尚玉奎
- 作品数：3 被引量：13H指数：2
- 供职机构：哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金黑龙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 基于功能一致性预测冠心病致病基因被引量：1
- 2009年
- 目的:为了解疾病致病机理和改进临床治疗,基于功能一致性挖掘潜在的疾病致病基因。方法:本文基于功能一致性基因的共定位特性,结合蛋白质互作网络拓扑结构,获取疾病候选基因集,并通过GO及KEGG功能富集分析方法进一步筛选,预测出新的致病基因。结果:挖掘得到的59个冠心病致病基因通过文献证实绝大部分基因与疾病的发生发展存在着联系。结论:本方法具有可行性,研究者能够在此基础上很好地进行疾病致病机理的研究。
- 孙立中张良才陈丽娜赵研尚玉奎王倩
- 关键词：蛋白质互作网络
- 基于功能一致性和网络拓扑属性预测冠心病致病基因被引量：8
- 2009年
- 基于功能一致性利用蛋白质互作网络挖掘潜在的疾病致病基因,对于了解疾病致病机理和改进临床治疗至关重要.基于基因功能一致性和其在蛋白质互作网络中的拓扑属性将基因与疾病之间建立关联,对疾病风险位点内的基因进行了致病风险预测,并通过GO及KEGG功能富集分析方法进一步筛选,预测出新的致病基因.预测出了51个新的冠心病致病基因,分析发现大部分基因参与了冠心病的致病过程.为疾病基因的挖掘提出一个新的思路,从而有助于复杂疾病致病机理的研究.
- 赵研陈丽娜张良才王倩尚玉奎王宏李琬
- 人类蛋白质结构互作网络--结构域对网络拓扑与蛋白质功能的影响被引量：6
- 2010年
- 高通量的蛋白质互作数据与结构域互作数据的出现,使得在蛋白质组学领域内研究人类蛋白质结构互作网络,进一步揭示蛋白质结构与功能间的潜在关系成为可能.蛋白质上广泛分布的结构域被认为是蛋白质结构、功能以及进化的基本功能单元.然而,结合蛋白质的结构信息(例如蛋白质结构域数目、长度和覆盖率等)来研究这些表象后的内部机制仍然面临着挑战.将蛋白质分为单结构域蛋白质与多结构域蛋白质,并进一步结合蛋白质互作信息与结构域互作信息构建了人类蛋白质结构互作网络;通过与人类蛋白质互作网络进行比较,研究了人类蛋白质结构互作网络的特殊结构特征;对于单结构域蛋白质与多结构域蛋白质,分别进行了功能富集分析、功能离散度分析以及功能一致性分析等.结果发现,将结构域互作信息综合考虑进来后,人类蛋白质结构互作网络可以提供更多的单纯的蛋白质互作网络无法提供的细节信息,揭示蛋白质互作网络的复杂性.
- 陈丽娜王倩尚玉奎张良才孙钊何伟明赵研李琬王宏何月涵李霞
- 关键词：结构域蛋白质功能
