巨艳
- 作品数：6 被引量：7H指数：1
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- 细粒棘球蚴原头节3种重组抗原的双向电泳定位分析被引量：1
- 2013年
- 目的利用已有的细粒棘球蚴(Echinococcus granulosus)原头节3种重组抗原rEgZW-5、rEg14-3-3和rEgP-29获得特异性抗体,以识别双向电泳图谱中相应的蛋白位点。方法十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)初步分离细粒棘球蚴原头节蛋白,预判断蛋白分布情况。应用双向电泳技术分离原头节蛋白,PDquest软件分析原头节的蛋白质数量、相对分子质量(Mr)和等电点(IP)。用原头节的3种重组蛋白rEgZW-5、rEg14-3-3和rEgP-29分别免疫新西兰家兔,制备血清,纯化抗体。蛋白质印迹(Western blotting)鉴定特异性抗体对原头节双向电泳图谱中相应蛋白的识别。结果SDS-PAGE结果显示,细粒棘球蚴原头节蛋白主要分布于Mr18 000～90 000区域。双向电泳分离出240个蛋白位点,为Mr15 790～117 050,IP为4.0～9.5,其中85.8%(206/240)蛋白等电点为5～9。Western blotting结果显示,rEg14-3-3特异性抗体可识别细粒棘球蚴原头节双向电泳图谱中约为Mr33 000、IP为4.86的14-3-3蛋白位点,rEgZW-5特异性抗体可识别约为Mr23 000、IP为4.98的ZW-5蛋白位点,rEgP-29特异性抗体可识别约为Mr29 000、IP为5.65的P-29蛋白位点。结论细粒棘球蚴原头节的3种重组抗原rEgZW-5、rEg14-3-3和rEgP-29的抗体可识别双向电泳图谱中相应的蛋白位点。
- 朱明星李君良巨艳高鹏赵巍
- 关键词：细粒棘球蚴原头节重组抗原双向电泳
- 细粒棘球绦虫原头蚴mRNA测序及表达谱分析
- 目的通过对细粒棘球绦虫原头蚴的mRNA的测序及表达谱分析，初步建立起细粒棘球绦虫原头蚴的表达谱数据库，了解细粒棘球绦虫原头蚴基因表达及蛋白构成情况，为全面了解细粒棘球绦虫原头蚴生物学特征及寄生虫与宿主之间的关系奠定基础并...
- 巨艳
- 关键词：原头蚴转录组学生物信息分析表达谱
- 文献传递
- 细粒棘球绦虫原头蚴mRNA测序及表达谱分析被引量：4
- 2015年
- 目的通过对细粒棘球绦虫原头蚴的mRNA的测序及表达谱分析,初步建立起细粒棘球绦虫原头蚴的表达谱数据库,了解细粒棘球绦虫原头蚴基因表达及蛋白构成情况,为全面了解细粒棘球绦虫原头蚴生物学特征及寄生虫与宿主之间的关系奠定基础并为新的诊断方法、筛选新的药物靶点和疫苗候选分子选择提供理论依据。方法用TRIZOL法提取人源细粒棘球绦虫原头蚴的总RNA,构建细粒棘球蚴的转录组测序文库,Illumina的solexa测序平台对RNA进行测序并进行生物信息学分析。结果测序结果去杂后得到2G数据,通过从头拼接我们得到18 569个contig,这些contig的总长度为71 329bp,contig平均长度为384bp,最小的contig长度为201bp,最大contig长度为4 618bp,N50(覆盖50%所有核苷酸的最大序列重叠群的长度)为384bp。预测得到unigene为9 029条,将这9 029条基因与NCBI的nr数据库做blast比对,最终有7 441条unigene具有同源比对信息。结论根据GO分析可以发现,共有10 550条unigene与数据库中的基因有较高同源性,且较多的unigene可以与多条基因相对应,一共建立了10 550条对应关系。通过与KEGG数据库进行比对分析,细粒棘球绦虫原头蚴的转录组中有4 731条unigene得到注释,这4 731个得到注释的基因位于241条代谢通路中,这些代谢通路分别与代谢过程,基因信息过程,环境相关过程,细胞过程及与人类疾病相关。
- 巨艳李子华王娅娜赵嘉庆朱明星李君良赵巍
- 关键词：原头蚴转录组学生物信息分析表达谱
- 细粒棘球蚴重组HSP70蛋白免疫保护力研究被引量：1
- 2013年
- 目的探讨细粒棘球蚴重组HSP70蛋白(rEgHSP70)免疫小鼠对原头蚴攻击感染的保护性效果。方法选取雌性6周龄ICR小鼠随机分为两组:实验组和对照组(每组10只),实验组接种rEgHSP70 3次,每次间隔两周,对照组注射等量的PBS。两组小鼠在末次免疫后2周用1500只活细粒棘球蚴进行腹腔攻击感染,攻击感染30周后剖杀小鼠,无菌取脾组织,并记录每只小鼠腹腔内包囊数量和直径,评价免疫保护力。用流式细胞仪检测脾组织中CD4+T细胞和CD8+T细胞,计算两者比值。结果细粒棘球蚴重组HSP70蛋白接种对原头蚴攻击感染的免疫保护力为44.20%,rEgHSP70免疫组小鼠脾CD4+T亚群(0.52±0.082)高于对照组小鼠(0.44±0.07),P<0.05,rEgHSP70免疫组小鼠脾淋巴细胞CD4+/CD8+T亚群比值(3.35±0.02)高于对照组(2.00±0.77),P<0.05。结论细粒棘球蚴重组HSP70可诱导小鼠产生44.20%免疫保护力,具有一定的疫苗潜力。
- 巨艳马斯明朱明星王娅娜王娅娜李君良
- 关键词：细粒棘球蚴保护力
- 细粒棘球蚴原头节mRNA测序及生物信息学初步分析
- 2014年
- 目的 利用RNA-seq技术对细粒棘球蚴原头节的转录组进行测序并对测序数据进行生物信息学分析,以揭示细粒棘球蚴原头节mRNA所包含的信息. 方法 用Trizol法提取原头节总RNA,分离mRNA,利用Illumina公司的HiSeq2000高通量测序仪对mRNA序列进行测序.参考英国桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）公布的细粒棘球绦虫基因组数据,对测序数据进行拼接组装,将获得的unigene与非冗余的蛋白序列数据库（non-redundant,Nr）、全球蛋白资源数据库（universal protein,UniProt）、基因本体数据库（gene ontology,GO）以及日本京都基因和基因组百科全书通路数据库（the kyotoencyclopedia of genes and genomes pathway,KEGG pathway）进行比对,获得该unigene的蛋白功能注释信息. 结果 测序后共获得132 007 609条读段（reads）,经过组装共形成91 342条unigene,平均长度为419 bp.通过GO分类注释,共有36 552个unigene获得了注释信息,分别归入到了生物学过程、分子功能、细胞组分3大类共计48个功能组.通过KEGG pathway的注释,有6 664条unigene注释到了KEGG上,参与了6大类生物过程中34个小类的代谢,共有227个代谢通路. 结论 获得了细粒棘球蚴原头节转录组相关信息,为棘球蚴病的后续研究提供了研究数据,积累了研究资料.
- 朱明星王娅娜巨艳王志昇朱佳佳赵巍
- 关键词：转录组生物信息学分析
- 宁夏布鲁氏菌Omp31基因序列特征分析被引量：1
- 2015年
- 目的目的对宁夏布鲁氏菌Omp31基因序列进行分析,为菌株种型鉴定和试剂研究奠定基础。方法根据Genebank公布Omp31基因序列设计引物,采用PCR扩增、电泳检测、胶回收、纯化、送基因公司双向测序,用Contig Express软件对测序结果拼接,用DNAstar软件进行结果分析。结果经PCR扩增测序得到Omp31基因全长序列大小为723 bp,编码240个氨基酸,与Genebank上羊种布鲁氏菌Omp31基因同源性达99.9%,氨基酸序列的同源性100%。通过遗传分析,分离株与参考菌亲缘关系相近,与羊种布鲁氏菌处在同一分枝。结论宁夏布鲁氏菌Omp31序列与发布的参考序列之间的同源性很高,而且与羊种布鲁氏菌处在同一分支。
- 高建炜马学平王志翔韩坤张术斌巨艳陈丽莉詹军
