宋广超 作品数:11 被引量:43 H指数:5 供职机构: 石河子大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家重点基础研究发展计划 国家绒毛用羊产业技术体系建设专项 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 更多>>
FABP4基因在阿勒泰羊尾脂沉积与代谢模型中的表达变化规律 被引量:16 2015年 FABP4(Fatty acid binding protein 4)参与细胞内脂肪酸的转运和脂肪酸代谢,是当前研究动物脂肪沉积与代谢的热门候选基因。为了研究FABP4基因在绵羊尾脂沉积与代谢中的作用,文章采用生物信息学方法分析了FABP4氨基酸序列在各物种中的保守性;利用半定量RT-PCR方法检测了该基因在阿勒泰羊主要组织中的表达;采用饥饿法成功建立了模拟阿勒泰羊尾脂沉积与代谢的动物模型,利用q PCR和i TRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技术同时验证FABP4基因m RNA和蛋白在阿勒泰羊非饥饿组与饥饿组尾脂中的表达变化。序列分析结果表明,绵羊FABP4氨基酸序列在物种间高度保守,提示FABP4基因可能由于其重要的生物功能而在进化中表现出其物种的保守性。组织表达谱结果显示,FABP4 m RNA在阿勒泰羊肠脂与尾脂中均高丰度表达,暗示FABP4基因可能在脂肪中行驶着重要的生理生化功能。q PCR与i TRAQ结果显示,FABP4 m RNA与蛋白在两种极端条件下尾脂中的表达差异均不显著(P>0.05),表明FABP4基因可能不是绵羊尾脂沉积与代谢两种极端差异表型的决定基因。以上研究结果为进一步研究FABP4基因在绵羊尾脂中的生物功能奠定了基础。 许瑞霞 高磊 赵伟利 张伟 张伟 宋广超 甘尚权关键词:阿勒泰羊 一种可鉴定绵羊产肉能力的分子标记及其应用 本发明公开了一种可鉴定绵羊产肉能力的分子标记及其应用。本发明的分子标记可用来预测或辅助预测具有不同产肉能力的绵羊,具体方法如下:以待测绵羊的基因组DNA为模板,采用由与SEQ ID No.1的第377位上游特异结合的单链... 高蕊 甘尚权 张伟 王世银 张云峰 孟季蒙 唐红 何延华 杨德松 徐春生 宋广超文献传递 一种基于聚丙烯酰胺凝胶电泳检测低效率基因组编辑的方法及其应用 本发明公开了一种基于聚丙烯酰胺凝胶电泳检测低效率基因组编辑的方法及其应用。该方法包括如下步骤:1)将野生型DNA用人工核酸内切酶编辑,得到由突变DNA和未突变野生型DNA组成的待测基因编辑后DNA;2)将待测基因编辑后D... 高蕊 张伟 王世银 甘尚权 周平 王立民 陈永林 皮文辉 黄瑾 李冬妹 宋广超文献传递 不同繁殖状态阿勒泰羊下丘脑MTNR1A基因表达变化与其季节性繁殖的关系 被引量:5 2015年 【目的】分析不同繁殖状态阿勒泰羊下丘脑褪黑素受体1A(MTNR1A)基因表达情况与其季节性繁殖之间的关系,为深入研究绵羊季节性繁殖的调控机理奠定基础。【方法】采用RT-PCR对发情盛期阿勒泰羊不同组织中的MTNR1A基因表达情况进行检测,并以q RT-PCR测定分析乏情期及发情初期、发情盛期、发情末期和间情期阿勒泰羊下丘脑MTNR1A基因的表达变化情况。【结果】MTNR1A基因在发情盛期阿勒泰羊的下丘脑、垂体、卵巢和脾脏中高表达,而在心肌、肺脏和骨骼肌中不表达或表达量极低。秋季发情季节阿勒泰羊下丘脑中MTNR1A基因的表达量极显著高于夏季乏情季节(P<0.01),但在发情前期、发情盛期、发情末期和间情期的表达量差异不显著(P>0.05);夏至后20 d下丘脑中MTNR1A基因的表达量显著高于夏至前20 d(P<0.05)。【结论】褪黑素及其受体在阿勒泰羊发情启动过程中发挥重要的调控作用。 王世银 石国庆 甘尚权 宋广超 张伟 张伟关键词:阿勒泰羊 下丘脑 季节性繁殖 MTNR1A基因多态性与绵羊季节性繁殖的相关性分析 被引量:8 2015年 为研究MTNR1A基因多态性与绵羊季节性繁殖的关系,以季节性发情的阿勒泰羊和常年发情的湖羊为研究对象,分别随机选择2品种羊的基因组各50份混合构建DNA池,并以此为模板扩增绵羊MTNR1A基因5′侧翼序列、ExonⅠ及ExonⅡ,通过测序检测MTNR1A基因在阿勒泰羊和湖羊群体的突变。在对突变进行分析的基础上,于5′侧翼序列选择2处转录因子结合的突变位点,利用PCR-SSCP技术检测其在200只阿勒泰羊和210只湖羊中的多态性分布,并分析其与绵羊季节性繁殖性状的关联性。结果表明,MTNR1A基因5′侧翼序列、ExonⅠ及ExonⅡ在阿勒泰羊和湖羊群体中分别检测到18、1和9处突变,TF Search和Signal Scan分析显示,5′侧翼序列的18处突变中有4处分别处于转录因子TBP、GR、SP1和c-Myb的结合位点处,预测评分分别为98.5、95.2、97.6和94.9。ExonⅠ及ExonⅡ中检测到的10处突变中,有4处突变为错义突变,6处突变为同义突变,但均不在MTNR1A的跨膜区。PCR-SSCP检测结果显示,g.15143697位点的T/C突变在湖羊群体中以CC基因型为主,其基因型频率达到0.919,而在阿勒泰羊中以TT基因型为主,基因型频率为0.950,阿勒泰羊群体中T等位基因的比例为湖羊群体的550倍,推测该位点可能与绵羊的季节性发情有关。 王世银 邓双义 杨力伟 甘尚权 宋广超 石国庆 张伟关键词:绵羊 季节性繁殖 SNP 一种基于聚丙烯酰胺凝胶电泳检测低效率基因组编辑的方法及其应用 本发明公开了一种基于聚丙烯酰胺凝胶电泳检测低效率基因组编辑的方法及其应用。该方法包括如下步骤:1)将野生型DNA用人工核酸内切酶编辑,得到由突变DNA和未突变野生型DNA组成的待测基因编辑后DNA;2)将待测基因编辑后D... 高蕊 张伟 王世银 甘尚权 周平 王立民 陈永林 皮文辉 黄瑾 李冬妹 宋广超绵羊骨骼肌特异表达miRNA前体多态及其表达分析 提高绵羊的产肉性能在绵羊养殖业中具有重要的生产意义。据研究表明,miRNA在骨骼肌发育过程中起到重要的调控作用。而 miR-1,miR-133和 miR-206三种 miRNA在骨骼肌和心肌中特异表达,与肌肉发育息息相关... 宋广超关键词:绵羊 产肉性能 基因频率 骨骼肌 文献传递 绵羊7号染色体46843356位点多态性与尾脂沉积相关性研究 被引量:5 2014年 为探讨绵羊7号染色体上46843356位点多态性与绵羊尾脂沉积的关系,以尾型极端差异的阿勒泰羊、小尾寒羊、中国美利奴细毛羊以及萨福克羊为研究对象,利用PCR-RFLP检测该位点在群体中的多态性。结果表明:46843356位点在尾脂沉积能力较差的中国美利奴细毛羊和萨福克羊群体以AA基因型为主,而尾脂沉积能力强的阿勒泰羊群体则以GG和GA基因型为主,阿勒泰羊和小尾寒羊G/A等位基因频率比值为2.48和4.22,分别是萨福克羊的83倍和141倍。卡方检验结果表明,阿勒泰羊和小尾寒羊在该位点上处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),而中国美利奴细毛羊和萨福克羊在该位点上处于Hardy-Weinberg极度不平衡状态(P<0.01)。以上结果提示,绵羊7号染色体上46843356SNP位点在脂尾(臀)与瘦尾绵羊群体中存在较大差异,可作为理想的分子标记应用于高、低脂绵羊品种选育。 张伟 张伟 张伟 赵伟利 沈敏 赵伟利 许瑞霞 宋广超 刘守仁关键词:阿勒泰羊 多态性 基因型 一种可鉴定绵羊产肉能力的分子标记及其应用 本发明公开了一种可鉴定绵羊产肉能力的分子标记及其应用。本发明的分子标记可用来预测或辅助预测具有不同产肉能力的绵羊,具体方法如下:以待测绵羊的基因组DNA为模板,采用由与SEQ ID No.1的第377位上游特异结合的单链... 高蕊 甘尚权 张伟 王世银 张云峰 孟季蒙 唐红 何延华 杨德松 徐春生 宋广超文献传递 绵羊骨骼肌特异表达miR-133前体在不同绵羊群体中的多态检测 被引量:4 2015年 试验旨在研究骨骼肌中特异表达miR-133前体在不同绵羊群体中的多态,分析其与绵羊骨骼肌发育表型的相关性。采用PCR-SSCP技术对miR-133前体序列在特克赛尔羊、中国美利奴细毛羊、阿勒泰羊和湖羊四种不同产肉性能的绵羊群体进行了多态性检测,并分析多态性位点对miR-133前体序列二级结构、二级结构稳定性及加工、成熟的影响。结果表明,miR-133前体序列下游194bp(g.54047535)处检测到A>G突变,并且该SNP与绵羊的产肉性能存在明显的相关性,在特克赛尔羊中GG是优势基因型,G等位基因频率高达0.86,是中国美利奴细毛羊群体该位点频率的4倍。二级结构的生物信息学预测结果表明,该SNP位点致使miR-133前体的二级结构发生明显改变,自由能值降低3.2kJ/mol。以上结果提示,绵羊miR-133前体序列的SNP(g.54047535)位点可能对miR-133前体的加工成熟具有重要影响,并最终影响绵羊的产肉性能。 宋广超 张伟 张伟 许瑞霞 赵伟利 刘守仁关键词:骨骼肌 绵羊