陈蓉
- 作品数:44 被引量:84H指数:6
- 供职机构:扬州大学动物科学与技术学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金江苏省自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- Piwill基因在鸡PGCs中的体外抑制研究
- 1引言Piwi基因自发现以来,一直被报道与动物的生殖系活动相关,大多数的Piwi基因研究集中在模式生物上,包括果蝇、小鼠、线虫、斑马鱼以及四膜虫等。在家禽中,有关Piwi基因及其结合小分子RNA的研究报道甚少。本试验对鸡...
- 常国斌陈蓉陈国宏
- 关键词:PGCSRNAI
- 文献传递
- 鸡pilRNAs分子的克隆及表达规律分析被引量:2
- 2012年
- 旨在为禽类piRNAs的遗传特性及发生和消失机理提供基础依据,也为禽类小分子RNA及其结合蛋白的深入研究和实际应用积累基础资料。本研究以鸡作为研究对象,通过构建小RNAs的cDNA文库和TA克隆测序的方法从睾丸组织中获得了19个大小为23~39nt的pilRNAs序列。根据pilRNAs的大小、同源序列和二级结构特征,选择了3个不同序列并采用Q-PCR技术分析了中国地方鸡种如皋鸡和引进隐性白鸡的不同生长阶段不同组织中pilRNAs时空表达规律。结果表明,编码鸡pilRNAs基因序列在染色体和基因组中的分布同其它物种一样分别具有不均匀性和基因间区偏爱性;二级结构预测,发现pilRNAs具有与miRNAs不同的独特的茎-环结构;鸡pilRNAs不仅大量存在于生殖组织,还大量存在于其他组织,表达规律因pilRNAs种类、品种、性别的变化而不同,gga-piR-1在2个品种的公、母鸡所有组织中的表达量均是相对最低,且到12周龄时均趋向一致的水平;而gga-piR-4表达量相对较高;gga-piR-5在如皋公鸡中所检测的全部组织中表达量最高,且在8周龄达到最高峰,在隐性白公鸡中的表达量相对较高,而在如皋母鸡、隐性白母鸡中均呈现中度表达水平。二级结构的独特特征从不同的角度阐明了pilRNAs和miRNAs 2种成熟小RNAs的剪切方式和加工机制的完全不同;鸡pilRNAs的多组织表达表明它可能不仅局限于生殖系的发育和维持,在其他组织中也扮演了重要的角色,不同种类的pilRNAs可能在生命发育过程中参与不同的调控功能。
- 张颖常国斌陈蓉戴爱琴栾德琴李建超马腾华登科陈国宏
- 关键词:睾丸Q-PCR克隆
- 鸡肌苷酸性状候选标记的筛选被引量:3
- 2013年
- 本研究旨在探讨鸡肌苷酸性状候选遗传标记以及在不同品种中的遗传效应。以国内外11个鸡群体和红色原鸡为实验材料,采用MALDI-TOF-MS方法对1号染色体上影响肌苷酸性状的候选基因(ADSL、GARSGART-AIRS)进行多态性检测和单倍型分析。结果表明:在2个基因中共发现4个SNP位点,12种主要单倍型,各种SNP位点及单倍型在世代群体中遗传稳定;其中,H4(TCGAT)、H11(CCGAC)单倍型可能是胸肌肌苷酸性状中优势和劣势单倍型。结果提示,ADSL、GARS-GART-AIRS可以作为鸡肌肉肌苷酸性状的候选标记,H4单倍型作为优势单倍型值得关注。
- 姜庆林常国斌李芹陈蓉刘向萍窦套存马腾戴爱琴翟飞夏明秀陈国宏
- 关键词:染色体肌苷酸
- 鸡NLRC5基因克隆及生物信息学分析被引量:3
- 2013年
- 本实验克隆了狼山鸡NLRC5基因CDS及UTR序列,对NLRC5核酸序列以及氨基酸序列特征进行分析,为进一步研究NLRC5在天然免疫系统中的功能奠定基础。采用RT-PCR方法扩增NLRC5的CDS,并通过RACE法扩增3′UTR和5′UTR,拼接成全长转录本,提交至GenBank,获得登录号:JQ044414。结果表明:鸡NLRC5基因序列与哺乳动物同源性较低,转录本全长7047nt,5′UTR 308 bp、3′UTR 1137 bp。基因定位在11号染色体,共49个外显子,转录本可能存在可变剪切体;基因上游2 kb包含C-Rel,AP-1等天然免疫信号通路重要转录因子结合位点和启动子元件;以及1个944 bp的CpG岛;其氨基酸序列包含与哺乳动物相似的NACHT及LRRs结构域,在靠近N端处包含NLS和NES,不包括其他类型信号肽,其蛋白可在胞质与核之间穿梭。表明鸡NLRC5的表达可能受到表观遗传的调控,在天然免疫及适应性免疫中的作用与哺乳动物相似。
- 马腾常国斌陈蓉张颖戴爱琴徐琪陈福斌朱金金陈国宏
- 关键词:基因克隆RACE生物信息学狼山鸡
- 鸡肌内脂肪性状的多基因聚合效应分析被引量:5
- 2009年
- 以如皋鸡为试验材料,采用PCR-SSCP技术对影响鸡肌内脂肪性状的3个候选基因(H-FABP,A-FABP和Δ9-FAD)进行单核苷酸多态性和基因聚合效应分析。结果发现,在3个基因中分别检测到A2980G,A1763G和C197T的SNP突变及3种基因型。肌内脂肪最小二乘差异显著性检验表明,H-FABP和Δ9-FAD基因中BB型与A-FABP基因中AB型为优势基因型,显著高于其他两种类型(P<0.05);但聚合基因型(两基因和三基因)并未表现出其相应的优势,无明显遗传规律可循,可见简单的优势基因型聚合并不是最佳的聚合方案,应建立在单个候选标记遗传效应明确且一致的基础上,尤其是针对复杂的肉质性状如肌内脂肪等。
- 常国斌周琼雷黎立张学余王克华陈蓉栾德琴陈国宏
- 关键词:单核苷酸多态性肌内脂肪
- 新型小分子RNA-piRNAs的研究进展被引量:2
- 2008年
- 由非编码小分子RNA(siRNAs,miRNAs)诱导的RNA干涉作为基因功能研究、基因治疗等新工具,目前已成为分子生物学的研究热点。最近,一种新型小分子RNA-piRNAs在老鼠的生殖细胞中被发现,特异性地与Miwi蛋白结合,被认为是精子发育及合子形成过程中必不可少的。本文就piRNAs的发现、遗传特性和可能的作用模式作一综述,并阐述了研究意义和应用前景。
- 常国斌常洪陈国宏刘向萍陈蓉秦玉蓉
- 关键词:小分子RNARNA干涉
- 鸡piRNAs分子的克隆及表达规律分析
- 本研究首次以鸡作为研究对象,通过构建小RNAs的cDNA文库和TA克隆测序的方法从睾丸组织中获得了23个piRNAs序列,同时采用Q-PCR技术分析了中国地方鸡种如皋鸡的不同生命阶段不同组织中piRNAs时空表达规律。结...
- 张颖常国斌陈蓉戴爱琴
- 关键词:睾丸Q-PCR克隆
- 文献传递
- 细菌内毒素对鸡NLRC5受体及IFN基因转录的影响被引量:9
- 2011年
- 本研究旨在探讨鸡NLRC5受体及IFN基因对不同细菌内毒素的诱导表达变化,为禽类NLRC5受体的分子功能及其参与先天免疫调控的作用机制提供理论依据。用不同浓度的(0、0.1、1.0、10.0μg.mL-1)来自致病性大肠杆菌(E.coli,EC)和肠炎沙门氏菌(S.enteriditis,SE)的2种内毒素(LPS)分别刺激鸡天然巨噬细胞系(HD11)2、4和6h,在不同的时间点收集细胞,提取总RNA,并设计相关引物,利用荧光定量PCR分析鸡NLRC5受体以及下游功能基因IFNA和IFNB的转录量变化,探讨HD11细胞对不同来源的细菌内毒素的免疫反应。研究表明:与对照组相比,1.0和10.0μg.mL-1的EC-LPS、SE-LPS均能诱导HD11细胞产生免疫应答,但0.1μg.mL-1组未能诱导成功;不同细菌LPS诱导的免疫应答时间不一致,经EC-LPS诱导的NLRC5和IFNB基因均在刺激后6h达到转录高峰,与2、4h差异显著(P<0.05),与对照组差异极显著(P<0.01);但IFNA基因在2、6h达到高峰,而在4h下降,呈"V"型转录趋势。SE-LPS诱导的NLRC5和IFNA、IFNB转录量随时间均保持一直上升的趋势,在6h达到高峰,且与对照组及2、4h差异显著(P<0.05)。结果表明NLRC5受体与IFNA和IFNB共同参与了细胞对细菌内毒素的免疫应答,NLRC5基因可能对鸡先天免疫功能具有调节作用。
- 常国斌陈蓉栾德琴张颖刘向萍马腾戴爱琴周伟陈国宏
- 关键词:IFN先天免疫
- 鹌鹑Piwi基因的克隆及鉴定
- 鉴于Piwi蛋白在哺乳动物生殖细胞中的重要作用,本研究选择体型小、繁殖周期短的鹌鹑为研究对象来开展禽类Piwi蛋白及其结合小RNA的初步研究,以期填补国内相关研究中的空白。本研究通过RT-PCR和RACE技术首次获得了鹌...
- 陈蓉常国斌张颖戴爱琴马腾徐琪陈国宏
- 关键词:鹌鹑PIWIPIRNA禽类
- 文献传递
- 鹌鹑血液中小分子RNA表达的初步研究被引量:6
- 2008年
- 利用改进的Trizol法首次从鹌鹑血液中提取小分子RNA,比较小分子RNA在组织与血液中的表达差异,为简化小分子RNA的提取程序,提高实验研究效率以及探讨小分子RNA的遗传特性提供可供借鉴的资料。结果发现:①改进Trizol法提取血液中的总RNA,效果显著,条带清晰;②发现血液中只存在一种小分子的miRNAs(18~22bp);③影响小分子RNA提取效率的关键因素包括样本的新鲜程度和RNA酶的污染。研究结果表明,通过改进的Trizol法提取血液中小RNA方法是可行的,小分子RNA在家禽血液中的表达具有特异性,snoRNAs,piRNAs在血液中不表达。
- 秦玉蓉陈蓉吴海常洪陈国宏吴信生常国斌
- 关键词:鹌鹑血液小分子RNA