PSSM算法表达蛋白质序列,编码后的蛋白质特征向量维数很高;接着采用GPP流形学习方法对其进行维数约简,约简后的特征向量输入SVM分类器训练,训练好的分类器预测未知的蛋白质与RNA是否相互作用;最后,采用Jackknife测试方法检验预测准确率,测试结果表明,上述方法是十分有效的,为蛋白质与RNA是否相互作用的研究提供一条新的思路。
- 王彤薛建新杜奕
- 关键词：维数约简
- 利用半监督降维算法预测蛋白质亚细胞位置被引量：2
- 2015年
- 首先采用伪氨基酸组成(Pse AA)和特定位点记分矩阵(PSSM)2种方法组合的特征提取方法来表达蛋白质序列。通过该方法将蛋白质序列转化成特征向量,虽然该向量在很大程度上保留了蛋白质序列的原始信息,但是它产生的相应的维数会很高,这使得蛋白质亚细胞位置的预测过程变得很复杂。同时,就目前的情况来看,想要获取大量已标记的蛋白质亚细胞位置样本也很困难。为了解决这些问题,提出采用半监督降维算法(SS-MVP)对特征向量进行降维的同时能从标记和未标记的样本点中提取对分类有用的信息。基于降维后的样本利用支持向量机(SVM)的算法来预测蛋白质亚细胞位置类型。实验结果表明,采用上述方法既能简化蛋白质亚细胞位置的预测系统,又能提高其分类性能。
- 王彤薛建新谭文安
- 关键词：蛋白质亚细胞定位降维
- 面向收敛的并发程序执行轨迹静态简化方法被引量：1
- 2017年
- 轨迹静态简化技术是在确保与原轨迹等价的前提下,通过随机减少程序执行时线程切换的数量,达到提高程序员调试并发程序效率的目的.然而,轨迹中可减少的线程切换分布往往是不均匀的,因此,随机简化策略难以有效地发现可简化的线程切换.为此,提出了面向收敛的合并算法致力于这个问题.该算法的基本思想是:不断地随机选择一线程执行区间作为中心,在同一线程内,采用面向收敛的合并算法迭代地寻找可与其合并的前置执行区间和后置执行区间.实验结果表明,该方法可以高品质地减少执行轨迹中的线程切换数量,进而有助于程序员快速发现引发错误的线程交错.
- 常曦薛建新张卓毛晓光
- 关键词：并发程序
- 消息代理中间件的SOAP协议扩展机制研究被引量：2
- 2006年
- 本文首先指出SOAP具有穿透防火墙的特性;接着给出了SOAP协议的通用桥和专用桥扩展模型,并设计了基于XML-RPC的SOAP协议专用桥扩展机制;最后,基于该机制实现了消息代理中间件InforBroker的SOAP协议扩展。
- 薛建新吴泉源刘江宁常曦
- 关键词：消息代理中间件SOAPXML-RPC
- 基于任务驱动的《大学计算机文化基础》课程教学模式研究与实践被引量：13
- 2008年
- 《大学计算机文化基础》是非计算机专业学生掌握计算机技术的入门课程,授课的对象广,且已经具有一定的计算机基础操作能力。如何在有限的课时中,让学生掌握计算机基础知识并灵活运用于本专业的学习过程,是一个有待研究的问题。本文探讨了如何采用基于任务驱动的方法进行《大学计算机文化基础》的教学,提高学生主动学习意识以及灵活运用知识的能力。
- 罗新密薛建新常曦
- 关键词：教学模式教学改革
- 面向创新应用的“智能机器人”层次化实践教学框架被引量：3
- 2017年
- 多学科交叉性质增加了智能机器人课程实践教学难度,如何高效开展实践教学环节提升创新应用能力成为关注的重点。依托计算机科学与技术学科背景,基于循序渐进和学生自主选择原则,提出面向创新应用的层次化实践教学框架,即"基础—综合—创新应用"3个层次:基础层熟悉和掌握基本功能,激发学生的学习兴趣;综合层关注主流应用场景的关键功能,提升学生的创新能动性;创新应用层取材于竞赛项目和企业项目,实现学生对教学内容的创新应用。
- 薛建新常曦蒋川群
- 关键词：智能机器人实践教学
- 虚拟仪器在智能机器人实践课程中的应用被引量：1
- 2017年
- 智能机器人课程是一门多学科交叉课程,其教学内容和教学方式需要根据具体学科有所侧重。文章针对如何使学生快速掌握智能机器人的操作技能这一问题,提出在计算机科学与技术学科中,将虚拟仪器开发环境LabVIEW引入智能机器人实践课程,将多学科设计问题转变为软件设计问题,将设备操作问题转换为可视化编程问题,充分发挥学科的软件设计优势,降低入门门槛。
- 常曦薛建新张世明蒋川群
- 关键词：智能机器人虚拟仪器LABVIEW实践课程
- 增强上下文的错误定位技术被引量：4
- 2019年
- 错误定位就是寻找程序错误的位置.现有的错误定位方法大多利用测试用例的覆盖信息,以标识一组导致程序失效的可疑语句,却忽视了这些语句相互作用导致失效的上下文.因此,提出一种增强上下文的错误定位方法Context-FL,以构建上下文的方式来优化错误定位性能.Context-FL利用动态切片技术构建数据与控制相关性的错误传播上下文,显示了导致失效的语句之间传播依赖关系;然后,基于可疑值度量来区分上下文片段中不同语句的可疑度;最后,Context-FL以标记可疑值的上下文作为定位结果.实验结果表明,Context-FL优于8种典型错误定位方法.
- 张卓谭庆平毛晓光雷晏常曦薛建新
- 关键词：上下文动态切片
- 细菌性病原体内病毒蛋白的预测和研究被引量：1
- 2016年
- 确定细菌性病原体内某种未知蛋白质是否属于病毒蛋白非常重要。如果是病毒蛋白,研究其在病原体内的致病机制能有助于设计出抗病毒药物。特别是,近几年发现大量的病毒蛋白质序列,如果仍用传统的物理化学方法去测定非常困难,找到能自动预测细菌性病毒蛋白的方法迫在眉睫。首先采用基因本体论(Gene Ontology,GO)和特定位点记分矩阵(Position-Specific Score Matrix,PSSM)的组合特征表达方法编码蛋白质序列,接着采用流形学习方法对编码后的高维蛋白质特征向量进行维数约简。然后把约简后的特征向量,输入K近邻(K Nearest Neighbor,KNN)分类器进行训练,利用训练好的分类器预测未知蛋白是否为病毒蛋白。最后,采用Jackknife测试方法检验预测准确率,测试结果表明上述方法是十分有效的,能解决细菌性病原体中病毒蛋白预测这个复杂的问题。
- 王彤薛建新孔亮亮
- 关键词：病毒蛋白
- 基于对抗生成网络的缺陷定位模型域数据增强方法
- 2024年
- 缺陷定位获取并分析测试用例集的运行信息,从而度量出各个语句为缺陷的可疑性.测试用例集由输入域数据构建,包含成功测试用例和失败测试用例两种类型.由于失败测试用例在输入域分布不规律且比例很低,失败测试用例数量往往远少于成功测试用例数量.已有研究表明,少量失败测试用例会导致测试用例集出现类别不平衡问题,严重影响着缺陷定位有效性.为了解决这个问题,提出基于对抗生成网络的缺陷定位模型域数据增强方法.该方法基于模型域(即缺陷定位频谱信息)而非传统输入域(即程序输入),利用对抗生成网络合成覆盖最小可疑集合的模型域失败测试用例,从模型域上解决类别不平衡的问题.实验结果表明,所提方法大幅提升了11种典型缺陷定位方法的效能.
- 张卓雷晏毛晓光薛建新常曦
- 关键词：测试用例
