吴斌
- 作品数：61 被引量：634H指数：13
- 供职机构：江苏省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：江苏省自然科学基金国家自然科学基金江苏省医学重点人才培养基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 儿童手足口病影响因素病例对照研究被引量：94
- 2011年
- 目的探讨儿童手足口病（hand-foot-mouth disease,HFMD）发生的影响因素。方法收集江苏省手足口病哨点监测医院手足口病临床病例396例,肠道病毒71型（enterovirus 71,EV71）感染的手足口病病例195例,分别进行1：1配对病例对照研究,应用SPSS 13.0软件进行单因素和多因素条件logistic回归分析。结果多因素条件Logis-tic回归分析表明,城乡（OR=1.999,95%CI=1.433~2.789）、家庭收入（OR=0.806,95%CI=0.692~0.938）、饭前便后洗手情况（OR=0.719,95%CI=0.590~0.877）、最近1周外出就餐情况（OR=1.914,95%CI=1.019~3.596）、最近1周接触患者史（OR=3.771,95%CI=2.137~6.654）为手足口病临床病例的影响因素;城乡（OR=2.417,95%CI=1.522~3.839）、饭前便后洗手情况（OR=0.693,95%CI=0.517~0.929）、近1周接触患者史（OR=3.942,95%CI=1.808~8.594）为EV71感染的手足口病影响因素。结论居住地为农村,最近1周患者接触史是手足口病发病的主要影响因素;饭前便后洗手是降低感染机会的保护因素。
- 李亮许可祁贤史智扬朱凤才吴斌霍翔祖荣强汤奋扬汪华
- 关键词：手足口病肠道病毒71型病例对照影响因素
- 实时荧光定量PCR在预防性健康体检沙门菌快速筛查中的应用效果被引量：5
- 2018年
- 目的探讨real-time PCR在从业人员沙门菌快速筛查中的应用效果。方法采集从业人员肛拭子样本,分别用real-time PCR方法及分离培养法对沙门菌进行检测,并比较检测结果。结果以分离培养法为金标准,real-time PCR进行筛检试验,结果灵敏度为100.0%,特异度为98.1%,阳性似然比为51.63,阴性似然比为0,符合率为98.2%,Kappa值为0.87,阳性预测值为78.1%,阴性预测值为100.0%。从成本效益分析来看,real-time PCR虽在检测成本上略高于分离培养法,但可节省大量的人力,缩短健康证办证时间,提高办证效率。结论 real-time PCR方法结果判读客观性强,且灵敏度高、特异性强,省时省力,可用于从业人员沙门菌的快速筛查中。
- 刘晓骏张宏宾吴斌
- 关键词：实时荧光定量PCR沙门菌健康体检
- 江苏省肠道病毒71型分离株的分子遗传进化特征
- 目的 了解肠道病毒71型(ENTEROVIRUS 71，EV71)江苏流行株的遗传学背景。方法 RT-PCR反应测定江苏株EV71_JIANGSU.P.R.C-07.08_10(以下简称JIANGSU01)的全基因组序列...
- 吴斌田华秦圆方邓斐祁贤朱凤才羊海涛汪华汤奋扬李亮崔仑标王慎骄付建光闫强徐飞海葛胜祥
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- 江苏省2009年手足口病聚集性病例流行特征分析
- 目的 描述江苏省2009年手足口病(HAND-FOOT-AND-MOUTH DISEASE，HFMD)聚集性病例疫情的流行特征。方法 通过“疾病监测信息报告管理系统”收集江苏省2009年手足口病聚集性病例疫情的规模、时间...
- 李亮孟繁岳吴斌汤奋扬祁贤许可嵇红朱凤才祖荣强霍翔
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- 江苏省盐城市1999-2008年狂犬病流行病学研究被引量：2
- 2010年
- 目的分析盐城市狂犬病的流行病学特征。方法收集狂犬病疫情资料，开展犬密度、犬免疫率、犬伤人率及狂犬病处置门诊工作调查；检测犬脑中狂犬病毒并进行相关分子生物学研究。结果1999—2008年盐城市共报告135例人狂犬病，形成自1958年以来的第二次流行高峰，其中2003年报告40例狂犬病。135例患者中114例为农民。监测点调查发现盐城市犬密度为每100人中约豢养犬3～6只，每年平均100只犬伤人6．37人次，2008年犬的免疫率只有20％，暴露人群狂犬病疫苗接种率为77％。狂犬病处置门诊中抗狂犬病血清（球蛋白）的使用率仅为5％～10％。在采集108份犬脑标本中，4份狂犬病毒阳性，扩增、测序并分析病毒的N和G基因显示，这些病毒为基因1型狂犬病毒，与目前使用的狂犬疫苗株CTN同源性最高。结论盐城市人间狂犬病的持续流行与当地犬的饲养量大、免疫率低以及农村地区群众受动物伤害后的处理不及时规范及处理率低密切相关。
- 姜仁杰覃新程金加洪张红军李明慧沈进进陈昌标陈胤忠吴斌张永振
- 关键词：狂犬病流行病学
- 新型冠状病毒非结构蛋白1重要变异对其与病毒5’UTR结合能力的影响
- 2023年
- 目的探讨新型冠状病毒(2019 novel coronavirus,2019-nCoV)非结构蛋白1(NSP1)重要变异对其与病毒5’UTR结合能力的影响,为抗病毒药物和疫苗的研发提供线索。方法对2019-nCoV基因组数据库进行生物信息分析,选取可能影响NSP1结构及与5’UTR的结合能力的氨基酸变异位点(T12A、R124L、N128I、K141A、GHVMV82-86DEL及KSF141-143DEL),PSIPRED在线工具分析变异体的二级结构,mCSM-NA预测其与RNA的结合能力,DynaMut webserver分析变异对蛋白稳定性的影响;构建变异体质粒,转染HEK-293T细胞,利用双荧光素酶报告基因实验和RNA结合蛋白免疫沉淀(RNA binding protein immunoprecipitation,RIP)实验检测NSP1变异体与病毒5’UTR的结合能力。结果生物信息分析预测除了R124L突变外,其他5种变异体均可改变蛋白二级结构,T12A、R124L、N128I和K141A突变均可以降低与RNA的结合能力,而T12A、R124L、N128I突变降低了蛋白质的稳定性,实验表明R124L、N128I、GHVMV82-86DEL及KSF141-143DEL显著减弱了NSP1与5’UTR的结合能力。结论部分NSP1氨基酸突变或缺失可改变其二级结构,并能够显著减弱NSP1与5’UTR的结合能力,提示可能改变病毒的致病能力,为抗病毒药物和疫苗的研发提供了理论依据。
- 乔乔朱小娟吴斌吴涛赵康辰葛以跃崔仑标
- 关键词：新型冠状病毒变异体生物信息分析
- 基于GroEL基因的实时荧光定量PCR检测恙虫病东方体方法的建立及评价被引量：4
- 2014年
- 目的建立一种敏感、特异的实时荧光定量PCR方法,用于检测临床标本中的恙虫病东方体。方法根据恙虫病东方体GroEL蛋白基因序列设计引物和探针,建立实时荧光定量PCR检测方法。并从灵敏度、特异度、重复性及临床标本的检测能力等方面对本方法进行综合评价。结果建立的实时荧光定量PCR方法具有良好的特异性,可检测出恙虫病东方体Gilliam、Karp、Kato和Kawasaki株。建立的标准曲线循环阈值(Ct)与模板拷贝数呈现良好的线性关系(r=0.99),灵敏度分析显示样品最低检出浓度为21.8拷贝/μL。批内及批间重复性实验变异系数均小于1.5%,显示本方法具有良好的重复性。对本实验室保存的82份临床标本进行检测,并与常规巢式PCR方法比较,本方法检测出26份阳性标本中的25份,检出率为96.15%。结论本研究建立的实时荧光定量PCR方法具有较高的敏感性、特异性和稳定性,可用于临床病人及暴发疫情的实验室快速检测。
- 谈忠鸣李志峰吴斌胡建利祁贤顾玲鲍倡俊汤奋扬朱叶飞
- 关键词：恙虫病东方体荧光定量PCR临床标本
- 江苏省苏州及南京地区2010年婴幼儿腹泻中诺如病毒分子流行病学研究被引量：9
- 2011年
- 目的 了解江苏地区婴幼儿腹泻患者中诺如病毒的感染情况,明确该地区诺如病毒的主要基因型别和流行病学特征.方法 收集2010年江苏省苏州市婴幼儿医院及南京市婴幼儿医院疑似病毒性腹泻粪便标本498例,采用荧光定量PCR方法检测粪便中诺如病毒RNA及其基因组别,并对部分阳性标本测序以明确基因型.结果 498份粪便标本中,GⅠ组诺如病毒阳性标本为2例,阳性率为0.4％,GⅡ组诺如病毒为190例,阳性率为38％,对本地区部分诺如病毒阳性标本进行测序,2份GⅠ标本中,一株为GⅠ1型,另一株为GⅠ3型；测序的23份GⅡ标本中21株为GⅡ4型,2株为GⅡ3型.结论 诺如病毒是本省婴幼儿病毒性腹泻的重要病原体,以诺如病毒GⅡ4型为主,同时也存在其他型别的感染流行.
- 付建光吴斌嵇红李亮祁贤秦圆方王慎骄邓斐李志锋汤奋扬祖荣强鲍昌俊
- 关键词：诺如病毒基因型系统进化树
- 新型冠状病毒N亚基因组荧光定量PCR检测方法的建立及初步应用
- 2023年
- 目的建立一种快速检测新型冠状病毒N亚基因组(SgN)的方法,探讨其在新型冠状病毒肺炎病例及环境样本中的应用价值。方法根据全球共享流感数据库(GISAID)公布的新型冠状病毒全基因组序列设计SgN特异性引物和探针,优化退火温度、引物与探针浓度等反应条件,建立新型冠状病毒SgN荧光定量PCR检测方法,绘制标准曲线,评价该方法的灵敏性、重复性和特异性。采用建立的病毒SgN荧光定量PCR检测方法检测21份环境和351份临床样本,并选取25份SgN阳性样本进行病毒分离以评估该检测方法的应用效果。结果 SgN的引物和探针对新型冠状病毒具有良好特异性。初步建立的病毒SgN荧光定量PCR检测方法最低检测限为1.5×102copies/ml,变异系数小于1%。372份样本的gRNA阳性率为97.04%(361/372),gRNA阳性样本中阳性环境样本和阳性临床样本的SgN阳性率分别为36.84%(7/19)和49.42%(169/342)。其中野生型毒株样本的SgN阳性率及拷贝数均比德尔塔(Delta)毒株低。在25份SgN阳性样本中,采样时间在5 d内的12份样本均分离到病毒;13份采样时间在12 d以上的样本未发生细胞病变。结论成功建立了一种检测新型冠状病毒SgN的荧光定量PCR方法,该方法的灵敏度、特异性和重复性均较好。
- 朱小娟陈银吴斌葛以跃吴涛乔乔赵康辰崔仑标
- 关键词：新型冠状病毒荧光定量PCR
- 2020年江苏省306例不同特征新冠肺炎病例咽拭子病毒载量分布被引量：2
- 2022年
- 目的分析不同临床严重程度的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)病例咽拭子中的病毒载量,及与患者年龄、性别和发病间隔的关系,为深入了解SARS-CoV-2的传染性和致病性提供依据。方法采用实时荧光定量反转录聚合酶链式反应(RT-qPCR),对2020年江苏省306例入院前未经抗病毒治疗的新冠肺炎(COVID-19)病例咽拭子中SARS-CoV-2病毒载量进行检测,并对不同病情患者的病毒载量进行分析。结果306例新冠肺炎病例中,男性占56.9%,30~59岁占68.0%;普通肺炎型占66.7%,轻症无肺炎型占24.8%,重症肺炎型占8.5%;病例发病和首次SARS-CoV-2核酸阳性的发病间隔为-4~15 d,主要集中在0~8 d(256例,占83.7%)。不同年龄组病情分布差异有统计学意义(P<0.01):轻症以2~29岁组占比高(36.2%),普通肺炎型以30~59岁组占比高(70.2%),重症肺炎型以60~97岁组占比高(21.6%);不同年龄组重症占比、不同发病间隔组病情分布差异均有统计学意义(P值均<0.01)。普通肺炎组、重症肺炎组和轻症非肺炎组病例平均病毒载量对数值分别为(5.93±1.23)、(6.17±1.54)、(6.28±1.28)/ml(log10),差异无统计学意义(t=1.02,P=0.31);部分患者尤其是轻症患者发病时已检出新冠病毒核酸阳性且病毒载量较高(6.43±1.34)/ml(log10);重症肺炎患者的平均病毒载量在发病间隔4~5 d组最高,非重症肺炎患者在发病间隔2~3 d组最高。结论不同特征新冠肺炎病例病毒载量分布存在一定差异;病毒RNA载量与病情有一定关系。
- 江梦圆陈银吴斌刘康崔仑标朱小娟吴涛赵康辰葛以跃朱凤才
- 关键词：病毒载量荧光定量PCR
