孙婷婷
- 作品数：18 被引量：18H指数：3
- 供职机构：浙江大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金浙江省“钱江人才计划”浙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学文化科学交通运输工程生物学更多>>
- 吸附类蛋白质分子的力学性质
- 2010年
- 基于三维格点的ODI模型，采用PERM方法研究了吸附在表面的类蛋白质分子的力学性质．首先计算了拉伸过程中，类蛋白质分子链的尺寸大小以及形状参数．发现类蛋白质链在拉伸过程中经历了从棒形到球形，再从球形到棒形；最终在链全部脱离表面作用时，又形成了球形结构．还计算了类蛋白质分子链的热力学性质，如每个键的平均自由能、平均相互作用能、平均吸附能、平均螺旋能、平均折叠能以及平均紧密接触对能．同时也讨论了拉伸过程中的弹性力，在表面对类蛋白质分子有吸附时，弹性力在拉伸过程中出现一个力的平台，这和SMFS实验得到的一般高分子拉伸的力学平台类似．弹性力对能量的贡献以及对紧密接触对能量的贡献的曲线中出现了力学平台，随后出现了极大值．
- 孙婷婷马海珠
- 关键词：弹性蛋白蛋白质类
- 全α蛋白质体系能量转变的分子动力学模拟被引量：3
- 2014年
- 采用简化的NHP模型并考虑蛋白质链的二级结构信息,对全α型蛋白质链进行构建.利用分子动力学模拟研究全α蛋白质体系势能的变化情况,得出键伸缩和弯曲能量随蛋白质的链长线性增加;单键的伸缩能和弯曲能随着温度的升高而线性增加,且伸缩能比弯曲能随温度的增加更为明显的结论.键扭转能随二级结构α螺旋数目的增加而线性降低,随温度的上升,扭转能变化呈现先增加后减少的趋势.非键能的大小随疏水残基在蛋白质组分中的比例增加而降低,但线性关系不明显.键扭转能和非键能都存在转变温度.蛋白质链的结构是由多种势能协同作用的结果,键能和非键能的相互竞争以及组成蛋白质链的氨基酸亲疏水性和二级结构组分都会影响蛋白质体系的能量,这些结果对深入理解蛋白质的结构提供理论依据.
- 姜舟婷孙婷婷王亚楠陈昱东何志兴徐鹏
- 关键词：分子动力学模拟
- 类蛋白质分子构象及其动力学行为的研究
- 蛋白质是生命机体的基本组成部分,是其组成、相互作用和结构以及动力学特征共同作用的一个整体。因此研究其组成与结构以及动力学行为是一个重要的课题。本文主要对蛋白质分子的构象、折叠和拉伸行为、以及动力学行为进行了统计分析和模拟...
- 孙婷婷
- 关键词：类蛋白质动力学行为分子构象
- 文献传递
- 聚四氟乙烯和聚二甲基硅烷的链尺寸和偶极矩被引量：4
- 2010年
- 基于改进的旋转异构态方法,推导了对称双取代基高分子链的均方回转半径和均方偶极矩公式,用于研究聚四氟乙烯(PTFE)、聚二甲基硅烷(PDMS)和聚乙烯(PE)链构象依赖的性质.计算得到长链聚四氟乙烯PTFE4(四态模型)和PDMS的构型参数值分别为0.44·mol0.5·g-0.5和0.43·mol0.5·g-0.5,PDMS链的相应温度系数值-7.32×10-3K-1,它与PTFE和PE的值(约-1.00×10-3K-1)相差较大.得到长链PTFE和PDMS的均方电偶极矩特征比结果都很小,如PDMS链的特征比为0.27,说明虽然PTFE和PDMS的侧基键C—F和Si—CH3都有强极性,但其聚合物却是非极性的电介质,具有较好的电绝缘性能,可见高分子链的构象和结构也对聚合物极性和电学性质有很大的影响.得到短链PTFE和PDMS(重复单元x<10)均方偶极矩表现出明显的端点效应,特征比随x的改变而呈现明显的波动,这与Flory等的计算结果一致.
- 马海珠孙婷婷
- 关键词：聚四氟乙烯聚二甲基硅烷构象
- 基于车牌识别的一体式寻车数据采集系统的实现
- 近几年大型地下停车场成为许多大城市新建高层建筑中的必备设施。但是由于停车场配套工作不协调、标志不清晰及人们普遍存在的大型复杂空间中方向感弱的原因，造成了停车慢找车难、停车场利用率低等问题。针对这类问题，国内外引入智能交通...
- 孙婷婷
- 关键词：车牌识别硬件设计软件开发RETINEX理论支持向量机
- 吸附类蛋白质分子二级结构变化的研究被引量：1
- 2009年
- 采用蒙特卡罗方法和基于三维格点的ODI模型,研究了类蛋白质分子二级结构变化与表面吸附能的关系.分别计算了链长为29,39,49时、不同吸附能下类蛋白质分子二级结构的个数.包括α螺旋、β折叠、紧密接触对.吸附能参数aε<2εh时,这三类二级结构个数均没有明显的变化,而在2εh<εa<4εh,二级结构的个数迅速减小,εa>4hε时,二级结构的个数基本维持不变.同时发现吸附能增强对螺旋结构变化的影响最大,对折叠结构的影响其次,对紧密接触对影响最小.这体现在螺旋结构的减小幅度为90%,折叠结构减小的幅度为45%,而紧密接触对减小的幅度为35%.通过统计吸附单体个数,得到当吸附单体占总单体数的40%时,二级结构开始变化,直至吸附单体为总单体数的90%时,二级结构基本不变.另外还计算了二级结构个数的涨落δNh、δNc以及吸附单体个数的涨落δNa.在εa>2εh时,涨落突然增大,在aε=2εh时,δNh和δNb具有涨落极大值,这是二级结构相变的临界点.在εa=3.75εh处,δNc和δNa具有极大值.
- 孙婷婷马海珠
- 关键词：MONTECARLO方法
- miR-30c/sema3A调控成年神经再生的机理及对嗅觉和记忆的影响
- 目的： 1.基于高通量测序数据库，筛选与细胞分化和轴突导向相关的microRNAs;2.基于生物信息学方法和实验手段，明确miR-16，miR-30c与sema3A的靶向关系;3.探讨miR-30c/sema3A对体内...
- 孙婷婷
- 关键词：基因调控记忆能力
- 生物专业的大学物理教学探讨
- 2012年
- 物理学与生物学的交叉已经渗透到了很多技术领域,对于生物专业的本科生,应该进行有效的、有针对性的大学物理教学。本文探讨了从教学内容、教学模式上进行的改革,同时把科研带进课堂,从而提升生物专业大学物理的教学质量。
- 孙婷婷蒋丽珍马海珠马涛
- 关键词：大学物理教学改革
- 一种超声波干雾降尘装置及其多回路串级PID控制方法
- 本发明公开了一种超声波干雾降尘装置及其多回路串级PID控制方法，该超声波干雾降尘装置包括干雾质量控制系统，该干雾质量控制系统包括：第一信号采集单元，用于采集雾滴品质参数信息；第二信号采集单元，用于检测进气管中的气压值；第...
- 徐新民孙婷婷
- 文献传递
- 聚丙烯酸烷基酯侧基差异对链构象性质的影响被引量：2
- 2010年
- 针对聚丙烯酸烷基酯侧基形状、极性的不同,基于高分子链的构象-构型统计理论和生成矩阵方法,推出均方电偶极矩和均方回转半径的改进公式,应用于聚丙烯酸甲酯(PMA)链和聚甲基丙烯酸乙酯(PEMA)链等的链构象依赖性质的研究.得到无规PMA4(4态PMA)和PEMA的偶极矩特征比分别为0.63和0.66,温度系数为-0.66×10-3 K-1和1.72×10-3 K-1,无规PMA和PEMA的均方回转半径的特征比分别为1.73和1.43,温度系数为-1.05×10-3 K-1和-1.28×10-3 K-1,均与实验结果符合.而且考虑链规整程度的不同和酯类基团方向等的改变,PMA和PEMA的特征比也呈现较大的差异,尤其对间同构型链PMA4短链,偶极矩及其温度系数均伴有极大值的出现,这些结果表明聚丙烯酸烷基酯侧基对其链构象性质的影响不能忽略.
- 马海珠孙婷婷
- 关键词：聚丙烯酸甲酯侧基均方回转半径
