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田炳均: 作品数：90 被引量：196H指数：8; 供职机构：云南省疾病预防控制中心更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家科技重大专项艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>; 相关领域：医药卫生农业科学更多>>

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2018-2021年云南省手足口病病例柯萨奇病毒A4型流行株基因特征: 2022年; 目的分析云南省手足口病(Hand, foot and mouth disease, HFMD)病例柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CVA4)分离株基因特征。方法在云南省7个市州采集2018-2021年HFMD病例粪便标本,进行肠道病毒RNA提取、VP1区基因扩增、序列测定和基因型别鉴定;构建CVA4分离株与基因库中参考株系统进化树,分析核苷酸和氨基酸相似性。结果从28 565例HFMD病例粪便标本中获得13株CVA4,其中2018年1株、2019年1株、2020年6株、2021年5株;C2基因亚型11株、C4基因亚型2株。C4和C2基因亚型之间核苷酸、氨基酸平均相似性分别为85.77%、93.27%;与原型株HighPoint相比,C2基因亚型核苷酸、氨基酸平均相似性分别为84.51%、93.27%,C4基因亚型分别为84.44%、93.78%。结论 2018-2021年云南省HFMD病例CVA4的优势流行株为C2基因亚型;需继续加强CVA4分子流行病学监测。; 杨溪姜黎黎周晓芳寸建萍罗春蕊张勇伏晓庆田炳均; 关键词：手足口病肠道病毒基因特征

云南省2005年急性弛缓性麻痹病例中非脊髓灰质炎肠道病毒的分子分型被引量：3: 2015年; 目的描述云南省2005年急性弛缓性麻痹（acute flaccid paralysis,AFP）病例中非脊髓灰质炎肠道病毒（non-polio enterovirus,NPEV）的带毒情况和新发现的新型肠道病毒90型（newer enterovirus 90,EV90）的基因特征。方法 2005年云南省共报告232例AFP病例,共采集到〈15岁AFP病例222例的双份便标本。对222例AFP标本进行病毒分离,对分离到的NPEV进行VP1基因序列测定。用MEGA5.0软件进行进化树分析和作图。进化树用临位相接法（neighbor joining method）作成,所用模式为Kimura二参数置换法（Kimura 2-parameter substitution model）。用1 000个pseudoreplicate datasets进行进化树bootstrap统计学分析。结果 222例患者中共检测脊髓灰质炎病毒（poliovirus,PV）10株（10/222,4.5%）,均为疫苗株,未发现脊髓灰质炎病毒野病毒（wild poliovirus,WPV）;检测到NPEV17株（17/222,7.7%）,其中4株为人类肠道病毒A组（4个血清型,其中1株为新型病毒EV90）,云南株EV90与山东3株之间的核苷酸（nt）同源性为95.7%～96.5%（差异率为3.5%～4.3%）,氨基酸（aa）同源性为98.5%～99.5%（差异率为0.5%～1.5%）,说明云南株更接近山东株03446-SD-CHN-2003（GQ253428）,两地毒株差异不大。12株为人类肠道病毒B组（9个血清型）,1株为人类肠道病毒C组（1个血清型,为新型病毒EV96）,未分离到人类肠道病毒D组病毒。结论 2005年云南省AFP病例中NPEV携带率与往年持平。新型病毒EV90基因进化分析结果表明EV90病毒存在基因多样性特点。; 赵智娴丁峥嵘田炳均张杰汤晶晶; 关键词：急性弛缓性麻痹非脊髓灰质炎肠道病毒基因特征分析

2019年云南省文山州柯萨奇病毒A16型的基因特征被引量：3: 2020年; 目的对云南省文山州2019年手足口病(hand,foot and mouth disease,hfmd)病原分离情况和14株柯萨奇病毒a16型(coxsackievirus a16,cv-a16)的基因特征进行分析。方法对文山州2019年hfmd实验室送到云南省疾病预防控制中心hfmd实验室的595份手足口病患者粪便标本进行病毒分离,并对分离到的74株肠道病毒(enterovirus,ev)vp1区基因进行扩增和测序定型,对cv-a16病毒进行基因特征和分子流行病学分析。结果共从595份标本中分离到74株ev,ev分离率为12.44%(74/595),其中a组病毒(enterovirus species a,ev-a)72株,占97.30%(72/74),ev-b组病毒2株,占2.70%(2/74),未分离到ev-c和ev-d组病毒。ev-a组病毒中,cv-a6病毒最多,共44株,占ev-a组分离数的61.11%(44/72),cv-a16次之,共14株,占ev-a组病毒的19.44%(14/72),ev-a109株,占12.50%(9/72)。基因进化分析表明,14株cv-a16均为b1基因亚型(subgenotype b1)。它们分为2个不同的进化分支(b1a和b1b),其中8株为b1a,6株为b1b。结论2019年文山州hfmd病原以cv-a6组为主,cv-a16次之。cv-a16病毒b1a和b1b两个分支同时在文山州流行。; 张丽芬周雪花徐敏姜黎黎寸建萍周晓芳伏晓庆田炳均; 关键词：病原分析柯萨奇病毒A16 VP1基因基因特征分析

柯萨奇病毒B组3型的分子流行特征分析被引量：3: 2012年; 目的探讨已公布的不同国家不同时间分离的人类柯萨奇病毒B组3型(human coxsackievirus B3,CB3)VP1区基因特征和分子流行特点。方法在GenBank中用BLASTN软件搜索不同国家/地区、不同时间发表的CB3VP1区基因序列,共得到来自8个国家的92个可用序列,用MEGA软件计算不同毒株的核苷酸和氨基酸差异率,并构建系统进化树。结果 92株病毒可分为5个基因型(Genotype 1～5),基因型1由CB3原型株Nancy和3个法国株组成,基因型2由4株美国株组成,基因型3的地理分布最广,由德国、美国、罗马尼亚、法国、日本、荷兰、瑞典分离株组成,基因型4由5株中国台湾分离株组成,基因型5由中国山东株、云南株和台湾株组成,该基因型又分为A～E 5个亚型。不同毒株的核苷酸差异率为6.90%～24.64%(氨基酸差异率1.00%～10.20%),不同基因型之间的核苷酸差异率为15.91%～24.64%(氨基酸差异率4.02%～10.20%)。结论不同基因型/亚型可以在同一个地区流行很长时间,同一时间内不同的基因型/亚型又可在不同的地区流行,具有明显的时间和地域流行特点。; 赵智娴田炳均张杰汤晶晶丁峥嵘; 关键词：柯萨奇病毒B组3型基因分型分子进化

云南省1990～1997年脊髓灰质炎野病毒监测及应用研究被引量：4: 1999年; １９９０年后，云南省逐步开展了脊髓灰质炎（脊灰）病毒学监测，１９９９０～１９９７年共分离到“株脊灰病毒．对毒株进行了型内鉴定及核苷酸序列分析，并及时根据野毒监测结果开展了针对性的免疫活动。７年的监测及应用研究结果表明：（１）１９９０～１９９３年，云南省有脊灰Ⅰ型野病毒的广泛传播和循环；（２）１９９３年后所采取的常规免疫辅以强化免疫的干预措施具有明显的控制效果；（３）在我国首次监测到输人性脊灰野病毒病例．确定了云南省边境地区和周边地区已成为脊灰高危地区，是世界卫生组织西太平洋地区和中国今后工作的重点和难点；（４）必须加强边境地区的免疫和监测工作，同时还应加强地区间、国家间和大区间的合作与协调，才能确保全球消灭脊灰目标的实现．; 陆林徐闻马云鸿李杰丁峰嵘田炳均罗梅苏俭娉吴燕张皓明李杰; 关键词：脊髓灰质炎野病毒免疫儿童

云南省疫苗衍生脊髓灰质炎病毒全基因组序列遗传特征分析被引量：4: 2016年; 为了解云南省疫苗衍生脊髓灰质炎病毒(Vaccine-derived Poliovirus,VDPV)的基因组特征,对2010年及2012年监测到的4株VDPV进行全基因组序列测定。结果显示,2株Ⅱ型VDPV的基因组全长均为7439nt,与Sabin Ⅱ疫苗株全基因组核苷酸和氨基酸的序列同源性分别为95.4%和97.7%;2株I型VDPV基因组全长均为7441nt,与Sabin I疫苗株全基因组核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为93.9%和97.9%。减毒位点分析发现II型和I型VDPV毒株分别有两个(nt 481和nt 2909)和三个减毒位点(nt 480、nt 2795和nt 6203)发生了回复突变。VP1序列分析显示II型和I型VDPV毒株与相应Sabin株的变异分别为1%和2.3%,重组分析显示II型和I型VDPV的基因组结构分别为S2/S3和S1/S2/S1/S3,后者的重组次数高达3次,显示了重组的普遍性和复杂性,也表明了病毒在人体内复制和传播的持久性与重组的多样性成正相关。因此,从分子水平分析VDPV的特性,可掌握病毒的变异动态,为制定科学可行的VDPV控制策略提供理论依据。; 汤晶晶张杰李凯田炳均赵智娴丁峥嵘; 关键词：疫苗衍生脊髓灰质炎病毒基因特征

云南省1997-2010年新型肠道病毒监测研究被引量：4: 2013年; 目的对云南省1997-2010年分离的新型肠道病毒进行基因测序定型并对EV75、EV96的基因特征进行分析。方法按文献报道的方法对云南省1997-2010年急性迟缓性麻痹病例(AFP)及2007-2010年健康人群中分离的"不能定型的肠道病毒(untypable enteroviruses)"进行RT-PCR和VP1区测序定型。结果共检测到7种新型肠道病毒,计25株。其中,A组病毒1个血清型(EV76,2株),B组病毒5个血清型(EV73,3株;EV75,3株;EV80,2株;EV81,1株;EV83,3株),C组病毒1个血清型(EV96,11株)。7种新型肠道病毒中,EV96分离年份最广:在AFP病例中于1998年、1999年、2000年和2004年分离到,在健康人群中于2010年分离到。结论新型肠道病毒在云南省分布广泛,尤其以EV96型分离数最多,分离年份最广。EV75、EV96具有基因多样性特点,但新型肠道病毒与疾病的关系值得进一步研究。; 田炳均丁峥嵘车望军汤晶晶张杰文卫华赵智娴; 关键词：血清型

云南省肠道病毒96型的分子生物学鉴定被引量：6: 2007年; 目的对云南省9例急性弛缓性麻痹病例的阳性病毒分离物进行分子生物学定型。方法用肠道病毒(En-terovirus,EV)通用引物187、188、189/222扩增病毒VP1区,直接对聚合酶链反应产物进行测序。所得序列在基因库进行广泛搜索,并与所有EV(包括新发现的EV)基因的相同区域进行比较。结果9株病毒为EV96型。结论运用分子生物学方法可以检测出传统方法所无法鉴定的血清型,并能提供病毒遗传学信息。; 田炳均赵智娴张杰康文玉丁峥嵘

云南省健康儿童中1株肠道病毒新毒株EV—C99的分离及其基因特征分析被引量：2: 2018年; 目的对云南省2016年健康儿童中1株肠道病毒（enterovirus，EV）新毒株EV-C99进行分离并对其基因特征进行分析。方法按世界卫生组织（World Health Organization，WHO）推荐的方法对该名儿童的大便标本进行病毒分离，提取该病毒RNA并对其VP1区基因进行RT-PCR和基因测序，用Sequencher 5.0软件对序列进行编辑和拼接。所得序列在GenBank进行＂BLAST＂搜索，得到初步结果，再用MEGA5.2软件计算与原型株的核苷酸和氨基酸同源性，按目前肠道病毒测序定型标准确定病毒最终型别并进行基因特征分析。结果该病毒能被494/496和495/497引物扩增，经Sequencher 5.0软件拼接和编辑后得到约1 200 bp的序列，该序列在GenBank进行＂BLAST＂搜索，初步结果为新型肠道病毒EV-C99。与EV-C99病毒的原型株BAN00-10461（基因库编号：EF015008）对比分析后得到该病毒VP1区完整序列为909 bp，与原型株的核苷酸（nucleotide，nt）同源性（identity）为77.05%，氨基酸（amino acid，aa）同源性为90.04%，按肠道病毒测序定型标准，确定该病毒为EV-C99，是人类肠道病毒C组中的一种新型病毒。结论2016年云南省健康儿童肠道病毒带毒调查中分离到一株肠道病毒新毒株EV-C99，是国内第3次报道该病毒。基因进化分析表明，云南分离株与新疆分离株、山东分离株都为B基因型，但3个省的分离株位于不同的进化分支，该病毒具有基因多样性特点。; 张杰胡筱莛樊帆丁峥嵘田炳均; 关键词：健康儿童基因特征

云南省2012年边境地区健康儿童肠道病毒监测及基因特征分析被引量：1: 2013年; 目的了解2012年缅甸入境健康儿童和口岸中国籍健康儿童肠道病毒携带情况,并对所携带的病毒(ECHO19、CB1、EV71)基因特征进行分析。方法采集边境地区15岁以下健康儿童的粪便标本(单份便),对采集的粪便标本进行病毒分离和基因测序定型。结果 170份粪便标本中监测到非脊灰病毒(nonpolio virus,NPV)18株,NPV分离率为10.6%,18株NPV分别属于A组(5株)、B组(12株)、C组(1株),未分离到D组肠道病毒、脊灰病毒和新型肠道病毒。5株A组肠道病毒中包括1株CA4,2株CA8和2株EV71;12株B组肠道病毒中包括4株CB1,1株ECHO13,2株ECHO14,1株ECHO17,4株ECHO19;1株C组病毒为CA24。结论云南省2012年边境地区健康儿童中肠道病毒以B组病毒为主,CB1、ECHO19病毒在不同时期存在不同的传播链,EV71型的基因亚型与我国流行株同为C4a基因亚型。; 陈姝蒙丁峥嵘赵智娴罗梅田炳均汤晶晶张杰陆林; 关键词：肠道病毒基因型健康儿童

田炳均

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