陈玉如
- 作品数：14 被引量：14H指数：3
- 供职机构：贵阳医学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金贵州省社会发展科技攻关计划项目贵州省国际科技合作计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学更多>>
- 新生隐球菌毒力差异基因型菌株间部分毒力相关基因分析被引量：1
- 2014年
- 目的：了解新生隐球菌格鲁比变种（ Cryptococcus neoformans var． grubii）两组毒力差异明显的多位点微卫星型（ multilocus microsatellite typing ， MLMT ）菌株间的差异基因，探讨导致新生隐球菌格鲁比变种间毒力差异的相关基因及这些基因的功能。方法根据已有基因组数据，针对可能为新生隐球菌毒力相关的基因设计特异性引物，扩增并测序，通过序列对比分析每个基因在两组微卫星基因型菌株间存在的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms ，SNPs）位点，并对引起差异的蛋白质进行分析和预测。结果在成功测序的11个基因中，除2个基因序列完全相同外，其余9个基因在两组毒力差异明显的基因型菌株间分别存在1～4个规律性SNPs，其中，有2个基因中存在非同义SNPs（ non-synonymous SNPs ，nsSNPs ），这2个基因的编码产物分别为沉默信息调节因子2家族成员HST302和UV切除修复蛋白RAD23。另外，在对RAD23蛋白的系统发育分析发现，与真菌界的其他门类相比，在担子菌纲的多数RAD23蛋白与人类的同源基因亲缘关系更近。结论本研究发现了新生隐球菌两种毒力差异明显的微卫星基因型菌株间具有重要功能的两个差异基因（ Rad23和Hst302），且经预测nsSNPs对蛋白结构和功能均有一定影响，而蛋白的具体功能有待通过各项试验进一步深入研究。
- 陈玉如赵亮金方李小玲曹煜康颖倩
- 关键词：毒力
- 贵州及广西地区临床新生隐球菌微卫星分型研究被引量：1
- 2013年
- 新生隐球菌（Cryptococcus neoformans）是临床上重要的致病真菌，主要可导致艾滋病、器官移植等免疫抑制患者发生新生隐球菌病。本文采用多位点微卫星基因分型法（MLMT）对贵州及广西地区的新生隐球菌临床株进行分析，同时对不同微卫星型的菌株进行了药物敏感性的比较，以帮助临床上深入认识新生隐球菌的流行病学及发病机制。
- 康颖倩赵亮唐秀文王梅竹曹煜陈玉如金方李小玲牟丽丽
- 关键词：新生隐球菌基因分型法微卫星药物敏感性致病真菌
- 新生隐球菌毒力相关基因的重测序筛选及基因敲除实验研究
- 本研究主要探讨可用于筛选引起新生隐球菌格鲁比变种(Cryptococcus neoformans var.grubii.)毒力差异相关基因的有效方法策略,并从中筛选和验证与毒力相关的差异基因。实验中筛选了毒力差异明显的两...
- 陈玉如赵亮金方牟丽丽刘涛华吕倩王颜颜康颖倩
- 关键词：新生隐球菌毒力基因基因敲除
- 文献传递
- 贵州贵阳及广西柳州地区新生隐球菌临床株微卫星基因分型对比研究
- 目的：了解贵阳及柳州地区新生隐球菌临床株的种群分布特点及多位点微卫星基因分型(multilocus microsatellite typing,MLMT)规律,探讨微卫星分型与新生隐球菌流行分布的相关性。方法：从贵州贵阳...
- 赵亮唐秀文康颖倩罗红梅金方王梅竹陈玉如
- 新生隐球菌毒力相关基因的重测序筛选及基因敲除实验研究
- 本研究主要探讨可用于筛选引起新生隐球菌格鲁比变种(Cryptococcus neoformans var.grubii.)毒力差异相关基因的有效方法策略,并从中筛选和验证与毒力相关的差异基因。实验中筛选了毒力差异明显的两...
- 陈玉如赵亮金方牟丽丽刘涛华吕倩王颜颜康颖倩
- 关键词：新生隐球菌毒力基因基因敲除
- 新生隐球菌格鲁比变种表型变异菌株的基因及毒力对比研究被引量：1
- 2012年
- 新牛隐球阕（Cryptococcus neofor-mans）属于真菌界担子菌门隐球菌属，是临床上的致病真菌，可致器官移植等免疫抑制患者发生新生隐球菌病。
- 赵亮王梅竹曹煜贺娟金方陈玉如苑天红罗红梅康颖倩
- 关键词：毒力基因表型变种致病真菌隐球菌属
- 中国南方地区马尔尼菲青霉分子流行病学初步研究被引量：3
- 2014年
- 目的分离及鉴定贵州、广西、广东各地临床分离的马尔尼菲青霉(Penicillium marneffei,PM),通过微卫星基因多态性分析进行分子流行病学初步研究。方法从贵州、广西、广东地区临床病人标本中分离马尔尼菲青霉,通过形态学及ITS序列进行鉴定,运用多位点微卫星分型法(multilocus microsatellite typing,MLMT)和SPSS18.0软件对分离的马尔尼菲青霉进行基因多态性及其相关性分析。结果贵州、广西和广东共收集鉴定马尔尼菲青霉临床株50株,3个微卫星位点PMMI、PMMII、PMMIII分别检测到29、9和8种等位基因,50株菌共分为47个微卫星型(PMMT);聚类分析将贵州及广西、广东地区马尔尼菲青霉分为6大类(Cluster1-Cluster 6)。结论贵州、广西、广东地区的马尔尼菲青霉具有较高的基因多态性,我国南方地区相邻省份马尔尼菲青霉的种群基因结构与地域分布之间存在着一定的相关性。
- 赵亮唐秀文王梅竹曹煜牟丽丽金方李小玲陈玉如康颖倩
- 关键词：马尔尼菲青霉菌分子流行病学
- 放线菌16S rDNA片段扩增方法的优化被引量：5
- 2014年
- 目的通过对放线菌PCR扩增方法的综合改进,找到某些用常规手段难扩增的放线菌16SrDNA的最佳PCR扩增条件。方法 (1)提取放线菌基因组DNA并对其进行PCR扩增以找到最适退火温度;(2)改变PCR反应体系中模板DNA和Mg2+的浓度;(3)在反应体系中加入适量的二甲基亚砜。结果在25μL的PCR反应体系中,模板DNA浓度为10×、加入0.5μL的Mg2+和5%的二甲基亚枫、退火温度为59℃时对放线菌16SrDNA扩增效果最为理想。结论本实验研究出一种扩增放线菌16SrDNA的优化条件,为今后大批量的放线菌的分子生物学研究提供了更加高效、方便、快捷、经济的实验方法。
- 金方陈玉如王颜颜康颖倩
- 关键词：聚合酶链式反应RDNA放线菌
- 贵州省土壤中需氧放线菌的分离鉴定及其抗菌活性的测定
- 目的:分离并鉴定贵州地区土壤中的需氧放线菌,了解其种群分布特点及抗菌活性。方法1:采集贵州不同地区的土壤标本进行需氧放线菌的分离纯化,通过菌株的形态、生理生化特征及16s rDNA对其进行鉴定2:利用纸片法测定菌株发酵液...
- 金方牟丽丽王颜颜刘涛华吕倩陈玉如康颖倩
- 关键词：土壤放线菌抗菌活性链霉菌
- 不同毒力差异基因型的新生隐球菌MLST分型及交配型鉴定研究被引量：2
- 2014年
- 目的了解及比较两组毒力差异明显的新生隐球菌格鲁比变种的多位点序列分型(MLST)的特点并进行交配型鉴定。方法采用多位点序列分型(MLST)的方法,设计7个看家基因(CAP59,GPD1,LAC1,PLB1,SOD1,URA5和IGS1)的引物,扩增并分析来源分别为环境和临床的各10株新生隐球菌格鲁比变种的基因型,并鉴定实验菌株交配型,与多位点微卫星分型(MLMT)结果对比,比较不同基因分型方法在分类中的稳定性和可靠性。结果在微卫星分型中为MLMT-36的10株环境分离株,MLST分型为ST-15,而在微卫星分型中为MLMT-13型的10株临床分离株,MLST分型为ST-32,所有菌株交配型均为MAT-α。结论 MLST分型结果与MLMT分型结果高度一致,提示以上两种分子分型技术在真菌分类鉴定研究中可显示对于其分离背景及进化来源的高分辨率及稳定性。
- 康颖倩陈玉如王梅竹赵亮李小玲金方刘涛华
- 关键词：新生隐球菌
