詹仪花
- 作品数:4 被引量:3H指数:1
- 供职机构:浙江大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金浙江省科技厅资助项目更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 高粱Pht1基因家族的鉴定及其进化和表达分析被引量:1
- 2017年
- 磷是生物大分子的重要组成成分,也是植物生长所必需的重要营养元素。利用Phytozome数据库,通过拟南芥Pht1家族、水稻OsPht1家族基因序列在高粱全基因组中的同源比对,鉴定并获得了11个高粱Pht1家族成员的基因序列、基因结构、蛋白序列和染色体定位等信息。利用荧光定量的方法,检测了11个SbPht1基因在缺磷和高磷处理下的表达差异。结果表明,在缺磷条件下,大部分SbPht1基因表达量上升。高磷胁迫下,SbPT1、SbPT4、SbPT6、SbPT7、SbPT8、SbPT9和SbPT10在根中的表达量上升,SbPT3和SbPT5在地上部的表达量上升。分析高粱全基因组磷转运蛋白,对于研究植物在磷吸收过程中的分子生物学基础,改良植物吸收和利用磷素意义重大。
- 俞晨良张成浩詹仪花董文其
- 关键词:高粱磷元素
- RIXI过量表达转基因水稻的全基因组表达谱分析(英文)
- 2016年
- 为研究水稻植株中木聚糖酶抑制剂基因RIXI过量表达是否会引起其他基因的差异表达,利用转录组测序(RNA-Seq)技术结合数字基因表达谱分析对RIXI过量表达单拷贝纯合株系R7进行基因差异表达分析。水稻全基因表达谱显示,RIXI过表达引起水稻中大量基因的表达差异,包括391个上调基因,905个下调基因。GO分析将差异基因分成30个功能聚类,其中的5组聚类中含有较多的差异基因,分别为单个有机体代谢过程、生物调控、阴离子结合、小分子结合和核苷酸结合。利用KEGG数据库,通过Pathway显著性富集确定差异表达基因参与主要生化代谢途径和信号转导途径。与整个水稻基因组背景WT相比,R7的差异表达基因包含在98个KEGG通路中,包含差异基因数量最多的4个KEGG通路分别为代谢通路、次级代谢的生物合成、植物与病原菌互作和激素信号传导。农艺性状测量显示,RIXI过表达对水稻生长发育几乎没有影响。以上结果说明,木聚糖酶抑制剂基因RIXI可能在各种生物和非生物胁迫中激活复杂的信号传导,但对水稻的生长和发育没有负面影响。
- 彭耀耀侯春晓詹仪花黄莹莹孙翔宇翁晓燕
- 关键词:转基因水稻转录组测序植物防御
- 水稻内源木聚糖酶osx基因的克隆及表达分析被引量:2
- 2013年
- 为进一步了解植物内源木聚糖酶基因结构及其表达特性,从水稻中克隆和表达了一种内源木聚糖酶基因。通过序列比对分析确定保守区序列,以PCR扩增得到的保守区序列从众多水稻木聚糖酶预测序列中"钓取"可能的目标基因,并以此基因为模板设计引物,通过RT-PCR扩增得到一条长度为1 443 bp的基因片段osx,测序结果与水稻木聚糖酶基因预测序列NM_001061680一致性高达99%,该序列编码480个氨基酸,经预测不存在信号肽序列。构建表达载体pET28-a(+)-osx,导入大肠杆菌BL21进行IPTG诱导表达,该表达产物未检测到木聚糖酶活性。受大麦和玉米内源木聚糖酶基因表达的前体为无活性蛋白需要剪切加工的启示,进一步通过在线蛋白同源建模分析,设计引物去掉蛋白N端约120个氨基酸,C端约40个氨基酸,保留"Glyco-hydro-10"结构域,使其成功实现了原核活性表达,表达蛋白约40 kDa,木聚糖酶活性为11.53 IU/mL。
- 黄莹莹马明章孙仁杰詹仪花翁晓燕
- 关键词:水稻木聚糖酶基因同源建模
- 一种杂合木聚糖酶atxb的制备方法
- 一种杂合木聚糖酶atxb的制备方法,将来源于褐色高温单孢菌木聚糖酶A的连接序列和木聚糖结合域融合在杂合木聚糖酶atx的C-末端,获得杂合木聚糖酶atxb。该杂合酶水解桦木木聚糖所得的主要为低聚木糖,主要产物为木二糖和木三...
- 翁晓燕刘明启詹仪花孙建义
- 文献传递