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李豪丽
作品数:
2
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供职机构:
广东医学院公共卫生学院
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发文基金:
广东省科技计划工业攻关项目
国家自然科学基金
广东省自然科学基金
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相关领域:
医药卫生
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合作作者
梁岩
茂名市人民医院
欧阳平
广东医学院公共卫生学院
钟寿强
茂名市人民医院
饶绍奇
广东医学院公共卫生学院
林美华
广东医学院公共卫生学院
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基于知识学习的冠心病风险功能模块挖掘方法研究
2013年
目的发展基于先验知识策略挖掘冠心病风险功能模块的网络分析方法。方法通过蛋白-蛋白互作知识引导扩展冠心病风险基因,构建冠心病特异性基因网络。应用Newman谱算法分解网络获取其中的高度模块化的网络模块(子网),并对各模块进行网络拓扑性质评价和功能富集分析。结果应用266个冠心病易感基因作为种子基因,由蛋白-蛋白互作知识引导构建了冠心病特异性网络,其中包含1819个基因和9767个互作对。应用谱分解法提取了14个模块,其中多数符合无标度网络特性。功能富集分析发现这些模块参与系列已知的冠心病风险生物学通路以及一些新的冠心病风险通路。结论应用表明本文提出的知识学习方法是一种识别复杂疾病风险功能模块的有效方法。
李豪丽
左晓宇
欧阳平
林美华
赵忠
梁岩
钟寿强
饶绍奇
关键词:
数据挖掘
冠心病
基于知识学习的冠心病风险功能模块挖掘方法研究
[目的] 发展基于先验知识挖掘冠心病风险功能模块的网络分析方法,为研究冠心病发生发展的分子机制和寻找风险基因提供研究方向。 [方法] 1.根据复杂疾病的生物学机制以及结合蛋白互作的本质,从已报道的疾病风险基因出发,整合P...
李豪丽
关键词:
知识挖掘
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冠心病
生物学机制
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