朱佳佳
- 作品数：16 被引量：18H指数：3
- 供职机构：宁夏医科大学基础医学院医学科学技术研究中心更多>>
- 发文基金：宁夏回族自治区自然科学基金宁夏回族自治区卫生厅资助项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 细粒棘球蚴原头节mRNA测序及生物信息学初步分析
- 2014年
- 目的 利用RNA-seq技术对细粒棘球蚴原头节的转录组进行测序并对测序数据进行生物信息学分析,以揭示细粒棘球蚴原头节mRNA所包含的信息. 方法 用Trizol法提取原头节总RNA,分离mRNA,利用Illumina公司的HiSeq2000高通量测序仪对mRNA序列进行测序.参考英国桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）公布的细粒棘球绦虫基因组数据,对测序数据进行拼接组装,将获得的unigene与非冗余的蛋白序列数据库（non-redundant,Nr）、全球蛋白资源数据库（universal protein,UniProt）、基因本体数据库（gene ontology,GO）以及日本京都基因和基因组百科全书通路数据库（the kyotoencyclopedia of genes and genomes pathway,KEGG pathway）进行比对,获得该unigene的蛋白功能注释信息. 结果 测序后共获得132 007 609条读段（reads）,经过组装共形成91 342条unigene,平均长度为419 bp.通过GO分类注释,共有36 552个unigene获得了注释信息,分别归入到了生物学过程、分子功能、细胞组分3大类共计48个功能组.通过KEGG pathway的注释,有6 664条unigene注释到了KEGG上,参与了6大类生物过程中34个小类的代谢,共有227个代谢通路. 结论 获得了细粒棘球蚴原头节转录组相关信息,为棘球蚴病的后续研究提供了研究数据,积累了研究资料.
- 朱明星王娅娜巨艳王志昇朱佳佳赵巍
- 关键词：转录组生物信息学分析
- 结核分枝杆菌ESAT-6诊断抗原基因的克隆及同源性分析被引量：3
- 2010年
- 目的获得结核分枝杆菌ESAT-6抗原基因,进行DNA测序、同源性分析,为筛选结核病候选诊断抗原基因奠定基础。方法以结核菌标准菌株H37Rv为模板,通过PCR技术扩增出结核分枝杆菌ESAT-6抗原基因,将其重组到pGEM-T载体后进行序列测定和生物信息学分析。结果成功扩增出结核分枝杆菌ESAT-6抗原基因,测序表明该片段开放阅读框由288bp组成,与已发表基因核苷酸序列相比,同源性为99%,推导编码氨基酸序列同源性为90%。结论成功克隆结核分枝杆菌ESAT-6基因,测序结果表明该片段阅读框完整。
- 朱佳佳刘宏鹏张爱君丁淑琴
- 关键词：结核分枝杆菌克隆
- 结核分支杆菌CFP10/pET32a重组质粒的构建、原核表达及纯化被引量：1
- 2013年
- 目的构建结核分支杆菌重组CFP10/pET32a表达质粒,原核表达及纯化重组蛋白。方法将目的基因CFP10亚克隆到pET32a表达载体,转化入大肠杆菌BL21(DE3)plysS,鉴定后以IPTG诱导表达,通过SDS-PAGE检测其表达水平,经含Ni2+的His-bind树脂柱纯化CFP10。结果菌落PCR鉴定及测序分析表明,成功构建CFP10/pET32a重组质粒;IPTG诱导表达后,融合蛋白占菌体总蛋白的40%,占裂解物上清总蛋白的72.4%,表明重组的CFP10基因能在BL21中高效表达,表达的蛋白大部分以可溶性状态存在。结论成功构建结核分支杆菌CFP10/pET32a重组质粒,CFP10获得高效表达。
- 丁淑琴杨园园杨风琴朱佳佳
- 关键词：结核分支杆菌CFP10重组质粒纯化
- 结核分枝杆菌三种基因重组质粒的构建及原核表达被引量：1
- 2013年
- 目的构建结核分枝杆菌ESAT-6、CFP10、phoS2/pET28a表达重组质粒,并原核表达重组蛋白。方法将目的基因亚克隆到pET-28a表达载体,转化入大肠埃希菌BL21(DE3)plysS,诱导表达重组蛋白ESAT-6、CFP10、phoS2。结果成功构建基因工程菌株ESAT-6、CFP10、phoS2/pET-28a/BL21(DE3)plysS,表达重组蛋白ESAT-6、phoS2,因以包涵体形式存在,无法纯化。结论成功构建结核分枝杆菌ESAT-6、CFP10、phoS2/pET28a重组质粒,分别表达分子量约10×103、31×103的ESAT-6、phoS2重组蛋白,但无法纯化,CFP10不表达。
- 丁淑琴师志云董辉杨风琴朱佳佳
- 关键词：结核分枝杆菌ESAT-6CFP10重组质粒原核表达
- 结核分枝杆菌phoS2基因的克隆及序列分析被引量：3
- 2010年
- 目的扩增结核分枝杆菌phoS2基因,并将其克隆至质粒pGEMT中进行核苷酸序列特性分析。方法以结核菌标准菌株H37Rv为模板,通过PCR技术扩增出结核分枝杆菌phoS2抗原基因,将其重组到pGEM-T载体后进行酶切鉴定及序列测定和生物信息学分析。结果成功扩增出结核分枝杆菌phoS2抗原基因,测序表明该片段开放阅读框为927bp,与已发表基因核苷酸序列相比,同源性为81%,推导编码氨基酸序列同源性为87%。结论成功克隆phoS2基因,为结核病原核表达及相关研究奠定了基础。
- 丁淑琴王洁张焱王淑静朱佳佳张怡清
- 关键词：结核分枝杆菌克隆
- 神经病理性疼痛表达谱及核心基因的生物信息学分析
- 2021年
- 目的:通过生物信息学分析神经病理性疼痛(NPP)小鼠表达谱中差异表达基因及其核心调控基因(hub基因),探讨该疾病神经免疫机制并为神经病理性疼痛探索新的早期诊断标志物或治疗靶点。方法:从GEO数据库检索神经病理性疼痛小鼠表达谱数据集,GEO2R筛选神经病理性疼痛的差异表达基因(DEGs)。利用基因本体(GO)分析、KEGG信号通路富集和蛋白质互作(PPI)网络分析DEGs,并将筛选出的hub基因提交到DGIdb数据库中寻找相关的免疫治疗药物。结果:共筛选出121个差异表达基因。GO和KEGG富集分析结果表明这些基因均与免疫和炎症反应密切相关。PPI分析筛选出10个hub基因:Ctss、Rac2、Laptm5、Cd53、C1qb、Ptprc、Tyrobp、Csf1r、Ptpn6、Cd68。利用Cytoscape构建了药物-hub基因相互作用网络,包括16个候选药物和5个hub基因。结论:本研究将加深我们对神经病理性疼痛的神经免疫机制的认识,并为NPP生物标志物和探索药物作用靶点提供参考和依据。
- 李宗吉朱佳佳李琳
- 关键词：神经病理性疼痛差异表达基因核心基因蛋白质互作网络
- 一种神经内科下肢康复锻炼装置
- 一种神经内科下肢康复锻炼装置，本发明涉及康复锻炼器械技术领域，它包含底板和支撑板，底板上侧面的左右两侧对称垂直固定设置有支撑板；它还包含下肢锻炼机构、臀部支撑机构和手持杆；左右两侧的支撑板上均开设有凹槽，凹槽内部设置有手...
- 李宗吉王银邵熙雯朱佳佳李琳郑晓敏
- 文献传递
- 重组蛋白P29对细粒棘球蚴感染小鼠肝脏组织TGF-β/Smad信号通路的影响被引量：2
- 2019年
- 目的观察重组蛋白P29 (r P29)对细粒棘球蚴感染小鼠肝脏组织转化生长因子β(TGF-β)/Smad信号通路的作用。方法36只雌性BALB/c小鼠随机分为r P29免疫组(r P29组)、佐剂组、 PBS组,每组12只。r P29组小鼠皮下注射r P29蛋白(10μg/只,与等体积弗氏佐剂乳化),第2和4周各加强免疫1次;佐剂组、 PBS组仅注射相应的佐剂或PBS。末次免疫后2周, 3组小鼠均腹腔接种细粒棘球蚴原头节(1 500个/只)进行攻击感染。感染后12周,剖杀小鼠,分离肝脏组织,提取肝脏组织mRNA,实时荧光定量PCR检测小鼠肝脏组织中TGF-β1基因的相对表达水平,蛋白质印迹(Western blotting)检测小鼠肝脏组织中TGF-β/Smad信号通路下游相关蛋白TGFβ-RI、 TGFβ-RⅡ、 p-Smad2,3、 Smad4、 Smad7的表达水平。结果实时荧光定量PCR检测结果显示,佐剂组、 PBS组和r P29组小鼠肝脏组织中的TGF-β1 mRNA的相对表达量分别为0.98±0.42、 1.71±0.29和1.24±0.56, r P29组低于PBS组(P <0.01),高于佐剂组,但无统计学意义。Western blotting检测结果显示, r P29组小鼠肝脏组织TGF-β1蛋白表达灰度值为372.04±0.01,低于PBS组(673.02±0.06),高于佐剂组(213.69±0.31)。小鼠肝脏组织TGF-β/Smad信号通路相关蛋白的检测结果显示, r P29组TGF-β-RI、 TGF-β-RⅡ、 p-Smad 2,3、 Smad 4的灰度值分别为357.59±0.83、 289.07±0.21、 204.06±0.19、 396.11±0.01,低于PBS组(496.89±0.09、 378.41±0.01、428.11±0.29、 566.95±0.21),高于佐剂组(171.99±0.82、 185.77±0.09、 128.09±0.08、 205.87±0.59)。r P29免疫组Smad 7蛋白灰度值为278.89±0.12,高于PBS组(142.32±0.07),低于佐剂组(384.17±0.51)。结论r P29能够降低细粒棘球蚴感染小鼠肝脏组织中TGF-β1 mRNA和蛋白的表达水平;下调TGF-β/Smad下游信号通路相关蛋白TGF-β-RⅠ、 TGF-β-RⅡ、 p-Smad 2,3和Smad 4的表达,上调Smad 7的表达。
- 马锐刘成徐士梅朱明星赵嘉庆万巧凤朱佳佳赵巍
- 关键词：细粒棘球蚴转化生长因子Β1TGF-Β/SMAD信号通路
- 一种神经内科下肢康复锻炼装置
- 一种神经内科下肢康复锻炼装置，本发明涉及康复锻炼器械技术领域，它包含底板和支撑板，底板上侧面的左右两侧对称垂直固定设置有支撑板；它还包含下肢锻炼机构、臀部支撑机构和手持杆；左右两侧的支撑板上均开设有凹槽，凹槽内部设置有手...
- 李宗吉王银邵熙雯朱佳佳李琳郑晓敏
- 结核分支杆菌重组蛋白rps12的结构与功能预测被引量：1
- 2012年
- 目的应用生物信息学分析软件预测结核分支杆菌重组抗原rps12的结构与功能。方法应用NCBI、Expasy等在线生物信息学网站及DNAstar、Rasmol等软件包分析预测结核分支杆菌重组蛋白rps12的二级结构、三级结构;预测主要抗原表位等。结果经预测,该蛋白分子质量约为13849.2KDa,理论等电点为11.37,有6个抗原表位,其结构域位于1-34,35-124。结论生物信息学技术在结核分支杆菌rps12重组蛋白研究中有一定的理论和参考价值。
- 丁淑琴杨园园杨凤琴朱佳佳
- 关键词：结核分支杆菌生物信息学
