田菲菲
- 作品数：37 被引量：81H指数：6
- 供职机构：重庆大学更多>>
- 发文基金：教育部“春晖计划”重庆市应用基础研究项目霍英东基金更多>>
- 相关领域：理学医药卫生生物学化学工程更多>>
- 一种治疗高致病性禽流感病毒H5N1引发疾病的多肽疫苗
- 一种治疗高致病性禽流感病毒H5N1引发疾病的多肽疫苗，其特征在于它的氨基酸序列为：氨基端－QIGNISIWV－羧基端；以赖氨酸为接头，将多个该氨基酸序列组成多拷贝的串联结构。本发明具有便于运输保存和自动化批量生产的优点，...
- 吕凤林田菲菲梅虎张一李元朝
- 文献传递
- 原子电性作用矢量用于吡喃糖化学位移计算被引量：1
- 2006年
- 从分子二维拓扑结构出发,借助原子电性作用矢量(AEIV)描述原子所处分子微观化学环境,对54种吡喃单糖中共338个等价共振碳原子进行表征并以此建立起用于模拟单糖分子13CNMR化学位移三参数多元线性回归方程,所得模型复相关系数为Rcum=0.9696.为检验该模型对外部样本集预测能力,采用留一法(LOO)作交互校验(CV)检测,其复相关系数为Qcum=0.9687.
- 田菲菲李志良张巧霞覃仁辉周原周鹏
- 关键词：寡聚糖原子电性作用矢量多元线性回归
- 细胞毒性T淋巴细胞生物杀伤效应的检测方法被引量：3
- 2008年
- 王政田菲菲刘丁吕凤林
- 关键词：细胞毒性T淋巴细胞自身免疫性疾病抗感染免疫抗肿瘤免疫免疫效应细胞介导
- 甲状腺激素受体配体化合物的定量构效关系(QSAR)研究被引量：1
- 2008年
- 研究了68个TR(Thyroid Hormone Receptor,甲状腺激素受体)配体化合物的化学结构与活性的定量构效关系.采用实验室新近提出的三维原子场全息相互作用矢量,对化合物进行了结构参数化表达,采用逐步回归对变量进行筛选后,建立了定量构效关系模型.复相关系数和交互检验复相关系数R2=0.767,Q2=0.625(TRα),R2=0.734,Q2=0.61(TRβ).模型具有良好的稳定性和预测能力,证明了该三维原子场全息相互作用矢量在分子结构表征和生物活性预测上的适用性,并可应用于潜在和新型的TR配体化合物的设计和开发.
- 杨善彬梁桂兆潘元舒茂许罗南杨青林陈国华孙家英田菲菲李志良
- 一种猪繁殖与呼吸综合症病毒体疫苗及其制备方法
- 一种猪繁殖与呼吸综合症病毒体疫苗及其制备方法，涉及生物医药领域，特别涉及一种具有猪繁殖与呼吸病毒完整表面抗原的病毒体(Virosome)疫苗及其制备方法。本发明公开了一种猪繁殖与呼吸综合症病毒体疫苗，主要包括PRRSVi...
- 吕凤林曹政田菲菲杨力
- 文献传递
- 定量谱效关系的研究与应用
- 定量构效关系(quantitative structure-activity relationship QSAR)作为药物设计研究中的一个重要计算方法和常用手段，在新药的开发和研制过程中占据了重要位置。近半个世纪以来，Q...
- 田菲菲
- 关键词：分析化学定量构效关系离子迁移谱
- 文献传递
- 一种基于遗传算法的肽/蛋白质结合模式虚拟筛选建模技术被引量：4
- 2006年
- “合理”QSAR模型是指在了解配体与受体相互作用模式的前提下建立定量构效关系,这样避开了传统做法仅仅依靠样本集分子自身信息来构建预测模型的诸多弊端.本文将此思想应用于肽/蛋白质亲和活性的研究当中,借助于遗传算法作为虚拟受体结合靶点及相互作用模式的筛选手段得到了一种新的建模技术:肽/蛋白质结合模式遗传虚拟筛选(geneticvirtualscreeningofcombinativemodeforpeptide/protein,GVSC).该法成功解决了“合理”QSAR研究中的难题,即大多数情况下受体结构未知而难以了解配基与之发生的结合方式.分别使用58个血管紧张素转化酶,18个Camel抗体蛋白cAb-lys3双位点突变残基对GVSC加以检验,其结果表明GVSC能够较好地阐明配基与受体之间的作用机理,并能得到优于传统方法的QSAR模型.
- 周鹏田菲菲李波吴世容李志良
- 关键词：定量构效关系遗传算法偏最小二乘回归
- 一种基于三维原子场相互作用矢量的新型氨基酸结构信息描述子被引量：8
- 2006年
- 从分子的三维空间结构出发,按照不同类型原子之间静电和立体作用得到一种新的分子结构表达方法——三维原子场相互作用矢量(3D-VAIF).利用该矢量对20种天然氨基酸空间结构性质进行计算,通过主成分分析获得单个氨基酸的特征描述子——氨基酸结构信息得分(SSIA).分别使用58个血管紧张素转化酶抑制剂、48个苦味二肽以及31个缓激肽对SSIA的性能进行了测试,所得模型的复相关系数R2cum和交互检验复相关系数Q2LOO分别为0.789,0.773;0.856,0.837和0.838,0.815.结果表明将SSIA用于肽类似物定量序列活性建模(定量序效建模,QSAM)效果优于传统氨基酸描述子.
- 周鹏周原吴世容李波田菲菲李志良
- 关键词：定量构效关系量子化学计算
- 一种治疗人乳头瘤病毒18型引发的肿瘤的多肽药物
- 一种治疗人乳头瘤病毒18型引发的肿瘤的多肽药物，涉及一种生物医学领域，特别是一种关于人乳头瘤病毒18型引发的肿瘤的多肽药物。其特征在于它的氨基酸序列为：氨基-VAWDSVYYM-羧基，利用赖氨酸具有两个氨基、一个羧基的特...
- 吕凤林田菲菲杨力
- 文献传递
- 基于定量序效模型的计算机辅助虚拟疫苗库设计
- 2006年
- 给出了基于定量序效模型(QSAM)的计算机辅助虚拟疫苗库设计方案,并以此为基础成功组建了一个合理规模的HLA-A*0201限制性CTL表位库,其实现流程如下:(1)从天然氨基酸516种理化性质经主成分分析(PCA)得到一种新的氨基酸描述子:氨基酸综合性质得分(SP-score);(2)基于SP-score结合遗传-偏最小二乘(GA-PLS)技术建立QSAM模型;(3)利用QSAM模型作为评价工具采用遗传算法(GA)优化CTL表位种群;(4)统计优秀种群中20种氨基酸分别在抗原肽序列不同位置出现频率f;(5)保留f>F(F为平均出现概率,对于任意氨基酸为1/20)的氨基酸作为该位置的有利残基类型参与虚拟组合库的构建.
- 周鹏李志良田菲菲张梦军
- 关键词：CTL表位遗传算法
