张孜宸
- 作品数：5 被引量：21H指数：3
- 供职机构：中央民族大学生命与环境科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金国家教育部“985工程”更多>>
- 相关领域：生物学农业科学轻工技术与工程更多>>
- 改良Trizol法提取高质量蒙古沙冬青总RNA被引量：12
- 2013年
- 以木本植物蒙古沙冬青的叶片和根为材料,采用改良Trizol法提取总RNA。结果表明,与传统Trizol法相比,改良Trizol法能有效去除提取过程中残留的异硫氰酸胍、β-巯基乙醇以及植物本身的糖、酚类物质,获得高质量总RNA。改良Trizol法提取总RNA技术已被成功应用于蒙古沙冬青转录组数据库的建立。该方法可为木本植物提取高质量RNA提供借鉴。
- 陈静高飞周宜君张孜宸李章磊曹玉震张至玮
- 关键词：总RNA提取
- 玉米谷胱甘肽过氧化物酶的生物信息学分析被引量：2
- 2013年
- 对植物基因组数据库和过氧化物酶数据库中玉米谷胱甘肽过氧化物酶(Zea mays Glutathione per-oxidase,ZmGPXs)进行查找和比对,确定了6个ZmGPXs,采用生物信息学方法对其进行了理化性质、亚细胞定位、结构域、高级结构、外显子和内含子构成等分析。结果表明,尽管6个ZmGPXs序列的氨基酸数量不同,但均属于碱性蛋白质,具有6个外显子和5个内含子,其中5个ZmGPXs高级结构表现为二聚体,具有植物GPXs的特征基序。亚细胞定位分析发现ZmGPXs主要定位于线粒体、叶绿体、过氧化物酶体和细胞质中。结构域分析表明ZmGPXs属于硫氧还蛋白超家族。
- 隋欣周宜君高飞刘楠陈静张孜宸
- 蒙古沙冬青保守microRNAs的鉴定及靶基因预测被引量：1
- 2014年
- 蒙古沙冬青（Ammopiptanthus mongolicus）是生长在荒漠中的木本植物,对于我国西北部干旱、半干旱区域的植被维护与恢复具有重要价值。蒙古沙冬青对干旱、低温等多种逆境具有较高的耐受性,是研究林木耐受逆境生理与分子机制的合适材料。MicroRNA（miRNA）是一类长度约为21个核苷酸的内源性非编码小分子RNA,在植物生长发育和逆境应答等生物学过程中发挥着重要的调控作用。目前,许多植物物种的miRNAs已经获得鉴定,但未见蒙古沙冬青miRNAs的相关报道。文章应用高通量测序和生物信息学分析方法对蒙古沙冬青幼苗保守miRNAs的类型、表达丰度以及靶基因进行了分析和预测。共鉴定了10个家族的19种保守miRNAs,其表达丰度介于55~1920269个拷贝之间。通过在线软件psRNATarget预测了其中14个保守miRNAs的靶基因。对于这些靶基因的功能分析表明,蒙古沙冬青的保守 miRNA 主要通过转录调控、激素信号途径、物质代谢和胁迫应答等生物学过程参与植物生长发育和环境响应。
- 高飞孙鹏陈静李章磊张孜宸李华云王宁周宜君
- 关键词：MICRORNAS高通量测序
- 蒙古沙冬青根蛋白的提取及双向电泳体系的建立被引量：5
- 2013年
- 以蒙古沙冬青根为实验材料,采用TCA/丙酮沉淀法和Tris-饱和酚提取法分别提取根可溶性蛋白.用Bradford法测定蛋白质浓度,计算蛋白提取率,并对所提取的蛋白样品进行双向电泳检测及电泳体系优化.结果表明,选择Tris-饱和酚法提取蛋白,采用24cm、pH5～8的IPG胶条,上样量900μg,可获得分辨率高、重现性好的双向电泳凝胶图.
- 刘楠高飞周宜君张孜宸隋欣马冰张萌张根发
- 关键词：蛋白质提取双向电泳
- 盐芥谷胱甘肽过氧化物酶基因(ThGPX8)的克隆与原核表达被引量：3
- 2013年
- 【目的】克隆盐芥谷胱甘肽过氧化物酶(GPXs)基因ThGPX8,对其进行序列分析,构建原核表达载体,为进一步研究ThGPX8的结构和功能奠定基础。【方法】以盐芥为材料,利用RT-PCR技术获得其ThGPX8基因的全长cDNA序列;应用生物信息学手段对该基因编码的蛋白结构和系统进化关系进行分析;构建原核表达载体pET-ThGPX8,转化E.coli BL21(DE3),进行IPTG诱导表达、SDS-PAGE检测和Western blotting鉴定。【结果】获得的ThGPX8基因序列的开放阅读框(ORF)为504bp,编码167个氨基酸,具有GPXs的特征结构域,不是跨膜蛋白;其二级结构主要由无规则卷曲组成,三级结构为二聚体。进化树分析表明,盐芥ThGPX8与拟南芥AlyGPX8、AtGPX8和油菜BnGPX8具有较高的同源性。盐芥ThGPX8与ThGPX6的理化性质存在差异,但具有相似的二级结构和三级结构。将ThGPX8转入E.coli BL21(DE3)中,经IPTG诱导表达得到了分子质量约23ku的蛋白,该蛋白在37℃下诱导5h可获得较高的表达量。【结论】获得的ThGPX8基因cDNA序列所编码的蛋白属于植物GPXs家族成员,利用构建的原核表达载体pET-ThGPX8转化E.coli BL21(DE3)获得了融合表达蛋白。
- 张孜宸隋欣高飞周宜君陈静刘楠
- 关键词：盐芥基因克隆原核表达
