何珊珊
- 作品数：2 被引量：7H指数：1
- 供职机构：同济大学附属第十人民医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市科学技术委员会资助项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- IRX1在胰腺癌中的表达及其启动子区甲基化状态
- 2011年
- 目的检测胰腺癌的易洛魁族同源盒基因（IRX1）的表达及其启动子区的甲基化状态，探讨两者间的相关性。方法采用实时PCR法检测12例胰腺癌组织及6株胰腺癌细胞株的IRX1mRNA表达。基因序列分析1RX1基因启动子区结构。应用甲基化抑制剂5-氮杂-2’-脱氧胞苷（5-Aza—dC）处理胰腺癌细胞，采用甲基化特异性PCR（MSP）、非甲基化特异性PCR（USP）及实时PCR检测处理前后IRX1启动子甲基化状态和IRX1mRNA表达。结果胰腺癌组织IRX1mRNA的表达量为0．31±0．11，显著低于癌旁正常胰腺组织的1．05±0．32（P〈0．01）。胰腺癌细胞AsPCI、BxPC3、Capan-2、PANCl、PaTu8988和SW1990的IRX1mRNA表达量分别为0．36±0．08、0．34±0．16、0．37±0．11、0．25±0．06、0．31±0．04、0．36±0．02，均显著低于人肾上皮293细胞的1．03±0．28（P〈0．05或〈0．01）。IRX1基因启动子区富含CpG岛。各胰腺癌细胞株IRX1基因启动子CpG岛对应位点均有甲基化，经5-Aza-dC处理后甲基化状态得以逆转，IRXmRNA的表达也得以恢复。结论胰腺癌的IRX1mRNA表达下降，与其IRX1基因启动子区CpG岛高甲基化状态相关。
- 卫巍徐凌王锋何珊珊杨丽娟郭传勇王兴鹏
- 关键词：胰腺肿瘤启动子甲基化
- 低氧对人肝癌HepG2细胞中HIF-1α及miR-210表达的影响被引量：7
- 2011年
- 目的:研究低氧对人肝癌细胞株HepG2细胞表达缺氧诱导因子1α(hypoxia-inducible factor-1 alpha,HIF-1α)及缺氧特异性微小RNA-210(microRNA-210,miR-210)的影响,探讨肿瘤细胞在低氧环境下miR-210表达的变化情况。方法:HepG2细胞经体外常规培养后,用体积分数为1%的氧气分别培养HepG2细胞6、12、18和24h。应用实时荧光定量RT-PCR(real-time quantitative reverse transcriptionPCR,qRT-PCR)和蛋白质印迹法分别检测细胞中HIF-1αmRNA和蛋白的表达变化,同时用茎环RT-PCR检测miR-210的表达变化,分析HIF-1α与miR-210的表达关系。染色质免疫共沉淀PCR(chromatin immunoprecitation PCR,ChIP-PCR)分析HIF-1α与miR-210启动子结合的可能性。结果:低氧培养6～12h,HIF-1αmRNA的表达量存在明显改变(P<0.05),而其蛋白的表达量从低氧培养开始直至24h均有明显变化(P<0.005);与此同时,miR-210的表达量在低氧培养6～18h时出现明显改变(P<0.01),且与HIF-1α蛋白表达存在明显的线性相关(R=0.795,P=0.037)。进一步的ChIP-PCR实验表明,HIF-1α在HepG2细胞内可与miR-210启动子区近转录区的低氧反应元件(hypoxia response element,HRE)结合,从而发挥转录调控作用。结论:适度的低氧环境可能影响miR-210表达,其机制可能是通过HIF-1α结合其启动子来调节实现的。
- 徐凌王锋卫巍戴维奇何珊珊王兴鹏郭传勇
- 关键词：低氧染色质免疫沉淀
