杨杰
- 作品数：12 被引量：51H指数：2
- 供职机构：江西农业大学更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金江西省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 猪IRS4基因多态性、表达差异及其与脂肪沉积性状的关联分析被引量：1
- 2015年
- 本研究旨在检测猪IRS4基因多态性及其在17种组织中的表达水平,寻找基因内与脂肪沉积性状QTL效应相关的分子标记。本研究采用比较测序方法搜寻到IRS4基因的3个SNPs,分别是在启动子上的g.96C>G,外显子上的同义突变g.1829T>C和错义突变g.1794T>C(p.Phe432Leu)。RT-PCR检测后发现,IRS4基因在垂体、下丘脑中高度表达,在其他组织中弱表达或不表达。在白色杜洛克×二花脸F2资源家系、苏太猪群体、二花脸群体、杜长大三元杂商品猪及中国地方野猪中,用PCR-RFLP方法对IRS4的3个SNPs位点进行判型,然后分析它们的基因频率及其与4点(肩、胸、腰、臀部)背膘厚、腹脂重、肌内脂肪含量和眼肌面积的相关性。结果发现,g.96C>G位点在F2家系(含有SSCX QTL)中分离程度很低,被首先排除作为潜在因果突变(QTN)的可能性。g.1794T>C和g.1829T>C位点在所有检测的西方猪种(白色杜洛克和杜长大)是均为TT基因型,而它们的CC基因型频率在二花脸猪中分别为65%和100%。在不同群体中标记关联分析结果显示,g.1794T>C与F2个体所有脂肪沉积表型均极显著相关(P<0.01),但它在苏太猪中仅与IMF显著相关(P<0.05),且与二花脸猪表型关联不显著(P>0.05);g.1829T>C则不仅与F2个体所有脂肪沉积表型均极显著相关(P<0.01),而且与苏太猪的4点膘厚和眼肌面积呈显著或极显著相关。此外,生物信息学分析发现,g.1794T>C错义突变可能对IRS4蛋白的功能影响不大。结果提示,该错义突变也不太可能是影响脂肪沉积的QTN,而g.1829T>C与F2和苏太猪的脂肪沉积性状都显著关联,故其可作为这些性状选育的分子标记,并值得深入研究。
- 马焕班刘先先杨杰黄卫兵段艳宇郭源梅麻骏武
- 关键词：QTL多态性
- PHKG1 基因及其在种猪肉质性状遗传改良中的应用
- 本发明关于一种位于猪3号染色体上的PHKG1基因的核苷酸或氨基酸序列，所述PHKG1基因的突变位点为SEQ ID NO:1所示序列的第8118位的单核苷酸C与A互变，当由C突变为A时，导致PHKG1基因在转录过程中所产生...
- 黄路生麻骏武任军杨杰周李生
- 文献传递
- 一个影响猪肉品质性状的SNP标记及其应用
- 本发明涉及生物技术辅助遗传改良领域，特别涉及一种影响猪肉质性状的SNP。所述SNP标记为10.2版本国际猪基因组15号染色体上的从5’端起的第133802499位点的核苷酸，所述核苷酸对应于SEQ ID NO:1上的从5...
- 黄路生麻骏武刘先先肖石军吴钟紫熊信威杨杰张志燕周李生
- 文献传递
- 一种影响猪脂肪沉积性状的 SNP 及其应用
- 本发明涉及生物技术辅助遗传改良领域，特别涉及一种影响猪脂肪沉积性状的SNP。所述SNP标记为10.2版本国际猪基因组的X号染色体上的从5’端起的第104772170位点的核苷酸，所述核苷酸对应于SEQ ID NO:1上的...
- 黄路生麻骏武马焕班郭源梅刘先先杨杰
- 文献传递
- 一个影响猪肉品质性状的SNP标记及其应用
- 本发明涉及生物技术辅助遗传改良领域，特别涉及一种影响猪肉质性状的SNP。所述SNP标记为10.2版本国际猪基因组15号染色体上的从5’端起的第133802499位点的核苷酸，所述核苷酸对应于SEQ ID NO:1上的从5...
- 黄路生麻骏武刘先先肖石军吴钟紫熊信威杨杰张志燕周李生
- 文献传递
- 一种影响猪脂肪沉积性状的SNP及其应用
- 本发明涉及生物技术辅助遗传改良领域，特别涉及一种影响猪脂肪沉积性状的SNP。所述SNP标记为10.2版本国际猪基因组的X号染色体上的从5’端起的第104772170位点的核苷酸，所述核苷酸对应于SEQ ID NO:1上的...
- 黄路生麻骏武马焕班郭源梅刘先先杨杰
- 文献传递
- 利用全基因组高通量SNP标记定位二花脸×沙子岭家系中的断奶体重QTL被引量：2
- 2011年
- 【目的】利用二花脸×沙子岭家系定位影响仔猪45日龄断奶体重的数量性状位点(quantitative trait loci,QTL)并搜寻QTL区间内与表型相关的位置候选基因,为最终鉴别因果基因奠定前期工作基础。【方法】构建二花脸×沙子岭猪F2资源家系,利用Illumina porcine 60k DNA芯片判定F2个体的基因型,对45日龄断奶体重表型进行全基因组连锁分析,定位影响二花脸×沙子岭家系F2家系仔猪45日龄断奶体重的QTL。在Ensemble(EMBL-EBI)和NCBI(National Center for Biotechnology Information)网站基因组数据库中搜寻相应的位置候选基因。【结果】在猪的2号染色体(sus scrofa chromosome 2,SSC2)上定位到了1个5%基因组水平显著的QTL,在猪的5号染色体(sus scrofa chromosome 5,SSC5)和猪的14号染色体(sus scrofa chromosome 14,SSC14)上分别定位到了1个1%基因组水平显著的QTL。在上述3个QTL区域内搜寻到了5个与仔猪45日龄断奶体重相关的候选基因,分别是SSC2上的CYP2R1、COPB1、PDE3B基因和SSC5上的NOP2、GDF3基因。【结论】本研究将影响二花脸×沙子岭家系仔猪45日龄断奶体重的QTL定位于SSC2、SSC5和SSC14,并揭示出5个与仔猪45日龄断奶体重相关的候选基因。
- 何余湧李完波张志燕杨明欧阳婧杨杰任军肖石军
- 关键词：断奶体重QTL定位候选基因
- 莱芜猪与杜长大三元杂交猪肉质性状种质资源比较研究被引量：37
- 2014年
- 本研究旨在对中国地方品种莱芜猪和杜长大三元杂交商品猪的多个肉质性状进行准确的评估,并分析不同品种、性别和肌肉组织对肉质的影响。本研究选取宰前活重相近的264头莱芜猪和610头杜长大三元杂交猪,在同一屠宰场屠宰,并测定其眼肌面积、pH、肉色、肌内脂肪(IMF)含量、大理石纹、水分含量及滴水损失等多项肉质指标,再对这些表型数据进行统计分析。结果表明,品种内IMF含量和滴水损失的变异程度均大于30%,提示通过品种内选择,可在一定程度上改善猪肉的IMF含量及滴水损失,并提高肉品质的均一性;品种间比较发现,除眼肌面积外,莱芜猪的各项肉质指标均优于杜长大(P<0.01),尤其是莱芜猪的平均IMF含量是杜长大的6倍多,其平均滴水损失不到杜长大的1/3,提示若将莱芜猪的肉质优良基因导入到商品猪中可以较大幅度地改善商品猪的肉品质。就性别而言,阉公猪的IMF含量要高于母猪(P<0.05),但其他性状基本上无显著差异(P>0.05)。眼肌大理石纹评分高于半膜肌,而终pH相反。此外,性状间的相关性分析结果表明,增加IMF有利于提高终pH和减少滴水损失。本研究结果加深了对莱芜猪和杜长大猪的肉质特性认识,并为今后它们的肉质选育工作提供参考。
- 杨杰周李生刘先先马焕班谢贤华熊信威候利娟黄弋轩陈从英麻骏武
- 关键词：杜长大肉质性状肌内脂肪含量滴水损失
- PHKG1基因及其在种猪肉质性状遗传改良中的应用
- 本发明关于一种位于猪3号染色体上的PHKG1基因的核苷酸或氨基酸序列，所述PHKG1基因的突变位点为SEQ ID NO:1所示序列的第8118位的单核苷酸C与A互变，当由C突变为A时，导致PHKG1基因在转录过程中所产生...
- 黄路生麻骏武任军杨杰周李生
- 文献传递
- 猪3号染色体影响糖原酵解潜能主效QTL的精细定位
- 糖原酵解潜能（Glycolytic potential,GP）反映猪宰后肌肉中糖原和葡萄糖酵解成乳酸的潜力,其计算公式为：GP=2×（剩余糖原+葡萄糖+6-磷酸葡萄糖）+乳酸（单位：μmo]/g）。由于GP与pH值、肉色...
- 杨杰
- 关键词：数量性状位点全基因组关联分析
- 文献传递
