王鹏
- 作品数：38 被引量：57H指数：4
- 供职机构：中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项海南省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 一种强心苷化合物的用途
- 本发明公开了强心苷化合物12β‑hydroxycalotropin在制备具有治疗和预防肿瘤作用的药物中的用途，该强心苷化合物12β‑hydroxycalotropin具有显著的抗肿瘤活性，可作为治疗肿瘤的先导化合物；同时...
- 王茂媛晏小霞王祝年王建荣王清隆王鹏
- 文献传递
- 杧果FPPS基因的鉴定和序列分析
- 2016年
- 法尼基焦磷酸合成酶(Farnesyl Pyrophosphate Synthase,FPPS,EC∶2.5.1.1)是倍半萜合成中的一个关键酶,在植物萜类合成过程中有关键作用。以杧果FPPS基因为研究对象,以拟南芥FPPS基因为参考,通过BLAST方法从番木瓜、金钱橘、甜橙、苹果、小果野蕉、桃子、白梨、葡萄、中华猕猴桃、无油樟基因组数据中获得了FPPS基因,共19条FPPS基因序列,对其进行了系统进化分析和生物信息学分析。系统进化结果显示:双子叶植物纲果树与单子叶植物纲果树关系较远,同是双子叶植物纲的果树关系较近,同科果树亲缘关系更近。生物信息学分析结果显示:氨基酸序列中,酸性蛋白占94.7%,稳定性蛋白占84.2%,有信号肽的蛋白占5.3%,有导肽的蛋白占10.5%,所有蛋白均为有明显跨膜现象的亲水性蛋白;所有FPPS基因亚细胞定位于线粒体中,均有蛋白活性位点。
- 盖江涛朱敏党志国陈华蕊陈振玺王鹏
- 关键词：杧果萜类系统进化生物信息学
- 一种强心苷化合物的新用途
- 本发明公开了强心苷化合物12β-hydroxycalotropin在制备具有治疗和预防肿瘤作用的药物中的用途，该强心苷化合物12β-hydroxycalotropin具有显著的抗肿瘤活性，可作为治疗肿瘤的先导化合物；同时...
- 王茂媛晏小霞王祝年王建荣王清隆王鹏
- 文献传递
- 植物鸟氨酸脱羧酶家族基因鉴定及进化分析被引量：2
- 2018年
- 精氨酸脱羧酶(ADC)和鸟氨酸脱羧酶(ODC)共同负责腐胺的合成,而烟草等茄科植物中,因为腐胺是尼古丁的前体,ADC、ODC对于尼古丁合成具有特殊意义。为系统梳理ODC和ADC在植物基因组中的状况,我们对其基因进行了全面的鉴定和进化分析,并重点考察了其在茄科植物番茄中的表达。首先,我们从已阐明功能的ADC和ODC蛋白序列中,均鉴定了两个保守结构域;在此基础上,结合HMMER和BLAST,从10个植物基因组中共鉴定得到了46个鸟氨酸脱羧酶家族基因。对其构建进化树,发现它们分成3个亚家族:ODC、ADC和DapDc;这些基因均为脱羧酶基因。人类和酵母基因均聚在ODC这一枝,表明ODC在本家族中进化最早。拟南芥和苔藓中均不存在ODC基因,表明此基因在这两个植物基因组中发生了丢失。ADC基因在植物登陆后才得以进化形成。DapDc基因数目极为保守,表明它在植物进化过程中受到了严格的控制。
- 王鹏罗朝鹏盖江涛
- 关键词：鸟氨酸脱羧酶基因家族进化
- 在基因家族背景下对四种植物中DGAT2的鉴定和序列分析被引量：4
- 2015年
- 二酰甘油酰基转移酶2(Diacylglycerol O-acyltransferase 2,DGAT2)是植物中三羧酸甘油酯(TAG)合成途径的限速酶,其编码基因属于酰基转移酶基因超家族。本研究依托植物全基因组数据库Phytozome,通过BLAST搜索获得了蓖麻(Ricinus communis L.)、拟南芥(Arabidopsis thaliana Heynh.)、毛果杨(Populus tricho-carpa Torr.&A.Gray.)和木薯(Manihot esculenta Crantz.)4种双子叶植物酰基转移酶基因超家族所编码的73条多肽序列,并从中鉴定出5条DGAT2序列。理化性质和跨膜结构域分析表明,5条DGAT2序列均为疏水性跨膜蛋白,其中木薯DGAT2为一次跨膜蛋白且在叶绿体膜中大量分布,这与其他植物的DGAT2序列存在差异;木薯DGAT2蛋白在进化过程中发生了功能分化且可能与木薯的抗逆作用有关。
- 陈振玺王鹏盖江涛王奇志
- 关键词：DGAT2三酰甘油限速酶基因家族
- 一种强心苷化合物的用途
- 本发明公开了强心苷化合物12β-hydroxycalotropin在制备具有治疗和预防肿瘤作用的药物中的用途，该强心苷化合物12β-hydroxycalotropin具有显著的抗肿瘤活性，可作为治疗肿瘤的先导化合物；同时...
- 王茂媛晏小霞王祝年王建荣王清隆王鹏
- 一种强心苷化合物的用途
- 本发明公开了强心苷化合物12β-hydroxycalotropin在制备具有治疗和预防肿瘤作用的药物中的用途，该强心苷化合物12β-hydroxycalotropin具有显著的抗肿瘤活性，可作为治疗肿瘤的先导化合物；同时...
- 王茂媛晏小霞王祝年王建荣王清隆王鹏
- 杧果中DXR基因的鉴定及与其他果树的比较分析被引量：1
- 2018年
- 1-脱氧-D-核酮糖5-磷酸还原酶(1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase, DXR)是2-C-甲基-D-赤藓糖醇-4-磷酸(2-C-Methyl-D-erythritol-4-phosphate, MEP)途径的一个关键酶。本研究以杧果DXR基因作为研究目标,通过BLASTP方法获得了甜樱桃、白梨、西洋梨、苹果、桃子、枇杷、金钱橘、甜橙、葡萄、软枣猕猴桃、榴莲、枣、番木瓜、小果野蕉、凤梨的DXR基因的蛋白序列,共18条序列,对其进行了保守结构域、保守基序、系统发育、理化性质、蛋白二级结构分析等研究。保守结构域及保守基序分析结果表明:杧果DXR蛋白包含一个PLN02696结构域,保守结构域内包含5个motif,其宽度、排列顺序与其他15种果树均相同,说明DXR基因家族具有高度保守性。系统发育分析结果显示:单子叶植物纲与双子叶植物纲的DXR基因分别形成了分支,推测在进化过程中DXR基因的分化至少在双子叶植物纲和单子叶植物纲形成之前。理化性质分析及蛋白二级结构分析结果显示:所有蛋白均为酸性、无信号肽蛋白,稳定性蛋白占38.9%,亲水性蛋白占44.4%,杧果DXR蛋白为稳定的亲水性蛋白;杧果DXR蛋白的二级结构主要结构元件是无规则卷曲、α-螺旋。本研究为进一步研究杧果DXR基因在萜类合成途径中的作用提供理论支持。
- 盖江涛白蓓蓓叶秀旭王鹏党志国
- 关键词：杧果MEP萜类
- 植物UDP-葡萄糖焦磷酸化酶家族基因鉴定及序列进化分析被引量：3
- 2019年
- UDP-葡萄糖焦磷酸化酶(UDP glucose pyrophosphorylase, UGP)是糖代谢合成途径中的一个关键酶。UGP以葡萄糖-1-磷酸和尿苷三磷酸为底物,催化反应生成尿苷二磷酸葡萄糖和焦磷酸,直接参与了植物糖代谢的生物合成。为了系统梳理UGP在植物基因组中的状况,我们对其基因进行了全面的鉴定和进化分析,并重点考察该基因在番茄中的表达。首先,我们针对UGP的基因序列,鉴定得到其保守结构域,在此基础上对相关基因进行了全面鉴定,从而构建了其进化树;其次,将番茄CDS序列比对到各探针,从而从数据库中提取组织中的表达数据;最后,通过结构域鉴定,进化树和表达量的分析,得出UGP在植物中的生物合成的机理。本研究为UDP-葡萄糖焦磷酸化酶提供了基因信息,为植物中糖代谢生物合成途径的作用机理及其对蔗糖合成的影响相关基因进化机制的研究提供帮助。
- 白蓓蓓陈业渊盖江涛叶秀旭王鹏
- 关键词：基因家族进化表达量
- 真核生物糖代谢与转运相关高通量基因挖掘与进化分析
- 全面性和精确性是考察基因挖掘效果的主要指标。本课题组通过多种方法的结合，构建了一套基因挖掘流程;通过对油脂代谢、生物碱合成、蛋白糖基化等多个通路的挖掘表明，本流程能在全面性和精确性两方面达到理想的状态。本报告将报道本课题...
- 王鹏
