邱峰芳
- 作品数：20 被引量：140H指数：6
- 供职机构：东华理工大学化学生物与材料科学学院更多>>
- 发文基金：江西省自然科学基金国家自然科学基金国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学文化科学环境科学与工程生物学更多>>
- 白耳黄鸡三叉冠性状分析
- 2022年
- 【目的】对白耳黄鸡三叉冠性状进行分析,以期寻找与三叉冠性状相关的候选单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms, SNP)位点。【方法】60只白耳黄鸡用于杂交试验,120只白耳黄鸡用于受精率试验。对82只白耳黄鸡采集血样抽提DNA,用Illumina鸡60 k芯片进行基因型分型,利用PLINK 1.90对分型结果进行质控后,采用GEMMA软件对SNP与性状进行全基因组关联分析(Genome-wide Association Analysis,GWAS),寻找与白耳黄鸡三叉冠性状显著相关的SNP位点。【结果】白耳黄鸡三叉冠呈现常染色体遗传,其种蛋受精率与单冠的白耳黄鸡差异不显著。由82只白耳黄鸡群体得到55 023个有效SNP,群体内不存在明显的群体分层。与三叉冠相关的SNP位点有10个,分别位于第1、2、3、4、5、12、14号染色体上,邻近或座落于SPRY2、NDFIP2、ITGA9、EMC2、TMEM17、EHBP1、SCAF8、TIAM2、HTT、STON2、PRKCD、RBBP6、TNRC6A、MAPK8IP3基因上。【结论】通过GWAS分析发现10个SNP位点可能与白耳黄鸡三叉冠性状相关。研究结果将为白耳黄鸡的育种提供候选分子标记,为地方鸡标记辅助选择提供新的思路。
- 张文武邱峰芳许继国
- 关键词：全基因组关联分析单核苷酸多态性种蛋受精率
- 农田土壤多环芳烃污染的微生物修复试验被引量：2
- 2019年
- 从江西省南昌市南昌县鄱阳湖畔某农田采集土样,用浓度大于95%的PAHs试剂菲、蒽和苯并菲等作为唯一碳源配制培养基,从土样中筛选到一株PAHs高效降解菌,经鉴定认为该菌属于荧光假单胞菌。将该菌接种于PAHs初始浓度为20 mg/kg的培养瓶内,培养60 d后,培养瓶土壤中的PAHs基本被降解;将该菌接种于PAHs污染的农田土壤,120 d后土壤中PAHs降解率大于90%。
- 金卫根陈传红邱峰芳李靖嫄
- 关键词：农田土壤多环芳烃降解菌微生物修复
- 化学农药在土壤中的迁移转化被引量：7
- 2008年
- 阐述了化学农药在土壤中的迁移转化规律,对于预测其变化趋势和控制农药环境污染具有重大意义。
- 吴瑞娟金卫根邱峰芳
- 关键词：化学农药土壤
- 鸡PIT-1基因57 bp插入/缺失多态与生长和屠体性状的相关研究被引量：18
- 2006年
- 垂体特意性转录因子(P itu itary-spec ific transcription factor 1,PIT-1)是重要的组织特异性转录因子,能够调控生长激素(GH)、促甲状腺素β亚单位(TSHβ)和催乳素(PRL)基因的表达,从而在生长发育中发挥重要调节作用。本实验选取鸡PIT-1基因第2内含子的57 bp缺失/插入位点为分子标记,利用华南农业大学“杏花×隐性白洛克”全同胞鸡参考家系材料,研究了该位点与鸡生长和屠体性状的相关性。结果表明,该位点与鸡的第1-7周龄体重相关极显著(P<0.01),与第8周龄体重相关显著(P<0.05),与胸角宽、全净膛、半净膛、翅膀重、胫爪重、小肠长度相关极显著(P<0.01),与胸肉重、腿肉重相关显著(P<0.05);其中A基因(57 bp插入)有利于体重增加和肌肉生长。
- 邱峰芳聂庆华金卫根欧阳建华林树茂孙汉张细权
- 关键词：PIT-1基因
- 120日龄文昌鸡RNA-Seq基因结构及SNP分析被引量：2
- 2019年
- 为了深入挖掘文昌鸡RNA-Seq数据,进一步完善文昌鸡基因组的注释信息,试验采用生物信息学的方法对120日龄文昌鸡的高质量序列(Clean data)数据进行单核苷酸多态性(SNP)的查找、可变剪接(AS)筛查、基因结构优化和新转录本预测。结果共得到78 564个可靠的SNP位点,22 227个可变剪接,优化基因9 546个,预测新转录本593个。研究结果为文昌鸡分子育种提供了新的靶点。
- 顾丽红李金明张细权邱峰芳邢增杨林哲敏
- 关键词：文昌鸡可变剪接
- 180日龄文昌鸡和隐性白羽克洛鸡基因结构及SNP分析被引量：4
- 2019年
- 采用生物信息学的方法对180日龄文昌鸡和隐性白羽克洛鸡RNA-Seq的94 614 632的Clean Reads进行了单核苷酸多态性(SNP)的查找、可变剪接筛查、基因结构优化和新转录本预测。结果共得到可靠的SNP位点220 308个,可变剪接56 119个,优化了21 633个基因,预测到1 235个新转录本。本研究结果能够进一步完善鸡基因组注释情况并丰富鸡SNP数据库和可变剪切数据库。
- 顾丽红刘志勇张细权邱峰芳邢增杨赵建国林哲敏
- 关键词：文昌鸡可变剪接
- 白耳黄鸡冠齿数性状全基因组关联分析被引量：2
- 2022年
- 试验采用全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)寻找与白耳黄鸡冠齿数性状相关的候选基因。以82只白耳黄鸡为试验材料,采集血液提取DNA,然后用Illumina鸡60 K芯片进行基因型分型,利用PLINK 1.90对分型结果进行质控后,采用GEMMA软件对SNPs(Single nucleotide polymorphisins)与性状做GWAS分析,定位出显著位点。结果显示:与冠齿数相关的SNP位点有7个,位于白耳黄鸡1、2、4号染色体上。通过基因功能注释,预测WNT9A基因可作为白耳黄鸡冠齿数的重要候选基因。研究结果将为白耳黄鸡冠齿数的选择提供候选分子标记,为地方鸡标记辅助选择提供新的思路。
- 张文武邱峰芳刘影许继国
- 关键词：全基因组关联分析白耳黄鸡单核苷酸多态性
- 宁都黄鸡冠齿数与生产性能的关系分析被引量：2
- 2019年
- 为了探讨宁都黄鸡冠齿数是否能辅助鸡育种,试验以485只宁都黄鸡为研究对象,分析了0~16周龄不同鸡冠齿数与生产性能的关系。结果表明:在0~16周龄时,冠齿数多的鸡体重与冠齿数少的鸡间存在显著差异(P<0.05);在4,6,8,10,12,14,16周龄时,冠齿数多的鸡冠高、冠长、冠厚和胫长与冠齿数少的鸡间存在显著差异(P<0.05);在4,6,8,16周龄时,冠齿数多的鸡胫围与冠齿数少的鸡间存在显著差异(P<0.05);在10,12,14,16周龄时,冠齿数多的鸡肉垂长和肉垂厚与冠齿数少的鸡间存在显著差异(P<0.05);在16周龄时,冠齿数多的鸡胸深、龙骨长、屠体重、半净膛重、全净膛重、胸肌重和腿肌重均与冠齿数少的鸡间存在显著差异(P<0.05)。宁都黄鸡冠齿数与4,6,8,10,12,14,16周龄的冠高、冠长、冠厚和胫长以及0~16周龄的体重关联紧密,说明宁都黄鸡冠齿数能辅助育种。
- 张文武邱峰芳王芝芬朱学农谭玉文王远彬周敏
- 关键词：宁都黄鸡辅助育种周龄
- 土壤重金属污染的生物修复被引量：33
- 2008年
- 阐述了土壤重金属污染的来源及危害,综述了生物修复土壤重金属污染的机理及技术。
- 吴瑞娟金卫根邱峰芳
- 关键词：土壤重金属污染生物修复
- 鸡胰岛素样生长因子-1基因的遗传多态性与其体重的关系被引量：35
- 2003年
- 对宁都三黄鸡、万载康乐黄鸡两个鸡种共295个样本,采用PCR RFLP技术对胰岛素样生长因子—1(cIGF 1)基因的5'端调控区进行遗传变异研究,发现该调控区的扩增产物经PstⅠ酶切后出现3种基因型(AA、AB、BB)。结果表明:性别对宁都三黄鸡这3种基因型的分布呈现显著差异(P<0 05)。分析这3种基因型与其体重的关系发现,这3种基因型对初生重、30日龄体重、60日龄体重、90日龄体重及120日龄体重影响差异均不显著(P>0 05),但体现出AA型有较高体重的趋势,公母表现出一致的规律。在万载康乐黄鸡中,均呈现出杂合优势,在8周龄及18周龄时差异不显著(P>0 05),而在12周龄表现为差异显著(P<0 05)。宁都三黄鸡公母基因型分布均符合哈代 温格伯定律,而万载康乐黄鸡基因型分布不符合哈代 温格伯定律。
- 欧阳建华孙汉李海华邱峰芳柳小春施启顺王文君林树茂
- 关键词：胰岛素样生长因子-1遗传多态性体重万载康乐黄鸡调控区
