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郑瑞清

作品数：15 被引量：1H指数：1
供职机构：中南大学更多>>
发文基金：教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家自然科学基金更多>>
相关领域：自动化与计算机技术生物学医药卫生更多>>

合作作者

文献类型

  • 14篇专利
  • 1篇期刊文章

领域

  • 4篇自动化与计算...
  • 1篇生物学
  • 1篇医药卫生

主题

  • 6篇细胞
  • 6篇基因
  • 6篇基因表达
  • 6篇基因表达数据
  • 5篇网络
  • 5篇矩阵
  • 5篇矩阵计算
  • 4篇调控网络
  • 4篇时间片
  • 4篇时滞
  • 4篇基因调控
  • 4篇基因调控网络
  • 3篇聚类
  • 2篇蛋白
  • 2篇蛋白质
  • 2篇点对点
  • 2篇多时滞
  • 2篇信号
  • 2篇信号传导
  • 2篇亚细胞

机构

  • 15篇中南大学

作者

  • 15篇郑瑞清
  • 14篇李敏
  • 4篇王建新
  • 2篇李文凯
  • 2篇田宇
  • 1篇李敏

传媒

  • 1篇生物信息学

年份

  • 1篇2024
  • 1篇2023
  • 3篇2022
  • 3篇2021
  • 1篇2020
  • 1篇2019
  • 3篇2018
  • 1篇2016
  • 1篇2014
共 15 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
基于拓扑特性的稀有类型细胞检测方法、系统及设备
本公开实施例中提供了一种基于拓扑特性的稀有类型细胞检测方法、系统及设备，属于数据处理技术领域，具体包括：输入一个单细胞表达谱、N个细胞和M个基因，计算KNN最近邻距离矩阵X；根据每个细胞与其他k个近邻细胞的距离向量，计算...
李敏郑瑞清刘澜
一种基于多元格兰杰检验的信号传导网络构建方法
本发明公开了一种基于多元格兰杰检验的信号传导网络构建方法，对输入的时序基因表达数据进行二范数规范化；对二范数规范化后的t个时间片的基因表达数据，分别构建1～t?1和2～t时序基因表达矩阵，并建立基于阶马尔卡夫的线性方程，...
李敏郑瑞清王建新
一种基于双向XGBoost的基因调控网络构建方法
本发明公开了一种基于双向XGBoost的基因调控网络构建方法，针对时间序列基因表达数据的特点，分析t时刻基因的表达值与其他基因t时刻点前与后的关系，建立local‑in和local‑out双向模型；在单个模型中，将基因调...
李敏郑瑞清
文献传递
基于蛋白质时空子网络的关键蛋白质识别方法及识别系统
本发明公开了一种基于蛋白质时空子网络的关键蛋白质识别方法及识别系统，包括如下步骤：步骤1：获取原始蛋白质网络；步骤2：构建不同时刻的活性蛋白质集合；步骤3：构建不同亚细胞结构中的蛋白质集合；步骤4：依据蛋白质节点之间的连...
李敏李文凯郑瑞清王建新
一种基于相似性学习及其增强的细胞类型鉴定方法
本发明公开了一种新的基于相似性学习及其增强的细胞类型鉴定的方法，该方法设计了一种新的全局相似性计算方法，同时结合另外三种常规的局部相似性信息，对基因做了筛选并且对具有稀疏性质的全局相似性做了增强处理。本发明的方法不仅使用...
李敏梁珍兰郑瑞清
文献传递
基于WEB的关键蛋白质预测平台被引量：1
2014年
关键蛋白质是指那些在蛋白质相互作用网络中承担重要作用、移除后会使蛋白质复合物功能丧失并导致生物无法存活的节点。随着蛋白质数据库的不断完善和高通量技术的发展,使得通过计算方法的关键蛋白预测得到广泛应用。针对目前软件多为桌面应用程序、用户难以迅速适应的情况,本文设计并实现了一个基于WEB的关键蛋白质预测平台EssentialProtein Finder(EP Finder)。该平台集成了DC、BC、CC、EC、LAC、SC和NC7种关键蛋白质预测算法,还提供包含SN、SP、PPV、NPV、ACC、F和折刀曲线图在内的7种评估方法。平台对蛋白质网络图、算法运行及评估结果提供了可视化展示。该平台具有良好的扩展性。
郑瑞清李敏
关键词：蛋白质网络WEB平台
一种基于二维分布结构判定的单细胞转录组测序数据聚类推荐方法
本发明公开了一种基于二维分布结构判定的单细胞转录组测序数据聚类推荐方法，包括：获取多个细胞的单细胞转录组测序数据得到的基因表达矩阵，在过滤和标准化处理后，构建二维特征矩阵并进行线性归一化；根据归一化后的二维特征矩阵计算细...
李敏田宇郑瑞清
文献传递
一种基于相似性学习及其增强的细胞类型鉴定方法
本发明公开了一种新的基于相似性学习及其增强的细胞类型鉴定的方法，该方法设计了一种新的全局相似性计算方法，同时结合另外三种常规的局部相似性信息，对基因做了筛选并且对具有稀疏性质的全局相似性做了增强处理。本发明的方法不仅使用...
李敏梁珍兰郑瑞清
文献传递
一种针对不平衡单细胞RNA-seq数据的细胞聚类方法、设备和介质
本发明公开了一种针对不平衡单细胞RNA‑seq数据的细胞聚类方法、设备和介质，方法包括：获取聚类细胞的RNA‑seq数据，生成基因表达矩阵并预处理；利用基因表达矩阵计算各细胞间的相似度，选出近似细胞作为对比学习的附加增强...
郑瑞清李敏刘锦曾未星
基于蛋白质时空子网络的关键蛋白质识别方法及识别系统
本发明公开了一种基于蛋白质时空子网络的关键蛋白质识别方法及识别系统，包括如下步骤：步骤1：获取原始蛋白质网络；步骤2：构建不同时刻的活性蛋白质集合；步骤3：构建不同亚细胞结构中的蛋白质集合；步骤4：依据蛋白质节点之间的连...
李敏李文凯郑瑞清王建新
文献传递
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