高晓莲 作品数:7 被引量:21 H指数:1 供职机构: 休斯敦大学 更多>> 发文基金: 国家留学基金 浙江省“钱江人才计划” 浙江省自然科学基金 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 更多>>
基于SYBR Green I的双链DNA定量方法 被引量:21 2008年 基于SYBR Green Ⅰ荧光染料与双链DNA(dsDNA)结合产生荧光的原理,建立一种高精度、高通量的双链DNA定量方法。将梯度稀释后的基因组DNA及已知浓度的λDNA与等体积的SYBR Green Ⅰ(4×)充分混合后,利用荧光定量PCR仪采集荧光信号,以ROX(1×)作为校正染料进行定量分析;同时利用紫外分光光度计对样品进行平行测定,比较该方法与紫外分光光度法的检测限与准确度。紫外分光光度法的检测限为2ng/μl,而SYBR Green Ⅰ荧光定量法的检测限可达到0.015ng/μl,并且在0.015-2ng/μl范围内,SYBR Green Ⅰ荧光强度与λDNA浓度呈线性关系(R2=0.9999),比紫外分光光度法灵敏100倍以上,并可准确定量低纯度的DNA样品。此方法具有重复性好、高通量的特点,仅需少量的生物样本即可满足定量要求,为分子生物学研究及临床检验等多个领域提供了一种可靠的dsDNA定量方法。 刘歆 徐根明 郭江峰 丁先锋 高晓莲关键词:SYBR 双链DNA 基因组DNA DNA阵列芯片上的DNA二聚体并行热力学研究及其在SNP基因分析中的应用 本文根据DNA二聚体的热力学性质,在DNA阵列芯片上测定其解链曲线,用数学的方法获得它的Tm(解链温度值),根据Tm值的不同来进行SNP分析。结果表明,用特殊设计的寡聚DNA阵列芯片进行并行热力学研究,可测得其DNA二聚... 李征 高晓莲关键词:基因芯片 基因检测 基因分析 文献传递 一种利用原位合成微流体芯片的检测方法 本发明公开了一种利用原位合成微流体芯片的检测方法,包括以下步骤:1)利用现有模式植物上公开报道的非编码小RNA的序列,优选miRNA的序列信息,依据其正义链或其负义链序列设计互补的寡核苷酸杂交探针;2)用原位合成方法制备... 陈集双 尹雪鸿 竺锡武 朗秋蕾 高晓莲 杨文征 杜志游文献传递 SHP-2蛋白NSH2结构域的原核表达和同位素标记 2010年 SHP-2蛋白是一种含有两个SH2结构域的磷酸酶。SHP-2的N端SH2结构域是细胞因子或病毒因子激活该蛋白的分子内靶点。对shp2基因进行信息学分析,设计引物通过PCR克隆出人SHP-2蛋白N端SH2结构域(NSH2)的DNA序列。重组到原核表达载体pGEX-2T中,在大肠杆菌BL21(DE3)中成功高效率表达了可溶性NSH2蛋白。对蛋白进行15N同位素标记和纯化,并浓缩获得达到进行核磁滴定法结构研究的蛋白样品。 牛皋 郭江峰 高晓莲 张耀洲关键词:SHP-2 SH2结构域 同位素标记 HSQC SH2域S、HP2 cDNA的克隆鉴定和在大肠杆菌中的表达及其与CagA的相互作用 2005年 目的研究SH2(Src同源体2)域和SHP2(含2个SH2域的蛋白酪氨酸磷酸酶)蛋白的基因克隆和表达。方法根据GeneBank中SH2和SHP2的基因序列设计引物,以PCR法扩增出SH2和SHP2基因,将其插入pQE30质粒中,转化进E.coli感受态细胞中,筛选阳性克隆并研究其表达。结果所克隆的目的基因片断经PCR法鉴定和序列分析证明正确。结论已成功地扩增SH2和SHP2基因并克隆到pQE30载体上,转化大肠杆菌菌株有表达,并探讨其与CagA(细胞毒性关联的基因A抗原)的相互作用及导致胃细胞癌变的原因。 李征 盛妮晶 高晓莲关键词:SH2 克隆 CAGA 相互作用 DNA阵列芯片上的DNA二聚体并行热力学研究及其在SNP基因分析中的应用 2005年 目的用DNA阵列芯片进行SNP的探测。方法根据DNA二聚体的热力学性质,在DNA阵列芯片上测定其解链曲线,用数学的方法获得其解链温度(Tm)值,再根据Tm值进行SNP分析。结果用特殊设计的寡聚DNA阵列芯片进行并行热力学研究,测得其DNA二聚体的解链曲线,计算出Tm值,并进行了SNP分析。结论可用DNA阵列芯片成功地进行高通量的SNP基因分析。 李征 朱兵 高晓莲关键词:DNA SNP分析 热力学研究 SH2域和SHP2 cDNA的克隆、鉴定及其在大肠杆菌中的表达研究 研究SH2域和SHP2蛋白的基因克隆和表达.根据GenBank中SH2和SHP2的基因序列设计引物,以PCR法扩增出SH2和SHP2基因,将其插入pQE30质粒中,转化进E.coli感受态细胞中,筛选阳性克隆并研究其表达... 李征 盛妮晶 高晓莲关键词:SH2 大肠杆菌 基因克隆 文献传递