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2022年北京市通州区一起霍乱疫情分离菌株的病原学特征分析: 2023年; 目的分析2022年北京市通州区一起霍乱弧菌引起的疫情的病原学特征,并与引起通州区过往疫情的菌株进行比对分析。方法用实时荧光PCR方法检测样本中O1/O139群霍乱弧菌的特异性基因,同时按常规法对样本进行菌株的分离培养鉴定;用普通PCR方法检测霍乱弧菌的11种毒力基因;用微量肉汤稀释法进行12种药物的敏感性试验,采用NotⅠ限制性内切酶进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)和聚类分析,基于全基因组序列进行菌株遗传学分析。结果本次疫情共检出5株O1群小川型非产毒霍乱弧菌,所有菌株均携带ompU、toxR、tcpI、tcpA^(EL)、hlyA^(EL)、hlyA^(CL)和rtxC基因,不携带ctxAB基因,5株菌耐药情况一致,均为美罗培南–头孢噻肟–头孢他啶–链霉素–氨苄西林–氨苄西林/舒巴坦6种药物耐药,为多重耐药菌株。PFGE分6种带型Ⅰ~Ⅵ,本次疫情菌株带型为Ⅱ型。与通州区既往检出的菌株相比,与2011年2株产毒O1群小川型霍乱弧菌带型较为接近,耐药情况一致,毒力基因携带情况有所差异,但都携带tcpA^(EL)基因。遗传学分析显示本次疫情菌株为不同于第七次世界大流行菌株的新出现的克隆群。结论通州区流行的O1群霍乱菌株以多重耐药小川型非产毒株为主,PFGE带型分散,本次疫情菌株是新出现的克隆群,以后的霍乱防控工作中应重视此类菌株并制定相应的策略。; 张萍邹林高翔杨郝亮甄博珺李伟红郭晓晨林长缨李仁清严寒秋逄波; 关键词：O1群霍乱弧菌毒力基因脉冲场凝胶电泳遗传学分析

综合指数法建立北京市诺如病毒急性胃肠炎流行水平分级标准被引量：4: 2019年; 目的建立北京市诺如病毒急性胃肠炎流行水平分级标准,针对不同流行水平制定相应防控措施建议.方法利用北京市2014—2018年4个流行季诺如病毒急性胃肠炎病原学及聚集性疫情监测数据,采用综合指数法,对原始监测数据进行标准化处理,赋予不同权重,计算周综合指数并划分流行强度等级.结果 4个流行季共208个监测周的综合指数值范围为0.2~4.4,中位数为0.5.将诺如病毒急性胃肠炎流行水平分为5个等级,等级1~5强度递增.0.5为流行期与非流行期的划分阈值,0.8、1.5和3.5分别作为流行强度等级2~5的划分阈值.经专家研讨制定相应等级防控建议.结论本研究建立了北京市诺如病毒急性胃肠炎流行水平分级标准,并提出相应防控措施,为2018—2019年流行季的防控工作提供了依据.; 王宇贾蕾高志勇刘白薇田祎严寒秋李伟红王小莉王全意; 关键词：诺如病毒急性胃肠炎综合指数法

2011—2018年北京市门诊儿童轮状病毒检出率的季节特征分析及模型预测被引量：3: 2019年; 目的分析2011—2018年北京市门诊儿童轮状病毒检出率的季节性分布规律,探讨合适的预测模型。方法采用圆形分布法对2011年7月—2018年6月北京市门诊儿童轮状病毒检出率的时间分布特征进行分析,应用Eviews 9.0构建和优化SARIMA模型,模型预测2018年7—12月北京市门诊儿童轮状病毒检出率,并与实际值进行比较验证模型。结果2011—2018年北京市门诊儿童轮状病毒的检出存在季节性(M=0.59),除2012—2013年度外,流行趋势基本相同。高峰集中在冬春季(11月—次年1月),每年均存在高峰日和高峰期,但各年的高峰日不全相同(F=9.23,P<0.05)。最优模型为SARIMA(1,1,1)×(1,0,2)12,预测的平均绝对误差为5.65%。结论2011—2018年冬春季北京市门诊儿童轮状病毒检出率较高,SARIMA(1,1,1)×(1,0,2)12模型拟合效果较好,可用于北京市门诊儿童轮状病毒检出率的预测。; 田祎严寒秋高志勇刘白薇陈艳伟李伟红贾蕾王全意; 关键词：轮状病毒圆形分布法 SARIMA模型

北京市市售结球生菜诺如病毒和轮状病毒污染状况调查被引量：2: 2020年; 目的调查北京市市售结球生菜诺如病毒(norovirus,NoV)和轮状病毒(rotavirus,RV)污染情况。方法2015年11月至2016年10月,在北京市某菜市场摊位采集结球生菜54件。用离心法和直接法,分别对应3种洗脱液洗脱菜叶中病毒并浓缩,用荧光PCR法检测NoV和RV核酸。用半巢式RT-PCR方法扩增NoV阳性样本的衣壳蛋白区基因,PCR产物直接测序,用BioEdit7.0.9.0软件进行序列比对,用MEGA6.06软件构建进化树。结果54件结球生菜,未检出RV。NoV总检出率为11.1%(6/54),其中GI组1件、GⅡ组3件、GI/GⅡ组混合2件。春夏秋冬季检出率依次为8.3%(1/12)、0.0%(0/8)、28.6%(4/14)和5.0%(1/20)。1件GⅡ阳性样本测序成功,为GⅡ.3基因型,该毒株与2014年广东省人源毒株KY348698相似性最高100.0%。结论北京市市售部分结球生菜存在人源NoV污染,生食未洗净结球生菜有引起病毒性急性胃肠炎的风险。; 严寒秋陈艳伟田祎李伟红刘白薇高志勇王全意; 关键词：结球生菜诺如病毒轮状病毒基因型

90例病毒性胃肠炎患者粪便中诺如病毒检出情况分析被引量：20: 2008年; 目的了解病毒性胃肠炎患者中诺如病毒感染情况。方法收集北京市2007年2月5～17日共计90例病毒性胃肠炎患者的粪便标本,应用逆转录聚合酶链反应法(RT-PCR)和酶联免疫吸附试验(ELISA)检测粪便中诺如病毒核酸或抗原,并对RT-PCR阳性标本的PCR产物进行克隆测序。结果90例病毒性胃肠炎患者的粪便标本中,35例(38.89%)RT-PCR为诺如病毒核酸阳性,序列分析结果显示,诺如病毒GⅡ型34例(97.14%),GⅠ型1例(2.86%);90例中,39例(43.33%)为ELISA检测诺如病毒抗原阳性。以RT-PCR检测结果作为金标准进行比较,ELISA的灵敏度和特异度分别为97.14%(34/35)和90.91%(50/55)。结论诺如病毒是病毒性胃肠炎的主要病原,以GⅡ型流行为主。ELISA快速、简便,其灵敏度和特异度较高,可作为诺如病毒感染的初筛试验。; 高志勇吕虹黄芳吴晓娜严寒秋刘园刘桂荣李洁窦相锋王全意庄辉; 关键词：诺如病毒病毒性胃肠炎

2018年北京市O1群霍乱弧菌表型及分子分型特征分析被引量：6: 2019年; 目的了解2018年北京市O1群霍乱弧菌表型及分子分型特征。方法 2018年收集北京市霍乱患者和外环境分离的29株霍乱弧菌,应用常规鉴定方法进行血清分型,荧光定量PCR检测霍乱弧菌ctxAB基因,应用96孔微量肉汤稀释法进行药物敏感试验(11类21种试验药物),应用NotⅠ及ShifⅠ酶切进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型。结果 29株O1群霍乱弧菌中小川型非产毒株、稻叶型非产毒株和小川型产毒株构成比分别为62.07%(18/29)、24.14%(7/29)和13.79%(4/29);29株菌头孢唑林耐药率最高82.76%,美罗培南敏感率100.00%;28株菌耐药;有9种耐药型别,最多耐13种药;有13种耐药类别,最多耐7类药;29株菌株PFGE分子分型为16个型别(BJ1801~1816)。结论北京市O1群霍乱弧菌以非产毒株为主,多重耐药严重;PFGE分子分型结果提示应注意食品安全问题,特别要加强水产品的监测。; 严寒秋李夫吕冰黄瑛张新贾蕾周海健曲梅王全意; 关键词：O1群霍乱弧菌表型脉冲场凝胶电泳

人类札如病毒流行概况被引量：14: 2017年; 1976年英国学者MadeleycR等使用电镜首次在人粪便标本中观察到直径约30nm的猫杯状病毒样颗粒，呈“大卫”星（star of David）状。此后其他研究者也有类似的发现。1979年Chiba S等对日本札幌市的一起急性胃肠炎暴发疫情进行调查，在患者粪便标本中也发现类似的病毒颗粒，实验室检测结果和流行病学证据证实了该病毒在人急性胃肠炎中的致病作用。; 周锦辉严寒秋高志勇; 关键词：札如病毒流行病学基因型

北京市成人诺如病毒性腹泻流行病学调查被引量：21: 2010年; 目的探讨北京市成人诺如病毒性腹泻的流行病学特点。方法采集2007年10月~2008年1月在中日友好医院就诊的232例成人急性腹泻患者的粪便样本,用酶联免疫吸附试验（ELISA）检测粪便诺如病毒抗原。统计学处理采用SPSS 10.0统计软件,率的差异用χ2检验,P〈0.05为差异有统计学意义。结果232份粪便样本中诺如病毒抗原阳性136例,阳性率为58.62%,各年龄组间阳性率差异无统计学意义（P〉0.05）。10月份诺如病毒检出率最高,为63.30%（69/109）,12月份检出率最低,为44.44%（20/45）,差异有统计学意义（P〈0.05）。136例诺如病毒阳性患者中,出现呕吐症状者占47.79%（65/136）,而诺如病毒阴性患者为26.04%（25/96）,差异有统计学意义（P〈0.001）。结论本调查研究表明,诺如病毒是北京市秋冬季成人散发性腹泻的主要病原体,成人诺如病毒性腹泻患者易出现呕吐症状。; 高志勇徐潜袁利超严寒秋窦相峰李洁黄芳王全意庄辉; 关键词：诺如病毒急性腹泻流行病学

2017-2019年北京市人源性副溶血性弧菌病原学特征分析被引量：5: 2021年; 目的分析2017-2019年北京市引起腹泻的副溶血性弧菌血清分型、毒力基因携带情况以及抗菌药物敏感性。方法对北京市2017-2019年肠道门诊监测中分离到的295株副溶血性弧菌进行血清学分型试验,应用实时荧光PCR方法检测不耐热溶血毒素基因(tlh)、耐热直接溶血毒素基因(tdh)和耐热相关溶血毒素基因(trh),用微量肉汤稀释法进行26种抗菌药物最低抑菌浓度(MIC)测定。结果295株副溶血性弧菌有8个O群和19个K型,共28种血清型,以O3∶K6血清型为主,占63.4%(187/295),其次为O4∶KUT,占11.2%(33/295)。295株副溶血性弧菌tlh、tdh和trh基因阳性率分别为100.0%(295/295),91.9%(271/295)和2.4%(7/295)。3种毒力基因检测结果可以分成4种类型,tlh^(+)tdh^(+)trh^(-)为优势基因型,占90.5%(267/295)。药敏试验结果显示,295株分离菌株对阿奇霉素、环丙沙星、左氧氟沙星、氯霉素、阿莫西林-克拉维酸、米诺环素、亚胺培南、美罗培南和头孢噻肟100%敏感,对头孢唑林、链霉素和氨苄西林耐药率较高,分别为61.4%(181/295)、14.2%(42/295)和7.1%(21/295)。有12株菌出现多重耐药现象,占4.1%(12/295)。结论2017-2019年北京市引起腹泻的副溶血性弧菌有多种血清型,其中以O3∶K6为优势血清型。多数菌株为携带tlh和tdh基因的产毒株。菌株对多数抗菌药物比较敏感,但仍存在多重耐药现象。; 黄瑛吕冰张新严寒秋田祎贾蕾曲梅; 关键词：副溶血性弧菌血清型毒力基因耐药性

北京市市售花蛤诺如病毒和轮状病毒检出情况及基因特征分析被引量：2: 2021年; 目的了解北京市市售花蛤诺如病毒和轮状病毒检出情况,分析其基因特征。方法2014年11月-2015年10月,采集北京市三个水产品销售市场新鲜花蛤各24件。用两种方法对花蛤鳃和肠内容物进行病毒浓缩,提取核酸后用实时荧光RT-PCR法检测诺如病毒GI/GII组和A组轮状病毒核酸。用半巢式RT-PCR方法,扩增诺如病毒阳性样本衣壳蛋白VP1区基因,对PCR阳性产物进行测序,用诺如病毒分型工具进行基因亚型鉴定,用MEGA软件最大似然法构建进化树。结果72件花蛤中未检出A组轮状病毒,诺如病毒检出率为34.7%(25/72),GII组、GI组和GI/GII组混合检出率分别为27.8%(20/72)、4.2%(3/72)和2.8%(2/72)。11月诺如病毒检出率最高,为100.0%(6/6);三个水产销售市场诺如病毒检出率分别为25.0%(6/24)、50.0%(12/24)和29.2%(7/24)。10件测序成功,其中6株为GII.17,GII.6、GII.2、GI.3a和GI.4各1株。这些毒株与腹泻患者和外环境参考毒株相似性为97.9%~100.0%。结论北京市市售花蛤存在诺如病毒污染,而且与腹泻患者和外环境参考毒株高度同源,应加强花蛤及销售人群和环境的诺如病毒监测。; 王永全靳博崔海洋田祎严寒秋高志勇; 关键词：花蛤诺如病毒轮状病毒

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严寒秋

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