彭金霞
- 作品数：13 被引量：28H指数：3
- 供职机构：广西水产研究所更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划中央级公益性科研院所基本科研业务费专项广西壮族自治区科学研究与技术开发计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 凡纳滨对虾TCP-1-Beta基因的克隆及其与耐寒性状的相关性被引量：5
- 2011年
- 为研究凡纳滨对虾耐寒性状的分子机理,研究克隆了凡纳滨对虾耐寒相关基因TCP-1-Beta并对其与耐寒性状的关系进行了研究。根据电子克隆所得序列设计引物,采用RT-PCR方法克隆得到长1691 bp的凡纳滨对虾TCP-1-Beta基因序列,其中包括1608 bp的完整开放阅读框,编码535个氨基酸残基。然后,运用荧光定量PCR对TCP-1-Beta基因进行时空表达谱的分析：组织表达谱的结果显示,该基因在凡纳滨对虾肝胰腺组织中表达量最高;不同低温处理下的表达结果显示,在28℃和15℃处理下基因表达量无显著变化,13℃开始呈上调表达,11℃时表达量升高;13℃低温处理发现该基因在24h内表达量无显著变化,但36h后表达量显著升高。采用PCR-RFLP方法对216尾凡纳滨对虾TCP-1-Beta基因进行了SNP多态性检测,并将其与耐寒性状进行了关联分析。在该基因编码区第420碱基上发现G/A突变,方差分析结果表明该位点的不同基因型与耐寒力指标CDH值相关（P〈0.05）,其中GG基因型的耐寒能力比AA基因型强。
- 彭金霞殷勤崔亮王志伟李奎陈晓汉
- 关键词：凡纳滨对虾SNPPCR-RFLP
- 凡纳滨对虾类泛素折叠修饰蛋白Ufm1基因克隆、序列分析及结构预测
- 2011年
- 【目的】了解类泛素折叠修饰蛋白(Ufm1)的结构特征和蛋白功能,为进一步探究Ufm1基因功能提供参考。【方法】以同一生长性状分离凡纳滨对虾家系的肌肉组织为材料,构建凡纳滨对虾生长性状差减cDNA文库,通过斑点杂交筛选获得Ufm1基因,经全长cDNA文库筛选获得Ufm1基因全长序列。【结果】Ufm1基因全长cDNA序列长714bp,包含261bp的开放阅读框,推测编码的蛋白质为86个氨基酸,预测的分子量为9.3ku,等电点pI为6.55;其编码蛋白无信号肽,无跨膜区域,可能定位于细胞质中,属于亲水性蛋白,含有1个酪蛋白激酶II磷酸化位点、1个N-糖基化位点、2个蛋白激酶C磷酸化位点;序列同源性分析表明,不同进化地位物种的Ufm1基因存在较高的同源性。【结论】Ufm1基因在系统进化上高度保守,这为进一步探究Ufm1基因功能及原核表达等奠定了基础。
- 盛小伟高永华彭金霞李咏梅陈晓汉熊建华
- 关键词：凡纳滨对虾差减CDNA文库生物信息学
- 对虾WSSV病毒VP281基因的siRNA筛选研究
- 2011年
- 构建一个对虾WSSV VP281基因的siRNA筛选体系,获取有效siRNA,为进一步开展siRNA抗WSSV研究建立基础。根据已报道的VP281基因编码序列,设计并合成一对引物,扩增出带双酶切位点的VP281。对VP281和质粒pEGFP-C1分别酶切后进行连接,获取表达载体pEGFP-VP281。利用专业软件设计3对靶向VP281的siRNA(VP281-siRNA1﹑VP281-siRNA2﹑VP281-siRNA3),并合成siRNA,将3种siRNA分别与pEGFP-VP281共转染PK细胞。采用Western blot方法检测GFP-VP281融合蛋白的表达,半定量RT-PCR方法检验siRNA抑制VP281基因转录的效果。结果显示,pEGFP-VP281可在BHK细胞正常表达融合蛋白GFP-VP281。3对siRNA对GFP-VP281的mRNA转录均有不同程度的干扰效果,siRNA2的干扰效果最为显著。构建针对WSSV-VP281基因的siRNA筛选体系,初步验证了该系统的有效性,为开展siRNA抗WSSV研究建立了基础。
- 黎铭陈晓汉陈秀荔彭金霞马春霞蒋伟明彭敏赵永贞杨春玲李咏梅
- 关键词：对虾WSSVRNA干扰
- 凡纳滨对虾HSP10基因序列与低温表达分析被引量：2
- 2013年
- 【目的】克隆分析凡纳滨对虾HSP10基因,为研究其在寒冷耐受过程中发挥调控功能提供参考依据。【方法】搜索EST库获得凡纳滨对虾HSP10基因序列,再通过RACE-PCR扩增获得凡纳滨对虾HSP10基因cDNA全长序列,对其进行生物信息学分析,并通过荧光定量PCR分析HSP10基因的组织表达及低温胁迫下表达量的变化。【结果】凡纳滨对虾HSP10基因cDNA全长720bp,包含306bp的开放阅读框,编码102个氨基酸。以各物种的HSP10蛋白序列构建系统进化树,能较好反映各物种间的进化关系。荧光定量PCR分析结果显示,凡纳滨对虾HSP10 mRNA在各组织中呈遍在表达,其中以肌肉中的表达量最高。低温表达谱分析结果显示,凡纳滨对虾HSP10 mRNA在低温处理凡纳滨对虾的各组织中均呈下调表达,当处理温度降至13℃,其在肝胰腺中表达量降至最低。【结论】凡纳滨对虾HSP10在结构和进化上较保守,其mRNA表达量在低温胁迫下呈下降趋势,可能在寒冷耐受过程中发挥负调控作用。
- 彭金霞韦嫔媛殷勤蒋小珍黎铭陈晓汉
- 关键词：凡纳滨对虾热休克蛋白荧光定量PCR
- 凡纳滨对虾TCP-1-eta基因的克隆及与耐寒性状的相关性被引量：14
- 2011年
- 为研究凡纳滨对虾耐寒性状的分子机理,文章克隆了凡纳滨对虾的耐寒相关基因TCP-1-eta并对其与耐寒性状的关系进行了研究。首先,根据电子克隆所得序列设计引物,采用RT-PCR方法克隆得到长1 705 bp的TCP-1-eta基因序列,其中包括1 629 bp的完整开放阅读框,编码542个氨基酸残基。然后,运用荧光定量PCR对TCP-1-eta基因进行时空表达谱的分析:(1)组织表达分析结果显示,该基因在凡纳滨对虾肌肉组织中表达量最高;(2)不同低温处理下的表达结果显示,该基因在15℃开始呈上调表达,13℃时表达量最高;(3)13℃低温处理的表达结果显示,该基因在36 h内呈小幅上调表达,但36 h后表达量显著升高,48 h表达量达到0 h的150倍。进一步采用PCR-RFLP方法对216只凡纳滨对虾TCP-1-eta基因进行了SNP多态性检测,并将其与耐寒性状进行了关联分析。在该基因编码区第731碱基上发现C/T突变,方差分析结果表明该位点的不同基因型与耐寒力指标CDH(Cooling-degree hours)值相关(P<0.05),其中CC基因型的耐寒能力比TT基因型强。
- 殷勤彭金霞崔亮谢达祥王志伟李奎陈晓汉
- 关键词：凡纳滨对虾SNP
- 卵形鲳鲹线粒体COI基因全长序列的克隆与分析被引量：5
- 2011年
- 根据近源物种线粒体序列的同源比对,在COI基因上下游保守区域设计一对通用引物COF/COR。以卵形鲳鲹肌肉总DNA为模板,PCR扩增获得特异的DNA片段,经克隆、测序和比对证实该片段包含了卵形鲳鲹线粒体COI基因完整编码区1551bp。对5个个体分别测序后比对,发现卵形鲳鲹COI基因DNA序列在钦州湾种群个体间至少存在7个变异位点,使5个个体分别具有5种不同的单倍型。将卵形鲳鲹种内不同个体及鲹科其他物种的CO I核酸序列进行比较分析,根据比对结果构建鲳鲹科各物种的系统进化树,支持鲹科下设四个亚科(鲹亚科,鰤亚科,鲳鲹亚科,鰆鲹亚科)的分类系统。通过COI基因遗传距离计算发现,卵形鲳鲹种内不同地理种群个体间遗传距离为0.001～0.005,显著低于Hebert等所推荐的物种鉴定最小种间遗传距离2%,而鲹科不同物种间遗传距离大于0.044,与形态学分类一致,说明COI作为卵形鲳鲹DNA条形码应用是可行的。
- 韦嫔媛彭金霞房振峰彭敏蒋伟明杨春玲李咏梅
- 关键词：卵形鲳鲹线粒体COI基因系统发育进化树DNA条形码
- VP28蛋白鸡源抗WSSV卵黄抗体的制备及性能分析被引量：1
- 2010年
- 为了研制鸡源抗对虾白斑综合征病毒(WSSV)卵黄抗体(IgY),利用WSSV毒株及其衣壳蛋白VP28制备成2种不同的疫苗,并分别免疫接种健康蛋鸡群,使鸡群产生不同的IgY,经病毒中和试验证实,2种IgY均有明显的抗WSSV效果,其中WSSV粗提液1∶1000倍稀释时,WSSV灭活苗免疫蛋鸡产生的IgY对南美白对虾的保护率为61.7%,重组VP28疫苗免疫蛋鸡产生的IgY保护率为48.3%;而WSSV粗提液1∶10000倍稀释时,WSSV灭活苗免疫蛋鸡产生的IgY保护率为85.0%,重组VP28疫苗免疫蛋鸡产生的IgY保护率为75.0%。
- 黎铭谢达祥李咏梅赵永贞曾地刚彭金霞杨彦豪韦嫔媛陈晓汉
- 关键词：南美白对虾
- 凡纳滨对虾的良种培育
- 随着凡纳滨对虾养殖范围和规模的迅速扩大,苗种质量、病害等问题成为产业可持续发展的制约因素.在过去的20年间,美洲和亚洲都启动了对虾的育种项目,围绕产量、抗病、抗逆等经济性状开展优良新品种的选育.通过对凡纳滨对虾的育种方法...
- 陈晓汉熊建华彭金霞赵永贞谢达祥
- 关键词：凡纳滨对虾良种培育遗传性状
- 对虾白斑病毒VP15基因的RNA干扰体外研究
- 2010年
- VP15是南美白对虾WSSV病毒的一个核衣壳蛋白基因。采用体外干扰实验筛选对VP15具有针对性的siRNA。实验构建了真核表达载体pEGFP-VP15,并将设计的siRNA以及pEGFP-VP15共转染BHK细胞。采用Western blot方法检测GFP-VP15融合蛋白的表达,半定量RT-PCR方法检验siRNA抑制VP15基因转录的效果。实验结果表明,pEGFP-VP15在PK细胞正常表达,设计的3对siRNA对GFP-VP15的mRNA转录均有不同程度的干扰效果;其中,siRNA1的干扰效果最为显著。实验结果为下一步对虾体内干扰WSSV病毒复制研究以及筛选更多的特异siRNA建立基础。
- 黎铭陈晓汉马春霞蒋伟明马宁熊建华彭金霞陈秀荔彭敏曾地刚李咏梅
- 关键词：WSSVRNA
- 养殖文蛤病害研究进展及前景展望被引量：2
- 2012年
- 文蛤是重要的海洋经济贝类,随着人工养殖的发展,暴发性死亡病害频繁发生,造成重大的经济损失。文章通过归纳总结分析,对养殖文蛤病毒性疾病、细菌性疾病、寄生虫性疾病等主要病害的病原体与致病症状、流行规律、组织病理学、检测与诊断、预防和治疗方法等进行综合评述,并展望其研究应用前景。
- 张彬黄婷熊建华谢达祥韦嫔媛彭金霞陈晓汉
- 关键词：文蛤暴发性死亡病害
