张学礼
- 作品数：6 被引量：108H指数：4
- 供职机构：上海交通大学生命科学技术学院微生物分子生态学与基因组学实验室更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：环境科学与工程石油与天然气工程更多>>
- 原废水培养基分离活性污泥中的苯酚降解细菌被引量：29
- 2003年
- 用未经处理的含酚焦化工业废水为基础配制培养基,采用平板涂布法,在10^(-5)稀释度下得到100个单菌落分离物.它们均能在以苯酚(500～800 mg L-1)为唯一碳源的无机盐培养基上生长,其16S rDNA基因的ARDRA多态性分析将这些分离物划分成4个分类操作单元(OTUs).各单元代表株的16S rRNA基因序列分析和检索结果表明,97个分离物与Alcaligenes faecalis同源性达99％,2个分离物分别与Arthrobacter nicotianae和Klebsiella sp.99％同源,另一个分离物与Ochrobactrum sp.96％同源.苯酚羟化酶大亚基基因(LmPHs)PCR扩增表明,除类似Arthrobacter nicotianae的菌株外,其它3个分类操作单元的降酚菌都能利用多组分苯酚羟化酶代谢途径进行酚代谢.
- 高平平陈迎春刘彬彬张学礼赵立平
- 关键词：苯酚生物降解降解细菌活性污泥
- 大港孔店油田水驱油藏微生物群落的分子分析被引量：42
- 2005年
- 通过多聚酶链式反应 温度梯度凝胶电泳(PCR TGGE)和构建16SrRNA基因克隆文库两种方法对比研究了大港油田孔二北断块注水井和采油井的微生物群落结构。16SrDNAV3区PCR扩增产物的TGGE图谱分析表明,这两个油井的微生物群落结构差异很大。注水井样品的TGGE图谱中有6条主要条带,而采油井样品中只有一个条带占绝对优势。同时,建立了两个样品的16SrRNA基因克隆文库,从中分别挑选了10 8和5 0个克隆进行限制性酶切片段长度多样性分析(ARDRA)。注水井样品有33个操作分类单元(OTU) ,其中6个OTU是优势类型;而采油井样品只有8个OTU ,有1个OTU在文库中占绝对优势。克隆文库和TGGE的研究结果一致,均表明注水井样品的微生物多样性比采油井丰富很多。每个OTU的代表克隆序列分析结果表明,注水井样品中的细菌主要属于α、β、γ变形菌纲和放线菌纲,尤其是红细菌亚纲( 4 7% )。采油井样品的细菌主要属于α、β、γ变形菌纲,尤其是假单胞菌属( 6 2 % )。
- 佘跃惠张学礼张凡王凌华赵立平
- 关键词：油藏RRNA基因TGGE克隆文库微生物群落
- 焦化废水处理厂接触氧化池中降酚菌群的苯酚羟化酶大亚基基因多样性被引量：3
- 2005年
- 研究了某焦化废水处理厂接触氧化池中降酚菌群的苯酚羟化酶大亚基基因(thelargestsubunitofthemulti-componentphenolhydroxylase,LmPH)的多样性。通过温度梯度凝胶电泳(temperaturegradientgelelectrophoresis,TGGE)对比分析了氧化池4个区段(O1—O4)中降酚菌群LmPH的组成。它们的TGGE图谱完全一样,相似性为100%,表明该处理池中不同区段的降酚菌群的功能基因组成是高度相似的。以O4段的菌群为代表建立LmPH基因克隆文库,从中挑选了49个克隆测序。依据LmPH基因的DNA序列所推测的氨基酸序列完全相同的归为一类的原则,49个克隆被分为16种类型,其中优势LmPH基因主要有5种类型(多于4个克隆),而另外11种类型都只有1个克隆。与已知基因同源性超过90%的有7种类型,低于80%的有2种类型。基于氨基酸序列的系统进化树分析表明,LmPH文库中绝大部分的类型都属于低亲和常数(low-Ks)的LmPH,占所有克隆的92%。只有一个类型属于高亲和常数(high-Ks)的。因此,处理焦化废水的工业装置中不仅具有丰富多样的苯酚羟化酶基因类型,而且以编码低亲和常数的占优势地位,而过去报道的通过富集培养分离得到的降酚菌则多带有高亲和常数的酶。这提示我们传统的富集培养方法并不能筛选到生态环境中的真正优势功能菌。
- 张学礼熊顺子刘彬彬严兴周志华王凌华赵立平
- 关键词：TGGE克隆文库
- 焦化废水处理系统的微生物分子生态学研究
- 工业焦化废水中含有大量的有毒有害物质，它们对环境和人体的危害很大。目前比较有效的处理工业焦化废水的方法是生物法处理，即通过微生物的代谢将这些有毒有害物质降解去除。目前虽然已经发展出许多种生物处理工艺，如活性污泥法，厌氧-...
- 张学礼
- 关键词：焦化废水活性污泥苯酚羟化酶废水处理
- 文献传递
- TGGE分析焦化废水处理系统活性污泥细菌种群动态变化及多样性被引量：35
- 2003年
- 应用 TGGE指纹图谱技术对两个曝气池细菌种群的动态变化及多样性进行了研究。每 3d进行 1次 ,共 8个监测时期中同一曝气池活性污泥的 1 6Sr DNA V3- PCR TGGE指纹图谱基本一致 ,图谱间的相似性系数 (Cs)为 1 0 0 %。同一曝气池不同位点活性污泥的 TGGE指纹图谱也完全一致。功能不同曝气池活性污泥 TGGE指纹图谱存在差异 ,Cs为 83.3%。对 TJ1活性污泥 TGGE图谱中 9条主要条带回收、扩增、克隆建库 ,每个条带选 4个转化子进行序列分析 ,结果显示 TGGE条带是由序列不同的片段组成。 32个序列在97%的相似性下分成 1 6个分类操作单元 (OTU) ,1 4个 OTU与 Gen Bank中已登录的细菌种群的同源性≥ 9 7% ,2个 OTU的同源性为 95%和 94%。与 1 0个 OTU同源性较高的细菌类群是在活性污泥或污染环境分离或发现的 ,与 8个 OTU相似的细菌类群目前尚无法分离培养。
- 高平平晁群芳张学礼王凌华赵立平
- 关键词：微生物种群结构TGGE
- 无苯酚培养基分离到的降酚菌多样性的分子分析被引量：4
- 2006年
- 用3种不含苯酚的培养基(YPG、10%YPG和LB)从上海焦化厂废水处理系统(A2/O法)好氧池的悬浮污泥分离到24株降酚菌株.通过16SrDNAPCR扩增产物的限制性酶切分析(amplifiedribosomalDNArestrictionanalysis,ARDRA)、ERICPCR指纹图谱分析、多组分苯酚羟化酶大亚基(thelargestsubunitofthemulticomponentphenolhydroxylase,LmPH)基因的PCR扩增及16SrRNA基因测序的方法对这些降酚菌株进行表征.通过ARDRA分型,将这24株降酚菌株分为8个类型;利用ERICPCR可以将这24个菌株分为17种类型,说明同一ARDRA类型内菌株具有多样性.对17个ERIC类型代表菌株的16SrDNA扩增产物进行克隆并测序,测序结果在GenBank和RDP中进行比对.结果表明,与这17个代表菌株同源性最高的菌中,有6株是未见报道具有降酚功能的菌株.在这24株降酚菌中,有19株在苯酚含量为200mg/L的MP培养基中培养5d,苯酚降解率为20%左右,其余5株苯酚降解率达到100%,且均属于Rhodococcus属.本研究在降酚菌生物多样性上作了有益的探索.
- 熊顺子张学礼陈慕云诸晖冯玉周志华赵立平
- 关键词：悬浮污泥降酚菌
