杨培
- 作品数：14 被引量：94H指数：7
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划长江学者和创新团队发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 药用模式生物研究策略被引量：3
- 2014年
- 模式生物是用于研究某种特定的生物学现象而被选定的物种.基于模式生物的研究策略已经在多个生物学领域取得巨大的成功,揭示了众多生命科学的机理,发展了一系列生命科学研究技术.近年来,现代生物学发展迅速,其相关的概念和技术正不断渗入并影响着药用生物的研究领域,包括基于模式生物的研究策略.丹参(Salvia miltiorrhiza)、灵芝(Ganoderma lucidum)等模式药用生物已经提出了多年,受到国内外的广泛关注.但是由于缺乏成熟的模式药用生物研究体系,使得当前药用生物的研究成果比较分散,难以在理论水平上汇总提高,极大地消耗了药用生物界的研究资源和研究力量,阻碍了药用生物学的发展.本文结合近期药用生物学的研究成果,从药用模式生物研究体系建立的必要性出发,提出了药用模式生物研究体系的基本概念和建立目的,分析了应用药用模式生物研究体系研究的可行性,提出了药用模式生物的选择原则并从遗传信息获得、遗传转化体系建立、突变体库构建和次生代谢物生产体系建立4个方面描述了药用模式生物研究体系的建立策略.本文还介绍了以药用模式生物为对象的次生代谢产物生源合成及调控研究策略,同时认为,药用模式生物体系在阐释药材道地性等中医药传统问题及发展合成生物学等现代科学前沿中发挥重要作用.
- 徐江孙超徐志超季爱加胡鸢雷孙伟王丽芝汪波杨培张鑫宋经元陈士林
- 关键词：模式生物道地药材合成生物学
- 应用ITS2条形码鉴定中药材地黄被引量：9
- 2013年
- 目的:应用ITS2条形码序列准确、快速鉴定中药材地黄及其同属密切相关种,以确保该药材的质量及临床用药安全。方法:PCR扩增产物测序后所得序列经质量分析和拼接,计算地黄及其同属物种的种内、种间K2P遗传距离,基于K2P模型构建NJ树,对地黄药材进行鉴定。结果:地黄药材ITS2序列长度为231 bp,种内变异较小,平均K2P遗传距离为0.000 4,地黄药材及其同属密切相关种的种间平均K2P遗传距离为0.031 2,种间最小K2P遗传距离大于地黄药材种内的最大K2P遗传距离。利用构建的NJ树可以明显鉴定中药材地黄。结论:ITS2作为条形码可以有效鉴定中药材地黄及其同属的密切相关种,为保障地黄药材的临床安全用药奠定了基础。
- 侯典云辛天怡杨培姚辉
- 关键词：地黄ITS2DNA条形码
- 基于ITS2序列鉴别前胡和紫花前胡药材及其混伪品被引量：8
- 2014年
- 为应用ITS2序列对前胡、紫花前胡药材及其混伪品进行DNA条形码鉴定研究,该文依据国家药典委员会公布的《中药材DNA条形码分子鉴定指导原则》,PCR扩增前胡、紫花前胡及其混伪品的ITS2序列并进行双向测序。经CodonCode Aligner V 3.7.1对测序峰图进行校对拼接,采用MEGA5.0软件分析相关数据。结果表明：前胡药材的ITS2序列长度为229~230 bp,种内变异较小,平均K2P遗传距离为0.005。紫花前胡药材的ITS2序列长度为227 bp,种内无变异。前胡、紫花前胡药材与其混伪品的种间平均K2P遗传距离分别为0.044,0.065。紫花前胡的种间最小K2P遗传距离明显大于其种内的最大K2P遗传距离。最小距离法和NJ树鉴定结果表明前胡、紫花前胡均能与其混伪品明显区分。因此,ITS2序列可有效鉴别前胡、紫花前胡药材及其混伪品。
- 侯典云宋经元杨培周红辛天怡姚辉
- 关键词：前胡紫花前胡混伪品ITS2
- 中药材锁阳的ITS2条形码分子鉴定研究被引量：16
- 2013年
- 目的:应用DNA条形码技术准确、快速鉴定中药材锁阳及其混伪品。方法:采用试剂盒法提取药材的基因组DNA,PCR扩增其核糖体DNA的内转录间隔区(internal transcribed spacer 2,ITS2)并进行双向测序,应用CodonCode Aligner V3.7.1对测序峰图进行校对拼接,比较ITS2序列的GC含量,采用MEGA 5.0计算种内、种间Kimura 2-parameter(K2P)遗传距离,通过中药材DNA条形码鉴定系统比对和构建NJ系统聚类树进行鉴定分析。结果:锁阳药材的ITS2序列长度为229 bp,种内变异较小,平均K2P遗传距离为0.003,锁阳药材及其混伪品的种间平均K2P遗传距离为0.760,种间最小K2P遗传距离明显大于锁阳种内的最大K2P遗传距离。中药材DNA条形码鉴定系统比对和NJ树鉴定结果均表明ITS2序列可区分锁阳及其混伪品。结论:ITS2条形码可有效鉴定中药材锁阳及其混伪品,且具有较好的稳定性和准确性,为保障临床安全用药提供了新的技术手段。
- 侯典云宋经元石林春杨培陈士林姚辉
- 关键词：锁阳DNA条形码ITS2分子鉴定
- 基于DNA序列的石斛属药用植物鉴定研究进展被引量：4
- 2015年
- 本文从核基因组、线粒体基因组和叶绿体基因组三方面,综述了目前常用DNA序列在石斛属药用植物的分子鉴定和物种分类研究中的进展。文献显示,目前用于石斛属物种分子鉴定研究的DNA序列主要有核ITS/ITS2、LEAFY,叶绿体rbc L、mat K、trn H-psb A、rpo B、rpo C1、trn L-F、rbl16、trnl intron和线粒体基因组nad1 intron2,这些DNA序列均对石斛属药用植物鉴定具有借鉴意义。笔者对叶绿体全基因组序列作为"超级条形码"在石斛属植物中应用的可行性进行了展望,以期为石斛属药用植物的鉴定研究提供参考。
- 周红马双姣杨培姚辉
- 关键词：石斛属DNA序列分子鉴定核基因组叶绿体基因组线粒体基因组
- 基于ITS2序列的北豆根药材及其混伪品分子鉴定研究
- 为准确、快速鉴定中药材北豆根及其混伪品,保证临床用药安全,考察ITS2序列对北豆根及其混伪品鉴定能力,本研究采用试剂盒法提取药材的基因组DNA,PCR扩增其核糖体DNA的内转录间隔区(internal transcrib...
- 杨培侯典云宋经元张辉陈士林姚辉
- 关键词：中药材北豆根条形码分子鉴定
- 文献传递
- 鸦胆子药材及其混伪品的ITS2序列分子鉴定研究被引量：1
- 2015年
- 目的:通过分析鸦胆子及其混伪品的ITS2序列,探究鉴定鸦胆子药材及其混伪品的新方法。方法:采用改良的CTAB法提取鸦胆子及其混伪品的基因组DNA,PCR扩增ITS2片段。对其进行双向测序,应用MEGA6.0软件进行序列分析,计算种内、种间遗传距离,构建邻接树。结果:鸦胆子药材ITS2序列长度为230 bp,种内最大K2P遗传距离为0.018,小于其与混伪品的种间平均K2P遗传距离0.493。NJ树结果表明鸦胆子序列和柔毛鸦胆子序列聚为一支,与其他混伪品可明显区分。鸦胆子与柔毛鸦胆子在35位点处有一变异位点,利用此位点能将鸦胆子与柔毛鸦胆子区别开来。结论:ITS2可作为鸦胆子药材及其混伪品鉴定的DNA条形码序列,为保障临床用药安全提供了新的技术手段。
- 马双姣杨培周红孙伟姚辉李永华
- 关键词：鸦胆子ITS2DNA条形码混伪品
- 基于ITS2序列的北豆根药材及其混伪品分子鉴定研究
- 为准确、快速鉴定中药材北豆根及其混伪品,保证临床用药安全,考察ITS2序列对北豆根及其混伪品鉴定能力,本研究采用试剂盒法提取药材的基因组DNA,PCR扩增其核糖体DNA的内转录间隔区(internal transcrib...
- 杨培侯典云宋经元张辉陈士林姚辉
- 关键词：北豆根ITS2DNA条形码分子鉴定混伪品
- 铁皮石斛的完整叶绿体基因组序列
- [背景与目的]铁皮石斛具有很高的药用和经济价值,因价格昂贵,市场上常有以次充好、以假乱真的现象.本研究为石斛属植物的DNA条形码筛选、物种进化和叶绿体基因组工程研究提供依据.[材料与方法]选取铁皮石斛的幼嫩叶片,运用改良...
- 杨培周红钱俊徐海滨邵清松李永华姚辉
- 黄精属药用植物DNA条形码鉴定研究被引量：21
- 2015年
- 目的:评价DNA条形码候选序列对黄精属药用植物的鉴定能力。方法:对44份黄精属样品应用通用引物扩增其叶绿体rbc L、mat K、psb A-trn H及核ITS2和ITS序列,分析其种内种间变异和barcoding gap,应用BLAST和Nearest Distance方法计算物种鉴定效率。结果:ITS2和ITS序列通用引物扩增效率低,叶绿体mat K序列获得率最低,rbc L最高,三条序列种内与种间变异均较小,无明显的barcoding gap。基于BLAST和Nearest Distance方法计算,三条叶绿体序列对黄精属药用植物的鉴定效率均较低。结论:DNA条形码候选序列psb A-trn H、mat K及rbc L不适用于黄精属药用植物的鉴定,叶绿体全序列或通过叶绿体全序列筛选合适的DNA片段可能是该属药用植物分子鉴定的方向。
- 杨培周红辛天怡马双姣段宝忠姚辉
- 关键词：黄精属分子鉴定DNA条形码
