代鹏
- 作品数：10 被引量：46H指数：3
- 供职机构：第四军医大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划“重大新药创制”科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学更多>>
- PLCE1基因多态性在胃癌发生过程作用的探讨
- 酶CE1(phospholipase C epsilon-1,PLCE1)是新发现的磷脂酶家族C新成员,其分子结构和功能较为复杂,在细胞信号转导过程中可能起重要作用.PLCE1的激活可引起一系列的生化反应,最终调节细胞的...
- 代鹏梁平张文涛王伟华颜真
- 关键词：胃癌基因表达
- 文献传递
- PLCE1基因及rs2274223和rs3765524单体型的克隆与表达
- 目的：克隆人PLCE1基因，构建PLCE1 rs2274223和rs3765524 GT(PLCE1 Minor)和AC(PLCE1 Major)单体型真核表达重组载体，研究PLCE1基因多态性及单体型与基因表达的相关性...
- 李达代鹏王伟张文涛汪钦束毅祝春来纪奇峰颜真
- 关键词：单核苷酸多态性重叠延伸PCR基因克隆基因表达
- 文献传递
- 应用Logistic回归与多因子降维法分析胃癌易感基因多态性被引量：3
- 2014年
- 目的应用Logistic回归与多因子降维法(multifactor dimensionality reduction,MDR)分析胃癌易感基因多态性,为胃癌的早期诊断和预警奠定基础。方法采用病例-对照研究,以中国西北476例汉族胃癌患者为病例组,361名非肿瘤、非消化系统疾病个体为对照组;通过候选基因策略,应用MassARRAY质谱平台分析与代谢、炎症相关的18个基因的37个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点;利用Logistic回归与MDR对基因分型结果进行分析。结果 Logistic回归分析显示,磷脂酶Cε1(phospholipase C epsilon 1,PLCE1)_rs3765524[OR=1.341,95%CI(1.003,1.792)]、还原型辅酶Ⅰ/Ⅱ醌氧化还原酶1[NAD(P)H:quinone oxidoreductase 1,NQO1]_rs1800566[OR=0.615,95%CI(0.418,0.903)]、X线修复交叉互补基因1(X ray repair cross complementing gene 1,XRCC1)_rs25487[OR=0.688,95%CI(0.490,0.967)]3个SNP位点的基因型分布与胃癌易感性显著相关(P<0.05);MDR分析显示,PSCA_rs10216533-XRCC1_rs25487[模型Ⅰ:OR=3.566,95%CI(2.614,4.863)]、MTHFR_rs1801131-PSCA_rs2976392-CYP17A1_rs6163-CYP19A1_rs4646-CYP19A1_rs1902586-MMP2_rs243865[模型Ⅱ:OR=7.257,95%CI(5.337,9.870)]、IL1B_rs16944-PSCA_rs10216533-CYP17A1_rs6163-NQO1_rs1800566-ENOSF1_rs2298581-XRCC1_rs25487[模型Ⅲ:OR=15.837,95%CI(11.252,22.289)]3个模型内部各位点之间具有显著交互作用(P<0.000 1)。结论 PLCE1、NQO1、XRCC1、PSCA、MTHFR、CYP17A1、CYP19A1、MMP2、IL1B、ENOSF1等基因多态性与我国西北地区汉族人群胃癌发病风险相关;在胃癌的早期诊断与预警中应联合Logistic回归和MDR等方法,兼顾单因素与多因素交互的影响进行综合分析。
- 张文涛梁平代鹏王伟华汪钦孙建斌王伟颜真
- 关键词：胃癌单核苷酸多态性LOGISTIC回归多因子降维法
- PLCE1基因及rs2274223和rs3765524单体型的克隆与表达
- 2016年
- 目的：克隆人PLCE1基因,构建PLCE1 rs2274223和rs3765524 GT（PLCE1 Minor）和AC（PLCE1 Major）单体型真核表达重组载体,研究PLCE1基因多态性及单体型与基因表达的相关性。方法：利用重叠延伸PCR、In-Fusion技术构建PLCE1真核表达载体;基于同源重组的双点突变技术改造目的基因;利用基因转染、实时定量PCR和蛋白印迹等技术实现PLCE1表达载体在真核细胞中的过表达及表达水平的鉴定。结果：成功扩增并获得了全长6 927bp的人PLCE1 cDNA并经过DNA测序证实,与NCBI数据库PLCE1参考序列（NM_016341）比较,发现编码区3 554～3 572bp处存在18bp连续碱基插入,其余序列基本匹配。成功构建了PLCE1 Minor和PLCE1 Major两种单体型重组真核表达载体,转染细胞揭示PLCE1 Minor型的mRNA转录和蛋白质表达水平均高于Major型。结论：发现了一种新的PLCE1 mRNA转录本,成功构建了2种单体型真核表达载体;发现PLCE1 rs2274223G-rs3765524T单体型能够促进自身mRNA和蛋白质表达,为进一步揭示PLCE1 SNPs与癌症易感性的关系奠定了基础。
- 李达代鹏王伟张文涛汪钦束毅祝春来纪奇峰梁平颜真
- 关键词：单核苷酸多态性重叠延伸PCR基因克隆基因表达
- 氧化应激诱导Alu RNA及其信号通路在急性肺损伤肺泡上皮细胞中的表达和功能
- 目的：肺损伤发展迅速,致死率高,至今尚缺乏有效的治疗药物和方法。氧化应激是导致急性肺损的重要病因,且可能引发严重的慢性肺疾病。方法：本研究使用不同浓度双氧水作用于A549细胞制备肺上皮细胞氧化应激模型,通过免疫沉淀,qR...
- 王伟华代鹏海璐明颜真
- 关键词：ALURNA双链RNA急性肺损伤信号通路
- 文献传递
- 重组dsRNA依赖的RLR受体介导的程序性坏死能有效激活广谱抗病毒免疫应答
- 病毒感染会导致宿主细胞内dsRNA大量产生.在哺乳动物细胞中,这些dsRNA会被一套特异的dsRNA受体识别成危险信号,其中主要的胞内受体是RLR家族受体.本研究中,提出了一种新的抗病毒策略,即通过识别dsRNA、并以类...
- 王伟王伟华汪钦张文涛代鹏孙建斌杨静华颜真
- 关键词：病毒感染程序性坏死
- 肝癌患者体内乙型肝炎病毒基因组BCP/Pre C区基因突变多样性分析被引量：5
- 2017年
- 为研究肝癌患者组织样本中HBV DNA核心启动子区(BCP区)和前C区(Pre C区)的基因突变多样性及其突变规律。收集第四军医大学附属西京医院2015年收治的192例HBV阳性的肝癌患者组织样本,PCR扩增HBV BCP/Pre C区DNA片段并进行测序分析,从测序失败的样本中随机抽取21例,采用构建单克隆文库后测序的方法进行分析。结果显示37.89%(72/190)的HBV阳性肝癌患者体内HBV病毒因呈现多种突变株混合感染的特点而导致PCR产物直接测序失败,经单克隆测序揭示,每一例失败样本的HBV DNA准种池中至少有2~11种突变株共同存在;突变株中缺失突变和插入突变的发生率高达80.95%;其它突变形式按照频率从高到低分别为A1762T/G1764A双突变90.48%,G1756C/T1803A/Δ(1 757~1 765)/Δ(1 824~1 832)四联突变80.95%,T1753C/A1762T/G1764A三联突变57.14%,A1762T/G1764A/G1896A三联突变42.86%,G1756C/Δ(1 757~1 765)双突变28.57%,T1753C/A1762T/G1764A/G1896A四联突变23.81%。由此可见,肝癌患者体内HBV病毒具有BCP/Pre C区DNA突变的多样性,这些缺失与插入突变是导致序列移码与PCR产物测序失败的直接原因。研究结果为HBV持续感染及基因突变检测、相关机制研究和个体化防治奠定了基础。
- 束毅王伟代鹏张文涛成珊李达纪奇峰邱荣鹤刘浩林赵文亮颜真
- 关键词：乙型肝炎病毒基因突变肝癌
- 蛋白质翻译后修饰研究进展被引量：38
- 2014年
- 蛋白质是执行细胞功能的基本功能单元,其表达受基因组和表观遗传学的调控。通常,蛋白质在表达以后还需要经过不同程度的修饰才能发挥所需要的功能。这种翻译后修饰过程受到一系列修饰酶和去修饰酶的严格调控,使得在某一瞬间细胞中蛋白质表现出某种稳定或动态的特定功能。最新的研究表明,真核细胞中存在着各种各样的蛋白质修饰过程,其中大约70%目前还无法解释。有理由认为,这种经过了特定修饰的蛋白质,更客观地反映了细胞的各种生理以及病理过程。因此,除了基因组所编码的"裸"蛋白质组的表达以外,更需要对经过翻译后修饰的蛋白质及蛋白质组的调控过程进行深入的研究。该文对常见翻译后修饰以及研究方法进行了综述。
- 阮班军代鹏王伟孙建斌张文涛颜真杨静华
- 关键词：蛋白质组蛋白质翻译后修饰基因组分子鉴定
- GSI对机械性损伤的神经元保护作用
- 2016年
- 目的探讨γ-分泌酶抑制剂(GSI)对神经元机械性损伤的保护作用。方法原代培养小鼠皮层神经元,培养基中加入10μmol/L GSI共同孵育24 h后,使用微量移液器枪头做机械性划伤。测定培养液中乳酸脱氢酶(LDH)活力的变化;Hochest染色测定神经元凋亡情况;Western blot方法检测切冬酶-3(caspase-3)蛋白表达情况。结果 GSI预处理可抑制因细胞损伤引起的LDH的释放,可降低损伤后Hochest阳性细胞的数量以及活化caspase-3的表达。结论 GSI对神经元机械性损伤有保护作用。
- 刘剑张磊王凯惠浩代鹏海璐明饶维费舟
- 关键词：神经元凋亡
- PLCE1基因及rs2274223和rs3765524单体型的克隆与表达
- 目的:克隆人PLCE1基因,构建PLCE1 rs2274223和rs3765524 GT(PLCE1Minor)和AC(PLCE1 Major)单体型真核表达重组载体,研究PLCE1基因多态性及单体型与基因表达的相关性。...
- 李达代鹏王伟张文涛汪钦束毅祝春来纪奇峰颜真
- 关键词：单核苷酸多态性重叠延伸PCR基因克隆基因表达
