曹婷婷
- 作品数：9 被引量：42H指数：5
- 供职机构：中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划国家现代农业产业技术体系建设项目国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 草鱼生长相关SNPs的筛选和群体的遗传结构分析
- 草鱼/(Ctenopharyngodon idella/)，隶属于鲤形目（Cypriniformes），鲤科（Cyprinidae），雅罗鱼亚科（Leuciscus），草鱼属（Grass carp）。具有生长快，肉质鲜美...
- 曹婷婷
- 关键词：体质量
- 文献传递
- 草鱼醛缩酶B基因部分片段的SNP多态性及其与生长性状的关联分析
- 醛缩酶属糖酵解酶,在糖酵解和果糖代谢中起着关键和枢纽作用,醛缩酶B相对于A型和C型则既参与糖酵解又参与糖异生。本研究通过提供的草鱼EST库的醛缩酶B基因重叠群的2个Contig扩增该基因的序列片段,采用直接测序法,经过序...
- 曹婷婷白俊杰
- 关键词：草鱼SNP
- 文献传递
- 草鱼羧肽酶A4基因部分序列多态性及生长性状关联分析被引量：2
- 2012年
- 【目的】筛选出更多与草鱼生长相关的SNP位点标记,为草鱼分子育种研究提供理论依据。【方法】根据草鱼EST数据库中属于消化酶的羧肽酶A4基因的cDNA序列设计引物,采用PCR产物直接测序法,对含预计SNP位点的cDNA序列进行扩增、测序,并寻找新的SNP位点。【结果】cDNA上预计的SNP位点不存在,但在内含子3上检测到两个SNP位点,分别位于内含子的第40、241个碱基处,命名为A40G位点和G241T位点。经创造酶切位点的限制性片段长度多态检测(CRS-RFLP),发现A40G位点AA型占50.3%、AG型占23.8%、GG型占25.9%,G241T位点的GG型占48.6%、GT型占47.9%、TT型占3.5%。利用一般线性模型(GLM)将两个SNP位点与草鱼6个生长性状进行关联分析,结果表明,A40G位点的GG型个体在体重、体长、体高均高于AA型和AG型,但差异不显著(P>0.05);G241T位点TT型个体最重,GG型最轻,但差异不显著(P>0.05);A40G和G241T两个位点组成的7种双倍型个体的体重、体长、体高、尾柄高等重要生长性状差异也不显著(P>0.05)。【结论】在草鱼羧肽酶A4基因的内含子3上发现两个SNP位点(A40G位点和G241T位点),每个SNP位点都可分为3种基因型,但两个SNP位点的不同基因型以及由其组成的双倍型与草鱼的重要生长指标均不存在显著相关。
- 曹婷婷刘小献白俊杰于凌云
- 关键词：草鱼SNP位点基因型生长性状
- 草鱼遗传结构和遗传多样性的研究概况被引量：10
- 2012年
- 主要从形态学标记、DNA分子遗传标记和蛋白标记这3个水平上综述了近年来学者们对黑龙江、长江和珠江三大水系间、长江水系内、野生群体与养殖群体间的草鱼遗传结构和遗传多样性的研究情况。得出了如下结论:草鱼的遗传多样性较低,野生群体较养殖群体遗传多样性高。通过研究草鱼的遗传多样性,最终以达到通过不同的标记方法来筛选遗传多样性高的标记位点,用于草鱼的分子辅助育种的目的。
- 曹婷婷白俊杰王解香于凌云
- 关键词：草鱼分子标记
- 草鱼醛缩酶B基因部分序列的SNP多态性及其与生长性状的关联分析被引量：10
- 2012年
- 通过佛山市白金水产良种选育场提供的草鱼EST库的醛缩酶B基因重叠群的2个Contig扩增该基因的序列片段,采用直接测序法,经过序列比对,共筛到C+687G、C+1042A和A117C等3个颠换SNPs位点。C+687G位于醛缩酶B基因外显子6的63 bp处,为同义突变;C+1042A位于外显子8的43 bp处,为错义突变;A117C位于内含子7的117 bp处。采用Snapshot方法对同一群体的296尾草鱼的这3个SNPs位点进行检测和分型,并统计基因型频率。3个SNPs位点中AA的频率分别为42.9%、32.8%、32.8%;AB的频率分别为42.9%、45.9%、45.6%;BB的频率分别为14.2%、21.3%、21.6%。利用一般线性模型分析3个SNPs位点与草鱼体质量、体长等重要生长性状的关系,关联分析结果显示,C+687G位点不同基因型只在体长/尾柄长比值上存在显著差异(P<0.05),和体质量等重要生长性状不相关。A117C和C+1042A两个位点都在体质量等4个生长性状上存在显著差异(P<0.05)。将3个SNPs位点不同基因型两两位点组成3个组合的双倍型(都去掉了频率小于3%的组合),结果显示,C+687G和A117C以及C+687G和C+1042A的2个组合分别组成的7种双倍型在体质量等5个生长性状上都存在显著差异(P<0.05);A117C和C+1042A组成的3种双倍型在体质量、眼间距等2个生长性状上都存在显著差异(P<0.05)。研究认为,可以考虑将草鱼醛缩酶B基因作为生长相关的候选基因,用于草鱼的分子辅助育种。
- 曹婷婷白俊杰于凌云樊佳佳
- 关键词：草鱼基因型
- 大口黑鲈北方亚种、佛罗里达亚种及其杂交子代的生长和形态差异分析被引量：8
- 2012年
- 以大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种为亲本,建立了北方亚种自交N(北方亚种♀×北方亚种♂)、佛罗里达亚种自交F(佛罗里达亚种♀×佛罗里达亚种♂)、正交子代NF(北方亚种♀×佛罗里达亚种♂)和反交子代FN(佛罗里达亚种♀×北方亚种♂)4个试验群体,并对其生长性能和形态学差异进行了比较。N、NF和FN的生长性能比较结果表明,在90～152日龄期间,3个试验群体生长速率差别不大,在152日龄后大口黑鲈北方亚种的生长速度明显快于两杂交子代。可数性状的分析结果表明,4个试验组在腹鳍、臀鳍硬棘、鳃耙和脊椎骨上均无差异;正反交子代与两亲本在背鳍条、胸鳍条、臀鳍条、尾鳍条、侧线上鳞、侧线下鳞的数量上均达到极显著差异(P<0.01)。可量性状和框架结构数据的聚类分析结果表明,N和F聚为一支,NF和FN聚为一支,然后这两支再汇聚;主成分分析概括出方差贡献率较大的3个主成分,累积贡献率为71.44%,主成分1主要反映鱼体框架的变化,方差贡献率为54.90%,主成分2和主成分3主要反映鱼的头部、背部和尾部的形态变化,方差贡献率分别为11.21%和5.33%。在35个测量参数中挑选11个对判别贡献较大的参数建立4个群体的判别函数,判别准确率为83.90%～100.00%。研究结果为杂种大口黑鲈的鉴定、育种及养殖提供了科学依据。
- 蔡磊白俊杰李胜杰陈昆慈曹婷婷
- 关键词：大口黑鲈杂交子代
- 六个不同地域草鱼群体遗传多样性和遗传距离的EST-SNP标记分析
- 草鱼广泛分布于中国的不同流域,是中国最重要的养殖品种之一。本研究利用草鱼EST数据库中开发的21个SNP标记位点,采用Snapshot基因分型方法对来自长江和珠江水系6个草鱼群体(石首、监利、洪湖、沅江、内乡、佛山)进行...
- 于凌云白俊杰曹婷婷樊佳佳全迎春马冬梅叶星
- 关键词：草鱼单核苷酸多态性基因多样性
- 文献传递
- 大口黑鲈溃疡综合征病毒MCP基因的原核表达及重组蛋白的免疫效果初步分析被引量：6
- 2016年
- 为了预防近年来流行于广东省养殖大口黑鲈(Micropterus salmoides)中的病毒性溃疡综合征,以大口黑鲈溃疡综合征病毒(Largemouth bass ulcerative syndrome virus,以下简称LBUSV)的主要衣壳蛋白(MCP)作为目标抗原蛋白,将MCP基因开放阅读框插入到pBV220载体中,转化大肠杆菌DH5α,构建重组表达MCP蛋白的工程菌。重组菌经过42℃温度诱导和SDSPAGE电泳,检测到在分子量51 k D处有一条特异表达蛋白带,重组蛋白约占重组菌体总蛋白的30%。重组MCP蛋白经洗涤、纯化、溶解、复性和透析后纯度达90%以上。将纯化后的重组蛋白与不完全弗氏佐剂混合、乳化后,免疫大口黑鲈,然后进行感染实验,感染后20 d疫苗保护率最高达67.7%。结果表明,该病毒MCP蛋白具有一定的免疫原性,可以作为制作重组疫苗的候选蛋白。
- 马冬梅邓国成白俊杰江小燕曹婷婷蔡磊
- 关键词：大口黑鲈原核表达免疫效果
