严志
- 作品数：3 被引量：5H指数：2
- 供职机构：北京大学肿瘤医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术更多>>
- MiR-375调控胃癌细胞系p53信号通路的生物学作用和分子机制
- miRNA由于能够调控肿瘤相关信号通路而逐渐成为临床诊断和治疗的新靶点.我们的前期工作显示miR-375在胃癌复发病人组织中高表达,并且可能调控p53基因,但是关于miR-375在胃癌发生发展中的生物学作用和分子机制尚不...
- 刘懿萱邢蕊张晓东张经余严志李文梅崔建涛吕有勇
- 关键词：胃癌P53电离辐射
- 基于双基因分析的结肠癌标志基因选择被引量：2
- 2009年
- 针对结肠癌标志基因选择问题,引入一种最高得分对(TSP)方法,处理一组包含40个肿瘤和22个正常样本的结肠癌微阵列数据,得到标志基因对(VIP,DARS)并构建双基因分类器。结果显示,该分类器对62例样本的分类准确率可达93.55%。进一步,利用荧光实时定量PCR在10个独立样本上检验所选基因对的分类效果,正确率为100%,表明该方法能有效地选择结肠癌标志基因,对临床诊断有积极的意义。
- 李建更高志坤严志阮晓钢
- 关键词：结肠癌
- 基于机器学习方法的胃癌分型标志基因提取被引量：3
- 2009年
- 基于机器学习方法寻找和发现新的胃癌亚型分类的相关基因,可以为探讨胃癌发生的分子机制及其基因水平的诊断和治疗提供标志和依据。试验选用33例中国人的胃癌Oligo基因芯片数据,数据包括13例弥漫型胃癌样本2、0例肠型胃癌样本,基因向量为21 378个。采用基因表达差异显著性分析方法(SAM)、偏最小二乘VIP系数法(PLS)和基于巴氏距离的顺序前向搜索方法(BD-SFS)结合的多步骤降维方法,提取到20个能将弥漫型样本和肠型样本有效分开的特征基因。这些特征基因基于支持向量机(SVM),分类准确率可达到89.43%;基于分层聚类分析,准确率可达到93.94%。同时,基因生物学意义的分析结果显示,所选的大部分标志基因对于人类恶性肿瘤的诊断和分型有很重要的意义。
- 李建更李萍严志李君阮晓钢
- 关键词：胃癌基因表达谱
