康晓龙
- 作品数：38 被引量：101H指数：6
- 供职机构：宁夏大学农学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金宁夏回族自治区自然科学基金河北省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 不同剩余采食量水平的安格斯牛下丘脑单核苷酸多态性和可变剪接分析
- 2022年
- 【目的】揭示可变剪接事件参与调控肉牛剩余采食量(residual feed intake,RFI)水平的潜在作用,提高肉牛饲料利用率。【方法】利用Illumina技术对2个RFI水平(高/低)的安格斯牛下丘脑组织进行高通量测序,分别进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism site,SNPs)和可变剪接(alternative splicing,AS)分析,同时对差异表达AS相关基因进行功能富集。【结果】2个RFI水平组共检测到SNP数量48227~1000092个,其中转换型突变所占比例最高。AS分析发现,共有12385个可变剪接基因的35463个AS事件,有426个显著差异表达AS相关基因对应498个AS事件,其中外显子选择性跳跃类型AS事件所占比例最大,占总数的85.33%。KEGG通路富集分析表明,差异表达AS相关基因主要富集到胰岛素信号通路、催乳激素信号通路、胆碱代谢、mTOR信号通路、cAMP信号通路、ErbB信号通路和昼夜节律等,表明这些差异表达AS相关基因在肉牛RFI表型变异中发挥重要作用。【结论】通过分析2个RFI水平(高/低)的安格斯牛下丘脑组织表达基因的遗传变异及AS事件,为后续开展肉牛RFI相关基因功能分析与挖掘提供有效数据和理论基础。
- 周小南马应杨朝云丁燕玲张岩峰赵志艳康晓龙
- 关键词：安格斯牛下丘脑单核苷酸多态性可变剪接
- 高、低剩余采食量肉牛下丘脑组织中差异表达基因分析
- 2023年
- 为了分析高、低剩余采食量(residual feed intake,RFI)相关肉牛下丘脑组织中的基因表达图谱,探讨差异表达基因与牛RFI表型变异间的关系,试验选择高剩余采食量(HRFI)、低剩余采食量(LRFI)秦川牛各3头,分为HRFI组和LRFI组,采集下丘脑组织样本,从中提取总RNA进行转录组测序,筛选出RFI相关差异表达基因,对这些基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析,并利用STRING数据库构建差异表达基因的蛋白质相互作用网络图,最后随机选取6个差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证。结果表明:HRFI组和LRFI组中均存在1538个差异表达基因,包括AGRP、PMCH等与采食相关的基因,GH1、MTNR1A和RYR2等与代谢相关的基因,此外差异基因主要富集于钙信号通路、cAMP信号通路和昼夜节律等通路中。通过蛋白质相互作用网络筛选出3个核心子网络和7个核心基因。实时荧光定量PCR验证结果与转录组测序结果一致。说明下丘脑组织中AGRP、PMCH、GH1、MTNR1A和RYR2等差异表达基因及钙信号通路、cAMP信号通路和昼夜节律等多条通路可能参与调控肉牛RFI。
- 赵志艳杨朝云丁燕玲张岩峰周小南史远刚康晓龙
- 关键词：基因下丘脑转录组
- IGF2基因第2外显子多态性与牛生长性状相关性分析被引量：3
- 2022年
- 【目的】探究IGF2第2外显子多态位点与秦川牛、西门塔尔牛、安格斯牛及新疆褐牛4种品种牛群体的多态性及与生长性状的相关性,为肉牛遗传改良提供依据。【方法】以秦川牛等4个肉牛品种共91头为研究对象,利用PCR-RFLPs技术分析IGF2基因第2外显子多态性,并将IGF2的基因型与生长性状进行相关分析。【结果】IGF2基因第2外显子多态性在不同牛品种中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),且均属于中度多态(0.250.05)。IGF2基因第2外显子多态性与不同月龄秦川牛生长性能相关性分析表明,AA、AB型个体12月龄体斜长显著高于BB型(P<0.05),其他月龄无显著差异(P>0.05);12、18月龄AA、AB型个体胸围显著优于BB型个体(P<0.05),其余各项指标基因型间差异不显著(P>0.05);在所有检测品种中,A为优势等位基因。【结论】研究表明IGF2基因第2外显子多态性与生长性能具有显著相关性,可作为肉牛生长性状辅助选择的标记之一,为优良肉牛早期选择提供参考依据。
- 丁燕玲王鹏飞杨朝云张岩峰周小南史远刚康晓龙
- 关键词：IGF2基因PCR-RFLPS生长性状遗传多态性
- 一种保存磁小体的溶液及其应用
- 本发明提供了一种保存磁小体的溶液及其应用，属于生物材料应用领域。本发明提供的保存磁小体的溶液为磷酸盐缓冲溶液（PBS），本发明溶液在保存磁小体过程中对其结构和功能的影响和干扰最小，将保存的磁小体连接得到的BMPs-PEI...
- 方美英康晓龙杨万杰
- 文献传递
- 不同剩余采食量水平的安格斯牛生长性状差异性分析被引量：4
- 2020年
- 为探究不同剩余采食量对肉牛生长性能的影响,选用体质量、年龄相近的30头安格斯牛进行81 d的饲养试验.试验结束后利用个体采食量(FI)对平均日增质量(ADG)和平均中期代谢体质量(MMBW)的回归分析估计出个体预期采食量(EFI),利用FI与EFI之差计算出30头试验牛的剩余采食量,并分为低剩余采食量组(LRFI组)和高剩余采食量组(HRFI组).采用SAS 9.4中TTEST过程对LRFI组和HRFI组肉牛生长数据进行均值的差异性检验;采用SAS 9.4中CORR过程对LRFI组和HRFI组肉牛各生长数据进行相关性系数计算并作相应的显著性检验.结果表明:在所涉及的指标中,HRFI组与LRFI组间仅FI差异有统计学意义(p<0.01),其余指标差异均未达到统计学意义;LRFI组的RFI与腰角宽存在显著正相关关系(r=0.61,p<0.05)、与管围和FI之间存在极显著正相关关系(p<0.01),相关系数分别为0.71,0.78.得出LRFI组肉牛饲料转化效率高于HRFI组,较HRFI组节约8.8%的FI;且本研究涉及的各个生长指标差异均未达到显著水平.
- 杨朝云康晓龙淡新刚周靖航卢鑫叶连萌赵国丽李鹏李鹏
- 关键词：安格斯牛
- 滩羊Eph A3基因克隆表达分析及生物信息学初步研究被引量：4
- 2019年
- 本研究以滩羊不同时期(1月龄和48月龄)被毛卷曲性状差异为基础,对在前期构建的消减文库中获得与滩羊被毛卷曲形成相关的重要候选基因EphA3进一步分析。首先通过PCR扩增技术获得EphA3基因的编码区CDS全长,并利用生物信息学方法分析该基因所编码的蛋白结构及其在不同物种中的同源性和进化关系。结果表明:滩羊EphA3基因序列在不同物种间高度保守,在皮肤组织中表达量最高;该基因在48月龄滩羊皮肤组织中的表达量显著高于1月龄个体(P<0.05)。EphA3基因可能是影响不同时期滩羊被毛卷曲差异的候选基因之一。
- 徐芹芹刘玉芳康晓龙康晓龙
- 关键词：生物信息学分析滩羊
- 酸化奶饲喂量对荷斯坦犊牛生长及断奶后期瘤胃菌群的影响被引量：1
- 2020年
- 为研究不同酸化奶饲喂量对荷斯坦犊牛生长及断奶后期瘤胃菌群多样性的影响,试验采用单因子完全随机设计,选择健康状况良好荷斯坦母犊12头,随机均分为2组,对照组(L1组:自由采食)和试验组(L2组:限量饲喂)。结果表明,①不同饲喂量对哺乳期及断奶后期犊牛体重和日增重均有显著影响,自由采食使犊牛体重和日增重显著升高,对肠道发酵参数无显著影响。②两组样本中相对丰度最高菌门为拟杆菌门与厚壁菌门,属水平上相对丰度最高菌类为普雷沃氏菌属、瘤胃球菌属和毛螺菌属,均无显著差异,限量饲喂显著降低未注释韦荣氏菌属相对丰度(P<0.05);③利用LEfSe分析限量饲喂组梭菌目、梭菌纲、疣微菌科、未注释疣微菌科相对丰度较自由采食组显著增加(P<0.05);栖瘤胃普雷沃菌、未注释普雷沃氏菌科、拟杆菌目、拟杆菌纲、普雷沃氏菌科相对丰度较自由采食组显著减少(P<0.05)。综上所述,自由采食酸化奶显著增加犊牛体重和日增重,提高未注释韦荣氏菌属、栖瘤胃普雷沃菌、未注释普雷沃氏菌科、拟杆菌目、拟杆菌纲、普雷沃氏菌科相对丰度,在提高犊牛生长速度同时对肠胃菌群也有一定调节作用。
- 李叔臻王雅晶董旭明朱云王雅春曹志军李胜利马云淡新刚康晓龙史远刚
- 关键词：犊牛限量饲喂自由采食
- 超级增强子调控基因表达的生物学作用及其在哺乳动物中的应用前景被引量：1
- 2021年
- 超级增强子是一类包含多个普通增强子的大簇,主要富集高密度的转录因子、辅助因子及增强子相关表观修饰位点。与普通增强子相比,超级增强子具有更高的转录激活能力,在细胞类型特异性发育、分化以及肿瘤的发展进程中发挥关键作用。研究超级增强子在基因转录过程中的作用机制,对于揭示哺乳动物表型性状的分子机理具有十分重要的生物学意义。本文概述了超级增强子的概念、特性及鉴定方法,总结了超级增强子发挥作用的主要机制,最后对超级增强子调控动物重要表型的研究进展进行综述,并且结合超级增强子在哺乳动物方面的最新研究进展,讨论了其在哺乳类动物中的应用前景,旨在为超级增强子在动物重要性状表型研究中提供参考。
- 赵磊康晓龙
- 关键词：转录调控启动子增强子非编码RNA
- 抑制消减杂交技术及其在动物皮肤毛囊中的应用
- 2012年
- 抑制消减杂交技术(SSH)是一种用于分离两个遗传背景相关的DNA样品之间差异表达基因的方法,在筛选组织/细胞差异表达基因方面表现出独有的技术特点。就抑制消减杂交技术的原理、步骤及动物皮肤及毛囊组织的应用进行综述。
- 康晓龙李新海冯登侦
- 关键词：抑制消减杂交差异表达基因毛囊皮肤
- 几种差异表达基因筛选方法比较
- 2012年
- 生命有机体在不同发育时期不同部位的基因表达具有差异性,其按照时间和空间顺序有序地进行复杂而精细的网络调控过程。基因的这种差异表达决定着每一个生命体的生长发育、分化、细胞周期调控、衰老及死亡等生命过程。比较不同细胞或不同基因型在基因表达上的差异，分离并克隆不同组织或同一组织不同发育阶段差异表达的基因，不仅是研究生命过程分子机制的基础，也是进行功能基因组学领域研究的前提。因此，寻找差异表达基因成为目前基因研究的一个非常重要的内容。
- 康晓龙李新海冯登侦
- 关键词：差异表达基因基因筛选细胞周期调控功能基因组学生命过程发育时期
