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群体病例管理数据库的开发研究--含样品管理的新型医学病例信息管理系统被引量：1: 2010年; 针对当前病例临床信息与样品管理存在交叉需求的空缺,开发一种将临床信息与样品管理相结合的医学病例信息管理系统。以MS SQL Server 2000建立数据库,以Visual C++6.0开发基于Client/Server模式的客户端应用程序,以实现对病例资料及相关样品信息的录入、浏览、查询选择、分级统计、样品管理及自动生成病例信息综合文档等功能,从而达到按科研所需对群体病例资料及其样品的管理。该系统有助于提高临床科研工作的效率、质量及管理水平,为医学病例及样品信息的综合动态管理提供了新的技术平台。; 潘世扬穆原王虹王彤黄珮珺马建锋蒋理张杰顾兵衣鲁江; 关键词：生物样品信息管理系统

血浆DNA分析用于非小细胞肺癌患者术后短期复发的预测: 背景在世界范围内,肺癌均已成为癌症死亡的主要原因,尽管手术对非小细胞肺癌(NSCLC)仍是有效治疗手段,但50%~90%的患者于术后2年内复发,90%~95%的患者于术后5年内复发。目前,对NSCLC患者术后复发缺乏有...; 穆原; 关键词：复发血浆DNA 抑癌基因; 文献传递

定量检测血浆DNA水平评估非小细胞肺癌患者术后复发的价值被引量：4: 2009年; 目的探讨定量检测非小细胞肺癌（NSCLC）患者手术前后的血浆DNA水平对术后复发的预测能力。方法采集做肺癌根治术的40名NSCLC患者术前2～14d（中住天数：6d）及术后5～16d（中位天数：8d）的静脉血，采用含内参照双重荧光定量PCR技术，进行血浆DNA定量检测。结果血浆DNA含量在100名健康对照者为18．5（15．5～24．9）ng／ml，在NSCLC患者术前为66．5（49．4—76．4）ng／ml，术后为56．9（43．1～89．6）ng／ml，均显著高于健康对照组（P〈0．001）。29例未复发患者，术后血浆DNA水平显著降低（P〈0．001），11例复发患者手术前后DNA水平无显著差异（P=0．131）。血浆DNA定量对NSCLC患者术后复发的诊断效能，在术前AUC：0．448，术后AUC：0．868，术后显著优于术前（P=0．002）。以术后血浆DNA≥73．3ng／ml作为临界值，预测复发的敏感性：81．8％，特异性：82．8％，阳性预测值：64．3％，阴性预测值192．3％。结论术后1—2周测定血浆DNA可对NSCLC患者术后复发进行评估，远早于常用的检查技术，具有重要的临床应用价值。; 穆原潘世扬张石江束永前陈亮张杰颜承靖陈丹张丽霞王宏蒋叶顾兵; 关键词：非小细胞肺癌手术复发血浆DNA

血浆中APC基因甲基化定量检测方法的建立及其初步应用: 目的建立血浆APC基因甲基化荧光定量MSP检测方法,确定其检测的最低检出范围,并对肺癌患者的血浆进行定量分析。方法对APC基因启动子甲基化阳性肺癌细胞株NCI-H460细胞进行有限稀释法获取单个集落形成的细胞,以经典的酚...; 潘世扬谢而付束永前高丽张丽霞陈丹陈进步赵文君穆原张寄南; 关键词：肺肿瘤血浆DNA APC 甲基化; 文献传递

血浆中APC基因甲基化检测在早期肺癌诊断中的应用被引量：4: 2008年; 目的研究血浆DNA中APC基因启动子甲基化与肺部实体瘤良、恶性的关系,确定血浆中APC基因甲基化检测对早期肺癌诊断的意义。方法以92例CT检查发现肺部实体瘤(直径≤2 cm),并在CT引导下行肺部穿刺患者和23例健康人作为研究对象,收集血浆样本,利用磁珠法提取DNA,行亚硫酸氢盐化学修饰后,采用针对APC基因启动子区的甲基化引物和探针,以荧光定量MSP法(TaqM an探针)检测APC基因的甲基化。结果92例肺部实体瘤患者经病理诊断,有58例确诊为肺癌、31例为肺部良性疾病、3例未明确诊断。58例肺癌患者中有11例(19%)测出APC基因启动子区甲基化阳性,31例肺部良性疾病、3例未明确诊断和23例健康对照组均为阴性。结论检测血浆DNA中APC基因启动子甲基化有助于早期肺癌的诊断。; 谢而付潘世扬高丽俞同福陈丹张丽霞陈进步穆原赵文君张寄南; 关键词：血浆DNA 早期肺癌甲基化 APC基因

群体病例管理数据库的开发研究——含样品管理的新型医学病例信息管理系统: 目的针对当前病例临床信息与样品管理存在交叉需求的空缺,开发一种将临床信息与样品管理相结合的医学病例信息管理系统。方法以MS SOL Server 2000建立数据库,涵盖患者基本信息、临床诊断、影像诊断、病理诊断、样品基...; 潘世扬穆原王彤黄佩瑶马建锋蒋理张杰

实时荧光定量检测人血浆中RASSF1A基因启动子甲基化被引量：5: 2008年; 目的建立检测人血浆DNA中RASSF1A基因甲基化的方法。方法以肺癌细胞株NCI-H460作为RASSF1A基因启动子区甲基化阳性样本,传统酚/氯仿法提取细胞DNA,经紫外分光光度计定量后以10倍稀释的浓度梯度依次投入到200μl健康人血浆中,制备得到模拟肺癌患者血浆。用磁珠法从模拟血浆样本和15例早期肺癌患者血浆中提取总DNA。对血浆DNA模板进行亚硫酸氢盐化学修饰,并以TaqMan技术的实时荧光定量甲基化特异性PCR(MSP)进行检测。以模拟血浆样品作为标准品,用外标准曲线法对肺癌患者血浆中的甲基化RASSF1A进行定量。结果实时荧光定量MSP对模拟肺癌患者血浆的检测最低限为150拷贝(甲基化的肿瘤DNA)/ml(血浆)。15例肺癌患者5例RASSF1A甲基化阳性(33.3%)。5例肺癌患者血浆中甲基化的RASSF1A基因的浓度分别为2.56×103,8.20×104,1.45×104,3.31×104和4.24×104拷贝/ml。结论实时荧光定量MSP法检测肺癌患者血浆DNA中RASSF1A基因甲基化,灵敏度高,特异性强。; 高丽潘世扬束永前谢而付陈进步赵文君穆原张丽霞陈丹黄珮珺张寄南; 关键词：RASSF1A 甲基化实时荧光定量甲基化特异性聚合酶链反应血浆DNA

肺癌患者血浆中APC基因启动子甲基化定量检测研究被引量：13: 2009年; 背景与目的:APC基因编码的蛋白参与信号转导途径,大量研究证实APC启动子区的高甲基化在肿瘤的发生发展中起重要作用。本研究建立血浆APC基因实时荧光定量甲基化特异性基因扩增(methylation-specificPCR,MSP)检测方法,并对临床肺癌患者血浆进行检测,以确定该方法在肺癌诊断中的应用价值。方法:将APC基因启动子甲基化阳性肺癌细胞株NCI-H460细胞用有限稀释法获取单个集落形成的细胞,以经典的酚-氯仿法提取细胞DNA,并用MSP对APC基因甲基化进行验证,紫外分光光度计定量并以10倍稀释的浓度梯度依次投入到200μL健康人血浆中,得到模拟肺癌患者血浆,利用磁珠核酸提取方法从模拟肺癌及肺癌患者、肺部良性疾病患者和健康对照者血浆中提取DNA,对血浆DNA模板进行亚硫酸氢盐化学修饰;以模拟血浆样品作为标准品,采用外标准曲线法对各种血浆样品中APC甲基化进行定量分析。结果:所建立的实时荧光定量MSP检测方法的线性范围为1.5×102～1.5×105拷贝/mL,用该方法检测甲基化肿瘤细胞的DNA其最低检测限为1.5×102拷贝/mL。78例肺癌患者有40例组织中检测出APC基因甲基化阳性,其中的19例(47.5%)肺癌患者血浆中APC基因启动子甲基化阳性,APC甲基化浓度为1.67×102～6.78×103拷贝/mL,中位浓度为1.60×103拷贝/mL。38例组织阴性的肺癌患者、31例肺部良性疾病患者和23例健康者的血浆APC基因启动子甲基化均为阴性。结论:实时荧光定量MSP检测血浆APC基因甲基化在肺癌诊断方面具有潜在应用价值。; 潘世扬谢而付束永前高丽张丽霞陈丹陈进步赵文君穆原张寄南; 关键词：肺肿瘤血浆DNA APC基因 DNA甲基化

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