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纪蕾: 作品数：75 被引量：278H指数：8; 供职机构：湖州市疾病预防控制中心更多>>; 发文基金：湖州市科技计划项目浙江省医药卫生科学研究基金湖州市自然科学基金更多>>; 相关领域：医药卫生农业科学轻工技术与工程生物学更多>>

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湖州市非细菌性急性胃肠炎暴发中诺如病毒的分子生物学特点初步研究被引量：5: 2011年; 本文初步研究了湖州市非细菌性急性胃肠炎暴发中检出的诺如病毒的分子生物学特征。收集湖州市2008年和2009年2起非细菌性急性胃肠炎暴发疫情中采集的患者粪便标本,采用荧光定量RT-PCR方法对其进行诺如病毒核酸检测,并对核酸阳性标本进行RNA多聚酶部分区域的RT-PCR扩增。选取阳性扩增产物进行纯化及序列测定,结合诺如病毒GI、GII各基因型参考株进行核苷酸序列遗传进化分析。结果2起疫情均同时检出了GI和GII型诺如病毒。随后对其中4份RNA多聚酶区扩增阳性的标本进行测序及序列分析,结果发现2008年检出的2株GI型诺如病毒均为GI/2基因型;而2009年检出的1株GI型诺如病毒为GI/3基因型,另一株GII型诺如病毒则与近些年欧洲和亚洲相继出现的遗传组GII的新基因型GIIb的各代表株同源性最高,为GIIb基因型。这说明湖州地区流行的诺如病毒存在很高的遗传多样性,并且不同时间流行的基因型也存在一定差异。这也是国内首次在急性病毒性胃肠炎暴发中检出诺如病毒GIIb变异株。; 纪蕾吴晓芳徐德顺龚黎明; 关键词：诺如病毒

2018—2020年湖州市食源性疾病患者感染沙门菌耐药与分子分型研究: 2022年; 目的分析湖州市食源性疾病患者所分离沙门菌的血清型别、耐药状况以及分子分型特征,为沙门菌引起的食源性疾病防治提供科学依据。方法收集2018—2020年湖州市6家食源性疾病监测哨点医院分离到的105株阳性沙门菌株,采用玻片凝集法、微量肉汤稀释法和脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)法,分别进行血清学分型、抗生素最小抑菌浓度测定和分子分型。结果105株沙门菌主要是鼠伤寒沙门菌(37/105)和肠炎沙门菌(19/105)。沙门菌菌株对30种抗生素的耐药率为0%~70.48%,氨苄西林耐药率最高,达到70.48%(74/105),其次为四环素和多西环素,耐药率分别为67.67%(71/105)和65.71%(69/105)。分子分型显示,经XbaⅠ酶酶切后,105株沙门菌产生93个PFGE带型,各带型相似度28.50%~100.00%。结论湖州地区食源性沙门菌耐药情况严重,PFGE带型既有多样性,又具有优势带型。; 严伟查赟峰纪蕾沈月华吴丹青; 关键词：沙门菌食源性疾病耐药性脉冲场凝胶电泳分子分型

一种引物及利用该引物检测GⅠ型GⅡ型诺如病毒的方法: 本发明涉及一种引物及利用该引物检测GⅠ型GⅡ型诺如病毒的方法，属于生物检测技术领域。一种引物，它的序列如下：Nov-F：5-GTGAATGAWGATGGCGTCKA-3，Nov-R：5-GTHAGWATCCAGGGGTC...; 韩建康张红河吴晓芳纪蕾徐德顺汤仁树; 文献传递

湖州市严重急性呼吸道感染儿童病例中人偏肺病毒的流性特征分析: 2023年; 目的为了解湖州市严重急性呼吸道感染(SARI)儿童住院病例中人偏肺病毒(hMPV)的流行特征。方法收集2021年1月-2022年12月湖州市第一人民医院SARI儿童住院病例的咽拭子标本,采用多重荧光PCR的方法进行hMPV及其他常见呼吸道病毒检测。hMPV阳性样品进一步对其F基因进行测序已确定其基因型别。结果共收集629例SARI儿童住院病例标本,病毒检出阳性率为20.03%(126/629)。其中呼吸道合胞病毒RSV检出阳性率最高,为9.38%(59/629),人偏肺病毒hMPV检出阳性率为2.07%(13/629)。hMPV感染在各年龄组儿童均有发现,其中>1岁~3岁组检出阳性率最高。hMPV的检出高峰主要集中在冬季和春季。基于F基因的系统进化分析显示湖州地区流行的hMPV包括A、B2个基因型,其中B1基因亚型4例,B2基因亚型2例,A2c基因亚型4例,未检出A1基因亚型。结论湖州地区hMPV感染呈季节性流行,存在A2c基因亚型、B1基因亚型和B2基因亚型共流行。; 纪蕾徐德顺卢忠豪; 关键词：人偏肺病毒基因分型

光滑假丝酵母菌ITSⅠ区PCR-SSCP分子流行病学分析: 2008年; 目的建立基于聚合酶链反应的单链构象多态性分析(PCR-SSCP)技术,对引起常见医院感染的光滑假丝酵母菌进行基因多态性分析,并探讨改善其灵敏度和分辨率的优化条件。方法采用PCR-SSCP技术对临床分离的19株光滑假丝酵母菌以及1株标准株ATCC90030的rDNA的ITSⅠ区(引物ITS1/ITS2)和ITSⅡ区(引物ITS3/ITS4)多态性进行分析,并对PCR-SSCP的条件进行优化。结果ITSⅠ区较ITSⅡ区保守性低,变异性较强,较为适合SSCP分型。针对ITSⅠ区,SSCP电泳在无甘油时,4℃和15℃均将菌株分为6型,但各型所含菌株不同;存在5%甘油时,SSCP电泳分辨率明显增高。结论在15℃及5%甘油存在的条件下,针对ITSI区的PCR-SSCP分型是一种快速、简便的适合于致医院感染光滑假丝酵母菌分型的新流行病学研究手段。; 王菡于仁涛刘建玲纪蕾韩黎; 关键词：光滑假丝酵母菌 PCR-SSCP 流行病学研究真菌

2014年浙江省湖州市急性腹泻患者诺如病毒感染及基因特征研究被引量：6: 2016年; 目的了解2014年浙江省湖州市急性腹泻患者诺如病毒感染状况及基因特征,为加强感染性腹泻监测与综合防控工作提供依据。方法收集2014年湖州市综合性三级乙等和二级甲等各一家医院的粪便标本797份,采用实时荧光定量PCR方法进行诺如病毒核酸检测,并对诺如病毒核酸阳性标本进行衣壳蛋白区的序列测定和分析。结果 797份粪便标本中149份检出诺如病毒核酸阳性,阳性率18.70%(149/797),以GⅡ基因型为主,占89.26%(133/149)。衣壳蛋白区序列的系统进化分析显示检出的诺如病毒有5种GⅠ型别和7种GⅡ型别,包括GⅠ.1、GⅠ.2、GⅠ.5、GⅠ.6、GⅠ.7、GⅡ.2、GⅡ.3、GⅡ.4、GⅡ.6、GⅡ.8、GⅡ.17、GⅡ.21,以GⅡ.4 Sydney_2012(55.5%)、GⅡ.17(25.5%)型为主。结论诺如病毒在湖州市急性腹泻患者中存在较高感染,并且基因型别复杂,除了流行优势型别GⅡ.4外,2014年底还出现GⅡ.17型诺如病毒的流行,因此应加强诺如病毒腹泻监测工作,为今后疫情防控提供科学依据。; 沈月华纪蕾陈莉萍朱晓娟查赟峰徐德顺吴晓芳; 关键词：诺如病毒腹泻基因分型

2021年浙江省湖州市致泻性大肠埃希菌病原学特征分析被引量：1: 2023年; 目的研究2021年浙江省湖州市致泻性大肠埃希菌分离株的检出情况、主要毒力基因、耐药性以及分子分型特征。方法对2021年哨点医院腹泻患者粪便标本和市场采集的食品标本进行分离,运用多重荧光定量PCR方法检测其毒力基因,并对其中104株进行耐药性检测和脉冲场凝胶电泳分子分型。结果病例源中肠聚集性大肠埃希菌(EAEC)检出率最高为60.66%,食品源中也是EAEC检出率最高,为92.86%。DEC引起的发病人群以20岁~39岁年龄组最高,发病高峰在6月—8月。耐药率最高依次为氨苄西林(63.46%)、四环素(62.50%)、萘啶酸(57.69%)。经Xba I酶切后,对EAEC和ETEC进行分别聚类,EAEC相似度为41.7%~100.0%,ETEC相似度为40.7%~100.0%。结论2021年湖州市检出的致泻性大肠埃希菌以EAEC为主,对氨苄西林的耐药率最高。建立本地PFGE分子分型数据库,为DEC防控提供数据支撑。; 严伟纪蕾吴晓芳徐德顺; 关键词：致泻性大肠埃希菌病原学特征分子分型

实时荧光定量RT-PCR快速检测星状病毒方法的研究被引量：1: 2015年; 目的建立以特异性荧光探针为特点的Taq Man荧光定量RT-PCR检测星状病毒。方法根据星状病毒基因组保守序列设计引物和探针,建立并分析荧光定量RT-PCR的重复性、特异性、敏感性;以所建立方法对128例病毒性腹泻患者粪便标本进行检测,同时以基因测序进行验证。结果所建立的荧光定量RT-PCR检测方法对星状病毒具有很好的特异性和重复性,灵敏度达102copy/μl。128例粪便标本中星状病毒的检出率为3.1%,与基因测序比对结果相符。结论构建的星状病毒荧光定量RT-PCR方法具有快速、特异且灵敏的特点,可用于临床病原诊断和流行病学调查。; 徐德顺朱晓娟陈莉萍吴晓芳纪蕾沈月华; 关键词：星状病毒逆转录聚合酶链反应

2009-2012年浙江省湖州市甲3亚型流行株基因特性分析被引量：2: 2013年; 目的分析2009-2012年湖州市甲3亚型流感病毒主要抗原基因血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)的分子变异特征。方法选择浙江省湖州市2009-2012年流感流行期间分离的甲3亚型代表株11株,提取病毒RNA,扩增HA1和NA基因,进行序列测定,用MegAlign软件分析处理。结果湖州市近几年甲3亚型流感流行株在HA1区的核苷酸长度均为987 bp,编码329个氨基酸;在NA区的核苷酸长度为1362 bp,编码454个氨基酸。2009-2012年甲3亚型流感病毒分离株HA1区与NA区的氨基酸同源性分别在94.7%～99.9%与96.2%～100.0%之间,HA1区的变异较NA区更大。4个流感流行期分离的甲3亚型流感毒株相比HA和NA发生了多个氨基酸位点的替换。此外,近几年来世界卫生组织推荐的甲3亚型流感疫苗株与当年的流感流行株之间存在一定的差异。结论 2009-2012年湖州市甲3亚型流感病毒流行株发生明显变异,基因重配和抗原漂移是病毒发生变异的主要机制。; 徐德顺纪蕾陈莉萍吴晓芳; 关键词：血凝素神经氨酸酶甲3亚型基因特性

2016年-2017年湖州市手足口病病原监测结果分析被引量：6: 2019年; 目的了解2016年-2017年湖州市手足口病病原学特征和流行病学情况,为手足口病的预防和控制提供科学依据。方法s用荧光定量RT- PCR方法,对695例手足口病疑似病例样本进行肠道病毒(EV)、肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A16型( COX A16)、柯萨奇病毒A6型(COX A6)以及柯萨奇病毒A10型( COX A10)的核酸检测。结果695例标本中肠道病毒阳性率为74.39%。其中未分型肠道病毒阳性率为27.19%;CoxA16阳性率为22.73%;Cox A6阳性率为13. 81%;EV71阳性率为7. 63%;Cox A10阳性率为3.02%。不同性别男女阳性率分别为78.37%和69.21%,患者阳性率差异有统计学意义。手足口病全年均可发病,具有明显的季节性。结论2016 年一2017年湖州市手足口病的流行具有明显的双峰型,5岁以下幼儿是手足口病感染的主要人群。未分型肠道病毒和COX A16是引起儿童手足口病的主要病原,应加强手足口病病原谱变化特征的监测。; 吴晓芳徐德顺查赟峰纪蕾; 关键词：手足口病柯萨奇病毒A16型

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