孙利娜
- 作品数：117 被引量：146H指数：7
- 供职机构：广西林业科学研究院更多>>
- 发文基金：广西林科院基本科研业务费项目广西壮族自治区自然科学基金广西林业科技项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学自动化与计算机技术经济管理更多>>
- 伊丽莎白安格斯三角梅转录组的SSR、SNP和InDel特征分析被引量：1
- 2024年
- 【目的】基于转录组测序数据分析伊丽莎白安格斯三角梅SSR、SNP和InDel位点特征,为开发三角梅分子标记、选育无刺或少刺品种、品种鉴定及亲缘关系分析提供理论依据。【方法】以伊丽莎白安格斯三角梅3个时期的枝刺和茎段为材料,对其进行转录组测序,采用Trinity对获得的高质量测序数据进行序列组装,利用MISA和GATK3对SSR、SNP和InDel进行特征分析。【结果】18个样本转录组测序平均获得45905982bpRawdata,质控过滤后获得45640193 bp Clean data,拼接后获得312812条转录本和144512条Unigenes,有54516个SSR位点分布于40820条Unigenes上,发生频率为28.25%,平均分布距离为2.67kb,包含1个以上SSR位点的Unigenes10269条,占Unigenes总数的4.25%。在重复基元类型中,单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复数量占优势,其中单核苷酸重复数量最多(39904个,占比73.20%),其次为二核苷酸重复(8169个,占比14.98%)和三核苷酸重复(5899个,占比10.82%),五核苷酸重复最少(31个,占比0.06%)。单核苷酸~六核苷酸重复类型共检测到98种重复基元,出现频率为0.01%~25.71%,其中出现频率最高的基元为A/T(37151个),占SSR位点总数的68.15%。SSR各类型重复基元的重复次数集中在5~23次,SSR序列的长度10~60bp,平均长度为20.38bp。共检测到231248个SNP位点和99580个InDel位点,其中SNP位点平均分布距离为1.59 kb,InDel位点平均分布距离为0.68 kb,且均以含1个位点的Unigenes数量最多,Unigenes数量随SNP和InDel位点数量的增加而逐渐减少。【结论】伊丽莎白安格斯三角梅转录组中SSR位点数量多、类型丰富,分布特征明显,可用于开发大量SSR标记,SNP和InDel位点发生频率低于模式植物,有待深度挖掘。
- 孙利娜林茂黄旭光陈尔杨舒婷王华新龚建英
- 关键词：转录组SSRSNPINDEL
- 一株兰花菌根真菌PF07及其应用
- 本发明公开了一株兰花菌根真菌PF07，所述兰花菌根真菌PF07为杯梗孢(Cyphellophora sp.)PF07，于2020年11月13日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，地址为北京朝阳区北辰西路1号...
- 陈宝玲唐庆杨开太 蒋林 周千淞 黄森 胡雪玲李进华 刘世勇孙开道林茂 余玉珠黄欣 桂雪萍 吴晓峰孙利娜
- 一种丛生竹截干快速繁殖方法
- 本发明涉及植物无性繁植技术领域，尤其涉及一种丛生竹截干快速繁殖方法，包括以下步骤：(1)母竹选择；(2)母竹截干处理；(3)母竹主干处理；(4)灌液处理；(5)母竹主干定植；(6)栽培后管理。本发明采用株高8‑10m的丛...
- 唐庆黄欣李立杰黄大勇秦波孙开道杜铃李进华杨媚林茂孙利娜田红灯李冰谢劲松汪小玉
- 文献传递
- 基于转录组数据的炮仗花SSR序列特征分析
- 2024年
- 为了解炮仗花SSR位点分布特征,本研究对炮仗花转录组SSR位点进行挖掘。结果表明,从炮仗花转录组测序数据中获得85 699条非冗余Unigenes,共搜索到22 864个SSR位点分布于18 282条Unigenes上,SSR位点的出现频率为26.68%,平均每4.38 kb出现1个SSR,平均长度为13.89 bp。炮仗花SSR位点主要重复类型为单核苷酸重复(13 780个,占比60.27%),其次为二核苷酸重复(6 141个,占比26.86%)和三核苷酸重复(2 656个,占比11.62%)。在72种重复基元中,单核苷酸A/T基元为最优势基元(12 731个,占比55.68%),其次为二核苷酸优势基元AG/CT(2 522个,占比11.03%)和三核苷酸优势基元AAG/CTT(745个,占比3.26%)。炮仗花SSR位点以5~15次重复为主,6种核苷酸重复类型数量总体表现为随着基元重复次数的增加而减少。SSR位点主要集中在10~18 bp之间,此范围内的SSR数量占SSR位点总数的81.87%,具有较高多态性潜能的SSR(长度>20 bp)位点数为640个,占比10.17%。总之,炮仗花SSR位点出现频率高,SSR位点丰富,具有较高的多态性潜能。
- 朱飞雪程玉江郭丽孙利娜寇艳玲
- 关键词：炮仗花转录组SSR多态性
- 运用ISSR标记鉴定宝巾花辐射突变体被引量：2
- 2017年
- 采用ISSR分子标记鉴定宝巾花(Bougainvillea spectabilis)辐射突变体,建立了宝巾花的ISSR-PCR反应体系,筛选出适宜的退火温度。结果发现从14条ISSR引物中筛选出7条具有多态性的引物进行PCR扩增,引物UBC880对样品j、k、l扩增出多态位点,片段大小在350 bp左右,其余引物均未扩增出明显的多态位点。由此说明,运用ISSR分子标记可初步鉴定宝巾花表型突变体。
- 孙利娜唐庆王华新林茂龚建英杨舒婷
- 关键词：宝巾花ISSR突变体
- 一种木质藤本花卉的球状景观装置
- 本实用新型公开了一种木质藤本花卉的球状景观装置，包括支撑架、球状体，所述支撑架竖直设置；所述球状体包括弧形杆、加固环，所述弧形杆间隔设于支撑架上端，并向上弯曲延伸，其凹面相对，上端相交连接，使得若干根弧形杆围成球状结构，...
- 孙利娜杨舒婷王华新林茂李冰龚建英黄业超韦能孙韦政全
- 一种大花紫薇组培苗储运装置
- 本实用新型公开了一种大花紫薇组培苗储运装置，属于大花紫薇储运技术领域。一种大花紫薇组培苗储运装置，包括储存箱，储存箱的内部设置有多个承载架，承载架的表面贯穿开设有多个开口，承载架底部表面位于开口底部的位置处固定有连接筒，...
- 林茂陈尔孙利娜李冰
- 关于我国宝巾花育种的思考被引量：9
- 2011年
- 概述宝巾花(Bougainvillea)育种现状,介绍了几种诱变育种技术在农业、花卉生产与科研中的重要作用,并建议采用诱变育种技术来获得宝巾花新品种新种质。
- 孙利娜
- 关键词：宝巾花繁殖诱变育种
- 我国杜鹃花育种研究被引量：2
- 2013年
- 综述我国杜鹃花的种质资源情况、育种现状及适合杜鹃花的多种育种途径,以期为杜鹃花的育种提供参考。
- 孙利娜王华新杨舒婷林茂龚建英陈尔汪小玉
- 关键词：杜鹃花育种种质资源
- 高温季节红花檵木叶片色素含量及净光合速率的变化被引量：3
- 2017年
- 以圆叶双面红5~10 a生苗为材料,对比分析了南宁(桂南)和桂林(桂北)两地高温季节(7~9月)红花檵木叶片色素含量及净光合速率的变化。结果表明:随着环境中温度湿度和光照强度的升高,红花檵木叶片中叶绿素a、叶绿素b和类胡萝卜素的含量呈上升趋势,花色素苷却呈下降趋势,而净光合速率不断加强;由于桂林温度、湿度等环境因子稍低于南宁,所以桂林的植株净光合速率稍低于南宁,红花檵木叶片的返青现象也没有南宁严重。
- 黄欣王华新孙开道林茂李进华孙利娜
- 关键词：红花檵木净光合速率叶绿素花色素苷
