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郑柯文

作品数:15 被引量:55H指数:4
供职机构:浙江大学化学系更多>>
发文基金:国家自然科学基金更多>>
相关领域:理学医药卫生石油与天然气工程化学工程更多>>

文献类型

  • 13篇期刊文章
  • 2篇学位论文

领域

  • 8篇理学
  • 5篇医药卫生
  • 4篇石油与天然气...
  • 1篇化学工程
  • 1篇农业科学

主题

  • 5篇疏水
  • 5篇静电
  • 4篇疏水作用
  • 3篇蛋白
  • 3篇量子化学
  • 3篇静电作用
  • 3篇分子
  • 2篇窄馏分
  • 2篇同源模建
  • 2篇噻吩
  • 2篇脱硫
  • 2篇量子化学研究
  • 2篇裂化
  • 2篇馏分
  • 2篇密度泛函
  • 2篇化学研究
  • 2篇冠状
  • 2篇冠状病毒
  • 2篇泛函
  • 2篇非典

机构

  • 9篇浙江大学
  • 6篇中国石油大学...

作者

  • 15篇郑柯文
  • 7篇俞庆森
  • 6篇高金森
  • 6篇徐春明
  • 4篇王艳花
  • 4篇马国正
  • 4篇张兵
  • 3篇邹建卫
  • 3篇曾敏
  • 2篇蒋勇军
  • 2篇胡桂香
  • 1篇谭非
  • 1篇郭明
  • 1篇赵文娜
  • 1篇刘海春

传媒

  • 4篇物理化学学报
  • 3篇化工学报
  • 2篇化学学报
  • 2篇石油大学学报...
  • 1篇高等学校化学...
  • 1篇计算机与应用...

年份

  • 3篇2005
  • 9篇2004
  • 2篇2003
  • 1篇1900
15 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
噻吩催化裂化脱硫机理的量子化学分析被引量:12
2004年
采用半经验AM1计算方法 ,利用静态理论对噻吩在分子筛催化剂上的催化裂化脱硫机理进行了量子化学计算研究 ,通过对噻吩分子和可能产生的中间正碳离子的量子化学计算 ,得到各中间反应所需的能量 ,从而判断噻吩催化裂化脱硫反应的趋势 ,证实了氢转移反应在催化裂化脱硫中所起的作用 .当噻吩处在催化裂化条件下 ,正碳离子反应活跃 ,易与烷烃裂化生成的α烯烃加成 ,进一步与烷烃发生氢转移饱和后裂化脱硫 .由于氢转移反应为放热反应 ,因而降低反应温度有利于噻吩催化裂化脱硫 .
郑柯文高金森徐春明
关键词:噻吩量子化学AM1氢转移
静电和疏水效应对SARS冠状病毒3CL蛋白酶二聚体稳定性的影响被引量:2
2005年
从 TGEV 3 CL蛋白酶二聚体结构出发 ,研究了 TGEV 3 CL蛋白酶二聚体单体之间的静电和疏水相互作用 .蛋白质的静电相互作用通过有限差分方法求解 Poisson-Boltzmann方程得到 ,疏水相互作用通过分析溶剂可及性表面模型得到 .考察了不同 p H值对 SARS3 CL蛋白酶二聚体静电和疏水相互作用的影响 ,在p H=5 .5~ 8.5时 ,二聚体静电相互作用能、静电去溶剂化能和疏水自由能都具有较小的数值 ,表明在该条件下静电和疏水相互作用有利于二聚体的稳定存在 .由于 SARS 3 CL蛋白酶活性模式为二聚体 ,因此 ,在该p H值范围内 ,有利于蛋白酶保持活性 .在 p H=7.0条件下 ,蛋白酶单体之间具有最强的静电和疏水相互作用 ,从而使蛋白酶具有最强的活性 ,这与实验结果相一致 .p H值对静电去溶剂化能的影响大于疏水自由能 ,表明静电作用是造成强酸或强碱条件下二聚体不能稳定存在的主要原因 .
郑柯文俞庆森蒋勇军马国正赵文娜曾敏
关键词:SARS静电作用疏水作用PH值
SARS冠状病毒主要蛋白酶二聚体静电和疏水效应的研究被引量:1
2004年
从三种冠状病毒主要蛋白酶SARS 3CL ,HCoV 3CL和TGEC 3CL蛋白酶结构出发 ,着重研究了三种蛋白酶二聚体单体之间的静电和疏水相互作用 .用连续介质模型有限差分方法计算得到三种蛋白二聚体界面处的静电势 ,发现三种蛋白酶单体和单体之间静电势分布具有明显的互补性 ,三种蛋白酶二聚体单体之间具有相同的静电相互作用能 .用溶剂可及表面积模型分析了分子表面积及疏水性 ,发现三种蛋白酶具有相同的疏水分布 ,其中SARS 3CL蛋白酶疏水率为 74% ,驱动其单体聚合成二聚体 .对三种蛋白酶的去溶剂化能疏水项的计算表明 ,三种蛋白酶二聚体单体之间具有相似的疏水相互作用能 .
郑柯文俞庆森王艳花张兵胡桂香
关键词:SARS冠状病毒蛋白酶二聚体静电相互作用疏水相互作用传染性非典型肺炎
用分子连接性指数法表征渣油
2003年
通过对多种渣油及其SCFE窄馏分平均分子的分子连接性指数与物理化学特性关系的研究发现 ,分子连接性指数可以较好地表征同一种渣油的SCFE窄馏分的物理化学特性 ,但对不同种渣油的SCFE窄馏分差异巨大 .加入H/C比对其进行修正 ,得到修正后的分子连接性指数KM 可以很好地预测不同渣油各种物理化学特性 ,实现分子连接性指数法渣油特征化 ,这也为分子连接性指数法在煤。
郑柯文高金森徐春明
SARS冠状病毒主蛋白酶和S蛋白的结构与功能研究及其抑制剂的设计
本文研究了SARS病毒基因组主要编码的蛋白质有RNA聚合酶蛋白(聚合酶1a,1b),S蛋白(spikeprotein),E蛋白(smallmembraneprotein),N蛋白(nucleocapsidprotein)...
郑柯文
关键词:非典型肺炎同源模建静电作用疏水作用
甲磺酸培氟沙星与人血清白蛋白之间结合模式的研究被引量:14
2005年
采用实验和计算的方法研究了甲磺酸培氟沙星与人血清白蛋白之间的结合作用.荧光法测得甲磺酸培氟沙星与人血清白蛋白形成一种类型的复合物,结合常数为1.7×105L·mol-1,有1.05个平均结合位点;微量热法测得该药物-蛋白结合过程中焓变为1.03kJ·mol-1,熵变为101.28J·K-1·mol-1,反应为熵驱动.用分子对接的方法预测了甲磺酸培氟沙星与人血清白蛋白的结合模式.计算表明,甲磺酸培氟沙星可结合在人血清白蛋白的两个药物结合位点,疏水作用即熵效应在药物与蛋白的结合中起重要作用,预测的结合自由能和实验值基本一致.
马国正谭非蒋勇军郑柯文郭明俞庆森
关键词:甲磺酸培氟沙星人血清白蛋白分子模建
基于5-芳基乙内酰脲类化合物的CoMFA和HQSAR研究被引量:3
2004年
用CoMFA和HQSAR两种QSAR方法研究了50个乙内酰脲类分子的定量构效关系.本研究从构象搜索所得的低能结构出发构建化合物分子的构象,建立CoMFA模型,并进行了全空间搜索.HQSAR本质上是一种二维的QSAR方法,与CoMFA方法相比,该方法在数据处理方面,比CoMFA方法快捷,并且可重复性好.两种方法均得到了较好分析结果,CoMFA的交叉验证相关系数q2值为0.815,HQSAR的q2值为0.893.这些方程有力地说明了该类分子在(R,R)-N-3,5-dinitrobenzoyl-1,2-diamine型手性固定相上拆分过程中的影响因素,对今后类似拆分的实验研究提供了理论支持.
张兵邹建卫郑柯文刘海春曾敏俞庆森
关键词:COMFA定量构效关系手性识别
利用HyperChem获取反应过渡态的方法被引量:3
2003年
利用HyperChem的动态数据交换DDE(Dynamic Data Exchange)功能,通过Excel中的Visual BasicA编程来控制Hy-perChem的运行,从而控制反应过程中的反应坐标和反应步长,计算得到反应系统沿反应坐标的能量变化曲线,从而可获取反应的过渡态和活化能△E。利用该计算方法搜寻了喹啉分子在S-Mo-Ni催化剂晶体表面催化加氢反应的过渡态,取得较好的效果。利用该方法可以确定复杂反应过渡态,从而为实验研究起理论指导作用。
郑柯文高金森徐春明
关键词:反应过渡态
吡咯喹啉醌模型化合物与氨亲核加成的理论探讨被引量:2
2004年
为了揭示辅酶PQQ结构与反应性的关系,在B3LYP/D95(d,p)水平上对一系列PQQ模型化合物及其类似物与氨的亲核加成进行了理论计算.结果表明:对单羰基体系,羰基碳的亲电性对反应能垒有重要的影响;对双羰基体系,过渡态中邻位羰基氧与亲核试剂氨上的H形成的氢键对反应的活化能起着关键的作用;稠合芳香环本身对反应的能垒影响不大,但当稠合杂环的1-位为可提供氢键受体的N原子时,由于N1与氨上H原子间可形成氢键而进一步降低反应的活化能.发现过渡态中被进攻羰基与氨上N原子之间形成的夹角(OCN)与活化能有良好的线性关系.
王艳花邹建卫胡桂香郑柯文俞庆森
关键词:吡咯喹啉醌模型化合物亲核加成密度泛函理论氢键催化剂
喹啉催化加氢机理的量子化学研究被引量:1
2004年
利用固定催化剂晶胞结构参数 ,用分子动力学方法全参数模拟优化了喹啉分子在具有不同硫原子缺陷的硫钼镍催化剂晶体表面的吸附过程 ,得到了反应物分子在催化剂晶体表面的最稳定吸附态 ,有效地判断了不同晶格催化剂对反应物吸附强弱及对反应物的活化程度。以氢、碳原子间距离为横坐标 ,其对应的能量值为纵坐标 ,建立了氢原子进攻喹啉分子的加氢坐标系及加氢反应模型 ,求出了反应活化能 ,从而判断不同催化剂晶体表面结构对催化剂活性的影响。结果表明 ,晶体上硫原子缺陷越多 ,反应物分子越易与活性中心镍原子相结合 ,越容易使反应物分子活化 ,反应所需的活化能就越小。
郑柯文高金森徐春明
关键词:喹啉量子化学活性分子动力学
共2页<12>
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