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沙门菌玻片凝集血清分型与多重荧光PCR血清分型检测试剂盒方法比较被引量：7: 2020年; 目的探讨在肠道多病原监测中,沙门菌多重荧光PCR血清分型检测试剂盒的适用性,扩展沙门菌的分子分型和鉴定方法,提高分型效率,以更快更好地应对由沙门菌引起的腹泻事件。方法利用沙门菌多重荧光PCR血清分型检测试剂盒和传统玻片凝集血清分型方法,对2013—2018年北京市丰台区肠道多病原监测中分离获得的95株沙门菌进行分型分析,比较2种结果的符合程度。结果采用传统玻片凝集法,95株沙门菌被分为21种血清型。采用多重荧光PCR血清分型检测试剂盒,85株沙门菌被分为17种型别,10株菌无法分型,包含Salmonella Goldcoast、S.London、S.Senftenberg、S.Thompson、S.Panama、S.Othmarsche 6种血清型。在试剂盒成功分型的85株菌中,83株菌的分型结果与玻片凝集法一致,符合率为97.65%。结论在沙门菌分型中,玻片凝集法应用良好,多重荧光PCR血清分型检测试剂盒与前者分型结果一致性高,检测效率显著提升,对不常见血清型的鉴定有待扩充,2种方法联合使用可全面提高实验室对沙门菌的分型检测效率和准确率。; 董晓根颜涛石婧秦萌封会茹余红王兆娥张志敏信振江; 关键词：沙门菌血清分型

北京市丰台区诺如病毒暴发疫情的实验室鉴定及基因特征分析被引量：9: 2015年; 目的对北京市丰台区2014年5 6月发生的3起诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情进行病原体鉴定及基因分型。方法采用实时荧光定量-聚合酶链反应法对62份病例标本进行诺如病毒核酸检测,阳性标本经反转录-聚合酶链反应扩增RNA多聚酶区部分序列,使用Bio Edit及Mega 6.0软件对扩增序列进行同源性及进化分析。结果 36份标本中检出GⅡ型诺如病毒,阳性率为58.06%;序列分析表明幼儿园为GⅡ.7型,学校1为GⅡ.8型,学校2为GⅡ.6型。结论诺如病毒是引起丰台区急性胃肠炎暴发疫情的主要病原体,丰台区流行的诺如病毒基因型存在多样性。; 秦萌陆翌禹封会茹杨军勇武庆瑞余红王兆娥董晓根李洁; 关键词：诺如病毒荧光定量-聚合酶链反应进化分析基因分型

北京市丰台区2011-2014年A组乙型溶血性链球菌emm基因分型及耐药基因分析被引量：6: 2015年; 目的了解北京市丰台区2011-2014年A组乙型溶血性链球菌(GAS)的基因分型及对红霉素耐药基因谱的特点。方法用猩红热、扁桃体炎或咽峡炎患者的咽拭子进行细菌分离培养,应用PCR方法检测emm基因及耐药基因erm A、erm B、mef A、转座子基因Tn 916。结果北京市丰台区2011-2014年感染GAS的emm 12.0基因型占78.33%,其次为emm 1.0基因型(20.00%)、emm 22.3基因型最少(1.67%);耐药基因erm B及转座子基因Tn916的携带率均为100.00%,所有菌株都不携带耐药基因erm A和mef A。结论北京市丰台区2011-2014年感染GAS的流行株为emm 12.0型;本地区菌株对红霉素耐药率较高,菌株间耐药基因扩散现象明显。; 王兆娥封会茹余红汤旭董晓根; 关键词：链球菌耐药基因

2017年北京市首起人博卡病毒聚集性疫情流行病学调查和分析被引量：3: 2019年; 目的对一起由人博卡病毒(HBoV)引起的聚集性发热疫情进行调查分析。了解其流行情况及HBoV毒株的进化情况,为今后HBoV发热疫情的防治提供参考依据。方法对2017年北京市丰台区13例发热患儿展开流行病学调查,采集咽拭子标本,并采用实时荧光PCR法进行呼吸道病毒核酸检测。对HBoV阳性标本进行VP1基因区特异性扩增和测序,通过DNAStar7.1、Bioedit v7.0.9、MEGA 6.0.6等生物信息学软件对扩增序列进行基因离散率和系统进化树分析。结果发病患儿临床症状以发热、咳嗽等呼吸道症状为主。患儿具有明显聚集性。10份样本中共检出3份HBoV阳性。基因离散率和进化树显示,3份样本均为HBoV-1型,核苷酸序列同源性100%,与北京株311-BJ07等流行株高度同源。结论此次聚集性发热疫情是由1型HBoV引起的,证实该型HBoV已在我国广泛存在。提示HBoV-1型引起的呼吸道感染形势严峻,应加强关注和研究,制定防治措施。; 董晓根张志敏秦萌李若曦封会茹冯宝玉余红尉秀霞王兆娥石婧张建军; 关键词：人博卡病毒

一起因厨师携带副溶血性弧菌引起的食物中毒事件检测与溯源被引量：2: 2019年; 目的查明一起食物中毒事件发生原因。方法采用传统细菌分离鉴定和实时荧光PCR检测相结合的方法对样本进行鉴定,对分离出的副溶血性弧菌进行常规鉴定、血清分型和脉冲场凝胶电泳分型(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)分析,图谱用BioNumerics软件分析并绘制聚类分析图,对分离菌株进行分子分型和同源性分析。结果共分离出3株副溶血性弧菌,两株来自病例,一株来自制作凉菜的厨师,血清型均为O3:K6型,经PFGE聚类分析得到2种带型,两名病例菌株带型完全一致,与厨师的菌株带型存在一个条带的差异,为高度相关株。结论推断此次食物中毒是由厨师携带副溶血性弧菌污染凉菜所引起的。; 石婧余红曲梅张晓嫒杨霄星董晓根王兆娥尉秀霞封会茹秦萌李洁; 关键词：食物中毒副溶血性弧菌同源性分析

一起聚集性发热疫情中柯萨奇病毒A组2型的鉴定及基因特征分析被引量：2: 2019年; 肠道病毒(Enterovirus,EV)可以引起包括手足口病的全身各系统的病症,柯萨奇病毒A组2型(Coxsackievirus A2,CV-A2)在世界范围广泛流行。我们对2018年北京市丰台区一起聚集性发热疫情进行病原学鉴定和基因特征分析,为该类疫情的防控提供实验室支持。采集6例病例的咽拭子标本,进行EV实时荧光RTPCR检测,结果显示5份为EV阳性。使用人横纹肌肉瘤细胞进行病毒分离,分离到4株EV,通过EV分支分型方法,确定这4株EV为CV-A2。4株CV-A2分离株的VP1区核苷酸序列和VP4区核苷酸序列相似性高达99.5%~100%,基因进化树图分析显示,4株CV-A2与D基因型代表株处于同一分支,与2017年中国天津分离株MG926808核苷酸同源性最高,为99.1%~99.3%。根据以上结果,确定此次聚集性发热疫情是由CV-A2感染引起,且属于在我国流行的D基因型,提示我们在以后的工作应结合流行病学资料,加强对CV-A2的监测。; 尉秀霞杨霄星王兆娥颜涛余红封会茹秦萌石婧董晓根张勇; 关键词：D基因型

2013-2015年北京市丰台区腹泻患者肠产毒性大肠埃希菌的MLST分型被引量：2: 2018年; 目的了解2013-2015年北京市丰台区腹泻患者肠产毒性大肠埃希菌(ETEC)分布与分子分型特征,为ETEC的分子流行病学研究提供参考依据。方法对2013-2015年北京市丰台区腹泻病例的粪便标本进行致病菌分离培养,采用MLST法,用e BURST V 3软件和MEGA 5.0对分离株进行分子分型及进化树分析。结果从1 599例腹泻病患者粪便标本中检出ETEC 58株,分离率为3.6%(58/1 599)。58株ETEC分离株MLST分型结果为共分成19个型别,部分试验菌株形成2个ST克隆群,分别为STC-6007、STC-3103,分别同属于一个进化分支,多数菌株的遗传关系较远,可能与菌株来源多样有关。结论 ETEC感染2013-2015年在丰台区腹泻疾患中占较高比例,ST-6010与ST-69是最主要的ST型别。; 余红董晓根尉秀霞秦萌王兆娥陈倩; 关键词：致泻大肠埃希菌管家基因进化树

2017—2022年北京市丰台区食源性疾病沙门菌病原学分析: 2024年; 目的了解北京市丰台区食源性疾病监测中检出沙门菌的血清型、分子分型及耐药情况。方法对2017—2022年北京市丰台区3家哨点医院收集的腹泻病例粪便标本中检出的77株沙门菌进行血清分型、分子分型及药物敏感实验,同时对3者间的相关性进行分析。计数资料的比较采用χ^(2)检验,以P<0.05为差异有统计学意义。结果肠炎沙门菌为优势血清型;74株沙门菌经PFGE聚类分析得到48种带型,各带型条带差异较大,肠炎沙门菌形成2个大簇;77株沙门菌多重耐药率63.64%,耐药率前3位的抗生素为:萘啶酸(67.53%)、链霉素(59.74%)、氨苄西林(57.14%),多重耐药谱有32种,耐药菌株数最多的耐药谱为AMP-AMS-NAL-Sul-CT-STR,且全部为肠炎沙门菌。结论北京市丰台区沙门菌血清型相同的菌株间PFGE带型一致性较高,成簇现象明显;沙门菌耐药情况严重,耐药谱复杂;血清型与耐药谱间有一定关联性。; 王兆娥张志敏余红曹佳琪刘晓玲封会茹; 关键词：沙门菌血清分型分子分型耐药性分析

2016-2017年北京市丰台区手足口病流行病学和病原学特征分析被引量：9: 2019年; 目的了解北京市丰台区手足口病的流行现况,为手足口病防治提供依据。方法对2016-2017年北京市丰台区手足口病病例资料进行描述性流行病学分析;对采集的病例标本进行肠道病毒检测并进行病原学特征分析。结果2016-2017年北京市丰台区累计报告病例5 171例,年均发病率为111.21/10万。手足口病高发于6岁以下儿童,占病例总数的86.04%,发病患者男女性别比为1.53∶1。散居儿童和幼托儿童是发病的主要人群,共占病例总数的88.84%。2016年和2017年均有两个发病高峰,2016年为6-7月,10-11月;2017年为7-8月,10-11月。地区间发病水平差异明显,卢沟桥街道病例总数(763例,190.65/10万)和花乡年均发病率(700例,222.14/10万)高于全区其他地区。实验室阳性病例611例,EV71占21.60%,Cox A16占26.84%,Cox A 6占27.17%,其他肠道病毒24.39%。结论北京市丰台区手足口病流行有明显的人群分布和地区分布差异,呈多病原共流行态势,应加强手足口病病原学监测工作。; 尉秀霞王兆娥余红封会茹秦萌石婧武晶冯宝玉董晓根杨霄星; 关键词：手足口病流行病学肠道病毒病原学

一起O10:K4型副溶血弧菌食物中毒的病原学特征分析: 2024年; 目的对北京市丰台区一起O10:K4型副溶血弧菌食物中毒进行病原学特征分析。方法 2021年10月10日北京市丰台区辖区哨点医院上送的食物中毒病例粪便标本共4件,标本编号为FTSY1~4。疾控中心现场处置共采集标本30件,其中食品标本13件、环境标本15件、餐厅用水2件。采用实时荧光PCR法和传统细菌分离鉴定法相结合的方式进行病原学鉴定。副溶血弧菌分离株采用玻片凝集法进行血清分型、PCR法检测毒力基因、微量肉汤稀释法进行药敏试验,选用SfiI酶进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)实验,BioNumerics v6.0软件进行分子分型和聚类分析。采用全基因组测序(WGS)技术及CSIPhylogeny软件进行全基因组单核苷酸多态性分析(wgSNP)。结果 34件标本共分离出4株O10:K4型副溶血弧菌,均为临床分离株。4株菌均为产毒株,携带毒力基因tdh、T3SS1和T3SS2,不携带trh。4株菌对17种抗生素(氨苄西林、氨苄西林-舒巴坦、头孢噻肟、头孢他啶、头孢他啶/阿维巴坦、厄他培南、美罗培南、阿奇霉素、链霉素、阿米卡星、四环素、替加环素、氯霉素、萘啶酸、环丙沙星、复方新诺明、多粘菌素E)敏感,均携带bla_(CARB-22)基因。PFGE结果显示,4株菌带型完全一致,同源性为100%。WGS分析结果显示,4株菌属ST3序列型、CC3克隆群,为同一克隆。4株菌均携带大流行株标志基因tdh+、trh-、toxRS/new和orf8。结论 O10:K4型副溶血弧菌可引起食物中毒暴发,其致病性强,有产生耐药性和成为大流行株的可能。应进一步加强监测和分析,加强预防宣传和规范临床用药。; 张志敏王兆娥张晓嫒张玲余红封会茹刘晓玲尉秀霞张建军; 关键词：副溶血弧菌 PFGE WGS

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王兆娥

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