吕瑞辰
- 作品数：4 被引量：6H指数：2
- 供职机构：军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金河北省科技计划项目国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 大肠杆菌hfq和rne-710基因的双质粒无痕敲除技术被引量：1
- 2018年
- 基因敲除技术是了解基因功能的重要技术手段。以大肠杆菌K-12 MG1655基因组hfq(309 bp)和rne-710(1056 bp)基因为模型,首先构建Δhfq∷Spe和Δrne-710∷Spe菌株,通过融合PCR方法分别构建缺失hfq(309 bp)和rne-710(1056 bp)的融合片段并连接至辅助质粒,缺失hfq和rne-710的片段经重组分别替换壮观霉素抗性盒,得到无痕敲除株Δhfq和Δrne-710。双质粒无痕敲除和融合PCR方法相结合为大片段基因缺失开辟了新的途径。
- 王净吕瑞辰韩延平杨瑞馥
- 关键词：大肠杆菌HFQ融合PCR
- 携带bla_(NDM-1)的质粒pNDM-BJ01在鲁氏不动杆菌中的适应度代价被引量：2
- 2013年
- 【目的】了解编码新德里金属-β-内酰胺酶-1(blaNDM-1)的质粒pNDM-BJ01在鲁氏不动杆菌10621菌株中的适应度代价,进而评估该质粒在鲁氏不动杆菌群体中存续和扩散的潜能。【方法】通过不含亚胺培南的液体培养基连续传代培养,获得抗性质粒丢失的10621衍生菌株,利用生长曲线、生物被膜、无营养生存时间等体外适应度测量实验,分析10621NDM-1(+)及质粒缺失的10621NDM-1(-)之间的适应度差异。【结果】pNDM-BJ01在10621菌株中不稳定,连续传代11次即在群体中完全丢失。在26℃和37℃下,10621NDM-1(-)与10621NDM-1(+)菌株的生长曲线无显著性差异。在26℃条件下,10621NDM-1(-)菌株形成生物被膜的能力明显强于10621NDM-1(+),而在37℃条件下,10621NDM-1(+)强于10621NDM-1(-)。在无营养的PBS缓冲液中,10621NDM-1(-)菌株生存能力明显高于10621NDM-1(+)。【结论】编码blaNDM-1的质粒pNDM-BJ01在鲁氏不动杆菌中具有较大的适应度代价,缺失这一质粒的菌株在外界环境中的生存能力强于抗性菌株,pNDM-BJ01在鲁氏不动杆菌存续与扩散的能力有限。
- 徐丽吕瑞辰王海燕胡红焱赵向娜杨瑞馥赵建宏宋亚军
- 关键词：生物被膜
- 鼠疫耶尔森菌基因组无痕修饰方法的建立被引量：3
- 2017年
- 目的构建鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)中基因组无痕修饰的技术平台,深入研究鼠疫菌相关基因的功能及作用机制。方法通过不对称PCR扩增抗性盒片段(含修饰靶标区域上下游同源臂),将其导入含pKD46质粒的鼠疫菌中。在阿拉伯糖的诱导下,pKD46质粒可表达与同源重组相关的3个酶(Exo,Beta和Gam蛋白),诱导重组后再导入p KSI-1质粒与目的基因的重组载体,与抗性盒进行第二次同源重组。通过加入阿拉伯糖和IPTG诱导pREDTKI表达重组酶和I-SceⅠ酶,可对未发生重组的抗性盒片段和p KSI-1质粒上的I-SceⅠ位点酶切,从而起到消除抗性盒与质粒作用,达到无痕修饰的目的。结果与结论成功构建了鼠疫菌的Δwaa A和waa A(△9nt)两个突变株。根据不同的实验目的选择相应的基因敲除方法,得到的无痕修饰菌株为鼠疫菌相关基因的功能研究奠定了基础。
- 肖丽生祁芝珍吕瑞辰宋凯陈荣王敏吴海莲赵海红宋亚军
- 关键词：鼠疫菌同源重组
- 耐环丙沙星鲍氏不动杆菌中喹诺酮耐药相关基因分析
- 2014年
- 目的研究鲍氏不动杆菌(ABA)临床分离株对喹诺酮类抗生素耐药机制。方法收集来自6家医院的114株耐环丙沙星ABA临床分离菌株,PCR扩增喹诺酮类抗生素结合靶基因(gyrA、gyrB、parC和parE),并进行序列测定,与参考菌株ATCC17978基因组进行比对,确定其喹诺酮耐药决定区是否存在耐药相关突变;PCR扩增9个质粒介导的喹诺酮类耐药基因[qnrA、qnrB、qnrC、qnrD、qnrS、qepA、aac(6')-Ⅰb-cr、oqxA和oqxB],并对阳性扩增产物进行测序以确定基因亚型。结果绝大部分菌株(113/114,99.1%)的gyrA基因发生了Ser83Leu突变,其中67株菌(67/114,58.8%)同时发生了parC基因的Ser80Leu突变,以上两种突变是常见的喹诺酮耐药相关突变。与标准菌株进行比对,受试菌株gyrB基因Arg393Ser、Arg393Cys、Thr401Ala、Pro406Ser、Val430Phe、Cys440Ser和Gly480Arg突变率分别为95.6%、0.9%、96.5%、96.5%、100%、96.5%和96.5%;parE基因在7个位点发生了同义突变,突变率>96%。83.3%(95/114)的菌株中检出aac(6')-Ⅰb基因,但不存在"cr"突变,其余质粒介导的喹诺酮类耐药基因扩增均为阴性。结论该研究耐环丙沙星ABA中未发现质粒介导的喹诺酮耐药基因,在gyrB和parE基因中发现的突变可能与环丙沙星耐药性无关,实验菌株的环丙沙星耐药性主要与染色体上的喹诺酮耐药决定区GyrASer83Leu和ParC-Ser80Leu两种突变相关。
- 周振江罗燕萍郭景玉吕瑞辰李艳君杨瑞馥黄新祥宋亚军
- 关键词：环丙沙星鲍氏不动杆菌
