沈栩
- 作品数：20 被引量：62H指数：6
- 供职机构：华南农业大学动物科学学院更多>>
- 发文基金：江西省教育厅科学技术研究项目江西省自然科学基金国家肉鸡产业技术体系建设专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 鸡SNP多样性的比较研究与群体有效规模的估算被引量：4
- 2007年
- 以红色原鸡(Red Jungle Fowl,RJF)、丝羽乌骨鸡(Taihe silk Chicken,TS)、隐性白洛克鸡(White Recessive Rock,WRR)为资源群,在鸡一号染色体的Contig.060226.1上选取了一个200kb的区域,比较研究了3个群体的SNP(single nucleotide polymorphism)多样性、估算了鸡的初始群体有效规模大小(effective size of population,Ne)。红色原鸡、丝羽乌骨鸡、隐性白洛克鸡3个群体的平均杂合度分别为0.28533±0.03475、0.32926±0.03919、0.30168±0.04038。显著性检验差异不显著(P=0.2368>0.05)。根据Latter和Nei的方法对鸡的群体有效规模进行了估算,鸡的初始群体有效规模大小为20000～150000。鸡在驯养的早期阶段经历过严厉的瓶颈效应,但瓶颈效应对鸡各品种SNP的多样性并未产生显著影响。笔者认为,鸡在驯养的早期阶段群体有效规模足够大,品种分化过程中群体迅速扩张,品种间的广泛杂交(特别是和红色原鸡之间)以及鸡基因组的高重组率等因素是导致家鸡和原鸡以及各家鸡品种间SNP多样性没有显著差别的重要原因。
- 饶友生王樟凤周敏沈栩夏梦娜张细权
- 关键词：SNP多样性
- 综合基因组学方法鉴别鸡繁殖性状候选基因
- 家禽的繁殖性状受到下丘脑--垂体--性腺轴的高度调控，在现代家禽生产中，提高产蛋量和防止家禽就巢行为是育种的重要目的。本研究通过不同的实验方法，综合的筛选与家鸡繁殖性状相关的候选基因，并选择合适的基因做为候选基因，分析该...
- 沈栩
- 关键词：转录组测序繁殖性状
- 文献传递
- 鸡MHC-B-F基因外显子2、3的SNPs分析被引量：9
- 2005年
- 本研究分别选择10个个体通过直接测序并与Ncbi下载的13条鸡MHC-B-F基因序列合并分析了外显子2、外显子3中的单核苷酸多态性位点。结果在外显子2264个碱基的序列中发现了44个核苷酸变异位点,其中有24个引起了氨基酸的改变,在外显子3273个碱基的序列中发现了42个核苷酸变异位点,其中有26个引起了氨基酸的改变。而且核苷酸序列的同源性均高于氨基酸序列的同源性。
- 罗庆斌沈栩任广彩
- 关键词：MHC外显子2SNPS多态性位点
- 清远麻鸡VIPR-1基因C1704887T、C1715301T位点与繁殖性状的关联性分析被引量：11
- 2011年
- 家禽繁殖内分泌调控机制和血管活性肠肽I型受体(vasoactive intestinal peptide receptor-1,VIPR-1)基因的体内体外表达实验证明,VIPR-1基因参与了繁殖行为的调控。研究以鸡VIPR-1基因的C1704887T与C1715301T位点作为繁殖性状的候选标记,对512只清远麻鸡进行基因型检测并分析其与繁殖性状的相关性。研究表明:位于内含子6的位点C1704887T与40周龄、43周龄以及54周龄的总产蛋数和总正常蛋数显著相关(P<0.05),等位基因C有利于产蛋;位于内含子8的位点C1715301T与30周总畸形蛋数显著相关(P<0.05);这2个位点组成的二倍型与开产日龄呈显著的相关性(P<0.05),但这2个位点与开产性状无显著相关。研究结果提示:位点C1704887T可作为产蛋量的标记辅助选择的潜在分子标记。
- 周敏沈栩李莹许佳俊李晓鹏梁少东何丹林聂庆华
- 关键词：清远麻鸡繁殖性状
- 清远麻鸡VIPR-1基因多态性及与生长性状的关联分析被引量：7
- 2009年
- PACAP参与下丘脑-垂体轴的内分泌功能,对生长具有调节作用,是生长激素释放因子,而其生物作用主要由其受体介导。本文以其第2型受体VIPR-1基因作为生长性状的候选基因,选取了已知2个多态位点,对134只清远麻鸡进行基因型检测并分析了其与生长性状的相关性。结果表明:(1)这2个突变位点在该品种中具有丰富的多态性;(2)位点C+53327T与300日龄体重呈极显著相关(P<0.01),CT型个体体重比纯合体CC、TT型大。
- 周敏何丹林刘满清徐海平沈栩聂庆华张细权
- 关键词：多态位点生长性状
- 鸡MHC-B-F基因外显子3 PCR-RFLP-Tas Ⅰ的多态分布
- 本研究利用PCR-RFLP方法检测了MHC-B-F基因外显子3 Tas Ⅰ位点不同基因型在9 个鸡品种计235个个体中的分布情况。结果表明MHC-B-F基因外显子3 Tas Ⅰ位点中存在3种基因型,命名为从、AB、BB。...
- 罗庆斌任广彩沈栩张细权
- 关键词：MHCPCR-RFLP
- 文献传递
- 鸡MHC-B-F基因外显子2的序列多态性分析
- 本研究利用PCR-RFLP方法检测了MHC-B-F基因外显子2BsrBI位点不同基因型在10个鸡品种计272个个体中的多态分布,并选择10个个体通过直接测序分析了MHC-B-F基因外显子2的序列多态性.结果表明MHC-B...
- 罗庆斌沈栩任广彩张细权
- 关键词：MHC序列多态性PCR-RFLPS
- 文献传递
- 猪繁殖候选基因ERK2的电子克隆与生物信息学分析被引量：4
- 2009年
- 利用生物信息学和比较基因组学方法对猪细胞外信号调节激酶2(Extracellular signal-regulated kinase 2,ERK2)基因的结构、表达和功能进行了分析,结果表明:(1)电子克隆获得的猪ERK2基因cDNA全长1 803 bp,包括1 080bp的编码区和200 bp 5'UTR、523 bp 3'UTR,编码合成359个氨基酸的多肽;(2)猪ERK2基因CDS序列与人、小鼠和大鼠的同源性分别为94.6%、91.6%和91.3%,编码合成的猪ERK2与人、小鼠和大鼠之间的同源性也高达99.4%、98.9%和98.9%;(3)猪ERK2蛋白的相对分子质量为41 303.69 Da,不含信号肽,具有ATP结合位点、MAP激酶保守位点和丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性位点等结构域;(4)基于cDNA及EST数据库的检索显示,猪ERK2基因在卵巢、睾丸、肾上腺、眼、肺、淋巴、关节囊、副乳、未成熟的树突状细胞和脂肪细胞等组织和细胞中表达。
- 方梅霞周晓宁沈栩王亚军聂庆华张细权
- 关键词：电子克隆生物信息学
- 鸡GARNL1基因一种新的选择性剪接体的鉴定和组织表达分析
- 鸡GARNL1(GTP-activating Rap/Ran-GAP domain-like1)基因位于5号染色体上，编码一个2 086个氨基酸残基的蛋白。本研究通过RT-PCR的方法，克隆测序等方法对鸡GARNL1基因...
- 沈栩聂庆华张细权
- 关键词：可变剪接
- 文献传递
- 与鸡300日龄产蛋量相关的GARNL1基因上的位点及其应用
- 本发明公开了一个与鸡300日龄产蛋量相关的GARNL1基因上的位点及其应用。本发明鸡300日龄产蛋量相关的GARNL1基因的核苷酸序列如SEQIDNO:1所示，所述位点位于GARNL1基因外显子15上第138bp处的一个...
- 张细权沈栩曾华谢亮
- 文献传递
