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马占山

作品数：28 被引量：33H指数：2
供职机构：中国科学院昆明动物研究所更多>>
发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域：医药卫生生物学文化科学更多>>

合作作者

文献类型

  • 25篇专利
  • 3篇期刊文章

领域

  • 6篇医药卫生
  • 3篇生物学
  • 1篇文化科学

主题

  • 13篇微生物
  • 7篇生物生态
  • 7篇生物信息
  • 7篇微生物群落
  • 7篇微生物生态
  • 7篇基因
  • 6篇群落
  • 6篇健康
  • 6篇标度
  • 5篇多样性
  • 5篇物种
  • 4篇人体健康状况
  • 4篇生物信息技术
  • 4篇网络
  • 4篇微生物群落结...
  • 4篇疾病
  • 3篇阴道
  • 3篇生物菌
  • 3篇生物菌群
  • 3篇生物信息学

机构

  • 28篇中国科学院
  • 1篇安徽大学
  • 1篇遵义医学院
  • 1篇红河学院

作者

  • 28篇马占山
  • 6篇李连伟
  • 2篇樊萌萌
  • 2篇关琼
  • 2篇张亚平
  • 2篇叶丹丹
  • 1篇吴明松
  • 1篇陈红菊
  • 1篇曹毅
  • 1篇彭旻晟

传媒

  • 1篇科学通报
  • 1篇Zoolog...
  • 1篇中国生物化学...

年份

  • 1篇2022
  • 9篇2021
  • 1篇2020
  • 6篇2019
  • 6篇2018
  • 3篇2015
  • 1篇2014
  • 1篇2012
共 28 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
综合应用第三代超长测序读段和第二代链接式读段从头组装基因组的方法
本发明公开了一种综合应用第三代超长测序读段(Ultra‑long reads)和第二代链接式读段(Linked‑reads)高效率、高质量从头组装(de Novo)基因组的方法。其中第三代超长测序读段是指通过目前应用最为...
马占山张亚平李连伟彭旻晟
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一种度量个体水平遗传及突变多样性、相似性的概念和方法
本发明公开了一种在个体水平定义和度量遗传及突变多样性和相似性的概念和方法。而现有遗传多样性定义度量均在群体水平。其中个体水平是指两个(或以上)基因的集合：如个体全基因组、染色体(或片段)、基因集合等。个体水平基因集合是指...
马占山张亚平李连伟
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基于微生物功能团挖掘方法所获得的FBA口腔菌群功能团
本发明涉及生物信息技术及医疗健康领域，公开了基于网络分析技术挖掘群落“功能团”(Functional Guild)的概念、思路和方法，及其从健康人体口腔菌群中找到的FBA功能团。该功能团主要由厚壁菌门(Firmicute...
马占山李文迪
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一种评估微生物群落宏基因（或普通生物群落宏遗传）多样性和相似性的概念和方法
本发明公开了一种评估微生物群落宏基因（或普通生物群落宏遗传）多样性和相似性的概念和方法，包括用Hill numbers度量单基因水平(Metagenomic Gene：MG)和功能基因群(Metagenomic Func...
马占山李连伟
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一种检测乳腺或乳汁样本菌群组成来评估乳腺健康状况和母乳质量的方法及其应用
本发明公开了一种检测乳腺或乳汁样本菌群组成来评估乳腺健康状况和母乳质量的方法及其应用，其特征在于检测乳腺组织或乳汁样本菌群中葡萄球菌属和棒状杆菌属的含量，以及它们在菌群中所占的比例。基于该方法所得的检测结果可用于预测评估...
马占山李文迪
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炎性肠病特异性肠道微生物检测靶标及其应用
本发明涉及生物信息技术及医疗健康领域，公开了一类炎性肠病(IBD)特异性微生物检测靶标及其应用，其特征在于这类靶标涉及Clostridium tertium，Odoribacter splanchnicus，Rumino...
马占山李文迪
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一种应用β-稳定性分析单细胞测序数据的方法
本发明涉及测序数据的生物信息学分析方法，特别是涉及一种应用β‑稳定性分析单细胞测序数据的方法。本发明的目的在于应用β‑稳定性的方法，针对单细胞测序数据，分析单个细胞之间基因表达量在时间和空间尺度上的稳定性和变异性。以胚胎...
马占山李连伟
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一种基于多样性指数和区域范围关系的幂法则标度模型预测微生物群落结构的方法
本发明公开了一种预测和评估微生物群落结构的方法，具体指基于物种多样性指数与区域范围关系的幂法则标度模型来预测区域内微生物群落多样性分布的方法。本发明对采样位点进行随机抽样排序和累积，获取累积采样位点下的累积物种多样性，并...
马占山李文迪
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一种基于Hill numbers与时间关系的幂法则模型预测微生物群落结构的方法
本发明公开了一种定量监测微生物群落结构变化趋势的方法，具体指基于微生物群落多样性Hill numbers指数与时间关系的幂法则标度模型来监测或预测群落多样性随时间变化的方法。根据被测区域内微生物群落多样性(Hill nu...
马占山李文迪
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用于组装基因组序列的方法、系统及装置
本申请提供一种利用锚点序列对待组装序列进行压缩并进行基因序列组装的方法，包括获取一待组装序列集的数据和多个锚点序列的数据；利用所述多个锚点序列，对所述待组装序列集中的每一个待组装序列进行压缩以获得该待组装序列的索引表，其...
叶承羲马占山
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