黄国明
- 作品数:57 被引量:233H指数:9
- 供职机构:天津出入境检验检疫局更多>>
- 发文基金:国家质检总局科技计划项目国家科技支撑计划天津市自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生理学更多>>
- 雀麦上雀麦腥黑粉菌Tilletia bromi的分子检测被引量:3
- 2009年
- 雀麦是重要的牧草,近年来进口量激增。寄生于雀麦上的腥黑粉菌共有4种,即小麦矮腥黑穗菌Tilletia controversa(TCK)、雀麦腥黑粉菌T.bromi、T.bolayi和小麦网腥黑穗菌T.caries(TCT),根据冬孢子形态难以直接区分这些种类。本文在形态、自发荧光和萌发生理三方面的比较研究基础上,依据beta-微管蛋白tub2基因序列设计一套引物,转化为特异SCAR分子标记,建立了雀麦上T.bromi的菌丝基因组DNA的特异PCR检测方法和冬孢子的套式特异PCR检测方法,为病害提供了快速、可靠的检测方法。
- 廖芳赵磊罗加凤黄国明刘跃庭李明刚
- 关键词:SCAR分子标记套式PCR分子检测
- 基于rbcL基因序列的欧洲菟丝子分子检测被引量:6
- 2009年
- 菟丝子属(Cuscuta L.)被列为我国禁止进境的植物检疫性有害生物,目前进出境口岸使用常规形态学鉴定方法对菟丝子属的检测很难鉴定到种。本文通过扩增寄生于大豆上的6种菟丝子的1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶大亚基基因(rbcL)序列,通过Clustal X比对分析该6种菟丝子基因序列的差异,设计了针对欧洲菟丝子的特异引物,实现了对欧洲菟丝子(Cuscuta europaea)快速、准确的PCR分子检测,灵敏度达到单粒种子,满足各口岸对欧洲菟丝子的检测需求。
- 张裕君刘跃庭廖芳刘勇罗加凤崔铁军黄国明
- 关键词:RBCL基因
- 单条线虫DNA提取方法研究被引量:15
- 2014年
- 为探寻一种高效、稳定、廉价的单条线虫DNA提取方法,以6种植物寄生线虫作为试验材料,比较了4种方法,即直接裂解法、冻融裂解法、切割裂解法、切割冻融裂解法对单条线虫DNA的提取效果。结果表明,对线虫进行管内切割的切割冻融裂解法与切割裂解法高效、稳定,冻融裂解法效果较差,直接裂解法效果最差。对线虫进行管内切割的切割冻融裂解法和切割裂解法可高效、稳定地获得高质量的单条线虫总DNA,满足下一步的PCR扩增需求。
- 容万韬王金成刘鹏林宇郭京泽黄国明孙建华
- 关键词:裂解冻融DNA提取
- 基于核糖体ITS区和28S rRNA D2~D3区的短体线虫系统发育研究被引量:15
- 2012年
- 短体线虫又称根腐线虫,是世界分布最为广泛和最具破坏性的迁徙性植物内寄生线虫之一。本研究根据214条核糖体ITS序列,218条核糖体28S大亚基D2~D3序列,应用MEGA4.0软件,通过邻接法(NJ)构建了短体线虫的系统发育树。结果发现,2个系统树在整体上大致相似,仅在小的分支上存在差异。基于ITS序列的系统树将25种短体线虫至少分为8组,相应的基于D2~D3序列的系统树将23种短体线虫至少分为7组。其中,有3个大组内部的系统发育关系比较清晰。根据本研究的系统发育分析仍然无法从总体上确定短体线虫种间的系统发育关系。
- 王金成魏亚东顾建锋张瑞丰黄国明王暄李红梅孙建华
- 关键词:MEGADNA
- 同步分子检测两种腥黑粉菌近似种Tilletia bromi和T.fusca被引量:2
- 2013年
- 早熟禾是优良的牧草和草坪草,近年来,从进境早熟禾上多次截获一种腥黑粉菌,但一直被鉴定为禾草腥黑粉菌Tilletia fusca。通过比较研究,作者已将该菌种名改为雀麦腥黑粉菌T.bromi。依据T.bromi和T.fusca的序列差异位点设计了6对引物,成功建立了适合菌丝检测的T.bromi和T.fusca的双重PCR方法和适合冬孢子检测的套式双重PCR方法,检测灵敏度达到10pg/μL,为早熟禾腥黑粉菌鉴定提供了快速、可靠的检测方法。
- 廖芳罗加凤刘跃庭刘鹏黄国明
- 关键词:早熟禾套式PCR
- Neotyphodium coenophialum和N.lolii的PCR检测
- 2006年
- 以N·coenophialum和N·lolii及其近似种N·huerfanum、N·chisosum、N·aotearoae、N·sp·共6个种18个菌株及苇状羊茅和多年生黑麦草8个品种的供试种子,通过对Tub-2基因引物IS1~IS3和NC25基因引物F1~R1进行扩增,设计了种子中Neotyphodium属内生真菌套式扩增的通用引物Tub-2-F^Tub-2-R,设计了N·coenophialum和N·lolii的特异引物F3~R3,建立了N·coenophialum和N·lolii的菌丝常规PCR和单粒种子套式PCR检测方法,使N·coenophialum和N·lolii的检测达到了单粒种子的水平,缩短了检测时间。建立的N·coenophialum和N·loliiPCR检测方法特异性强,结果可靠,检测速度快。
- 刘跃庭廖芳崔铁军黄国明罗加凤
- 关键词:PCR单粒种子
- 荷兰百合种球中穿刺短体线虫尾型变异研究被引量:1
- 2013年
- 近年来,天津口岸检疫人员在进境荷兰百合种球中多次截获穿刺短体线虫,同时发现穿刺短体线虫种群中存在尾型变异的个体与穿刺短体线虫的典型尾型截然不同。为弄清这些尾型变异个体的分类地位,本研究在形态观察的基础上,经18S rDNA基因序列比对及其系统发育分析,发现来自荷兰的HL种群中的7种变异尾型个体在分子上与穿刺短体线虫具有极高的相似性,说明这些具变异尾型的短体线虫归属于穿刺短体线虫(P.penetrans)。
- 魏亚东容万韬张瑞峰王金成顾建锋黄国明郭京泽孙建华
- 关键词:RRNAPCR扩增系统发育分析
- 腐烂茎线虫不同地理种群ITS区序列比对及系统发育被引量:14
- 2007年
- 为弄清我国腐烂茎线虫(Ditylenchus destructor)不同地理种群ITS(Internal transcribed spacer)区之间的碱基差异及系统发育关系,本研究通过网络软件Clustalw1.83对腐烂茎线虫的核糖体ITS区核酸序列进行了比对,结果发现腐烂茎线虫的8个种群中,DEll、DEly、DEAY987007三个种群(I组)内部之间的碱基差异在1%以内,其它的5个种群(II组)之间的差异为0~1%,而I组与II组种群之间的差异达到了15%(根据ITS1+5.8s+ITS2序列)或20%(根据ITS1+ITS2序列)。这说明我国腐烂茎线虫很可能是1个复合种。根据ITS区核酸序列构建的系统发育图同样显示,我国腐烂茎线虫的7个地理种群明显分为2个分支A和B。
- 王金成季镭黄国明杨秀丽林茂松
- 关键词:腐烂茎线虫鳞球茎茎线虫系统发育关系
- 水牛草及其传入风险分析
- 2012年
- 水牛草是一种繁殖能力强,易于传播的有害杂草,一经定殖将会对本土生态环境和作物生产安全带来危害,造成生态和经济损失。本文通过对水牛草形态特征、生理特性、生长环境等方面进行描述,并以此为基础对其进入我国定殖的可能性、适生范围、传播特性和危害性等方面进行了风险分析,建议有关部门加强对水牛草的检疫防控工作,保护国家生态系统和农业安全。
- 刘勇赵丹云牛春敬廖芳范晓红黄国明
- 关键词:风险评估
- 重要检疫性杂草长芒苋的分子检测被引量:1
- 2016年
- 为实现检疫性杂草长芒苋(Amaranthus palmeri)的有效检测,本研究基于苋属植物可溶性淀粉合成酶I基因(SSSI),建立了一种序列特异性PCR方法,可实现从众多苋属种子中检测出长芒苋。结果显示,该方法特异性强、简便快捷,可为口岸检疫鉴定工作提供有效的技术支持。
- 李淼黄国明姜一张莹刘勇廖芳李明刚
- 关键词:分子检测